; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0001460 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0001460
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationchr04:9850040..9861359
RNA-Seq ExpressionPI0001460
SyntenyPI0001460
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141121.1 rhomboid-like protein 20 [Cucumis sativus]1.4e-15398.63Show/hide
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XP_023516629.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.8e-14894.5Show/hide
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XP_038904170.1 rhomboid-like protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]8.5e-15197.25Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein6.8e-15498.63Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 209.8e-15397.94Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 209.8e-15397.94Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 204.3e-14894.52Show/hide
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A0A6J1EXA3 rhomboid-like protein 201.2e-14794.16Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 26.1e-1926.24Show/hide
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        G SG   AP++++ ++  +  ++   +     +    Y    VK   +IW+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S + S L
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        F+ L +  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FFS    P  S+  P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P+ P
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           E SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 22.8e-1926.1Show/hide
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        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   +IW+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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        F++L +   +       N + SG  G +FA FVPF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  + G+++G  Y  ++  + +   
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Query:  FPEFISSFFSRLSLPSAGNPPAAPNRDVRGNMPS-----------FMSRQV------------------------------------ERNYPS---VPTA
         P +++  FS    P   +  A P  ++R  M +            + RQ+                                    + ++PS    P  
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Query:  TEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLE
        TE SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.5e-1726.53Show/hide
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        G SG   AP++++ ++  +  ++   +     +    Y    VK   +IW+L+          +      L+Y FR+FER+ GS K++ F+L S + S L
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Query:  FEVLAISLLK----DPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFG-VRFSDKSFIYLAGLQLLLSS---WRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIR
        F+ L I  ++      AA+ + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  I G+++G  Y   +F + 
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Query:  KAK-FPEFISSFFSRLSLP--SAGNPPAAP---------------------------------NRDVRGNM-------PSFMSRQ------VERNYPSVP
        +    P +++ FFS    P  S+  P +                                    R  +G M       P    RQ        ++ P+ P
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           E SE+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 184.9e-10970.55Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K RIWKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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Query:  ISSFFSRLSLPSAGNPPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQSH
        ++S FSR SLPS  +    P R      P+ + RQ  R Y + +P+ TEPSE+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 209.2e-12476.79Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K RIWKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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Query:  ISSFFSRLSLPSAGN-PPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQSH
        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R+ ER+ P+ +P++ EPSE+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein3.5e-11070.55Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K RIWKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP ANL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  GICGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSR SLPS  +    P R      P+ + RQ  R Y + +P+ TEPSE+AIATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein6.5e-12576.79Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K RIWKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD  ANL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PGICGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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Query:  ISSFFSRLSLPSAGN-PPAAPNRDVRGNMPSFMSRQVERNYPS-VPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQSH
        ++SFFSRLS PS GN PP AP+R++ G +     R+ ER+ P+ +P++ EPSE+AI TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACGGCGGCCCCTCCGGTTTCAACAATGCCCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCT
TGGTTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTCCGAATCTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTTGGACTGTTTCTGCTAT
ATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTGTTCTCTATAATTACCTCATTACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCACTACTT
AAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTTTGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGG
AGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTTCGTGGAGAAGATCTATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCT
TATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCATTTTTTTCAAGACTTTCTTTGCCTTCTGCGGGTAATCCTCCAGCAGCCCCA
AATAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATCCTTCTGTGCCAACTGCCACAGAACCATCAGAAGATGCCATTGCTACACT
TGTTTCAATGGGATTCGATAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAGGCCAGAAACGACGTTAACATTGCAACAAACATACTTCTTGAATCACAATCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGGGGAAGAGGAAGAGGAGGAGATATCGAATTTCCAGTCCAAAGTTCCCAACAGACGAAGACGACAAATCAAAATCAAAATCAAATAGAGAAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAGAAGAAGGCTGTGACCGTCTGAGAGGATCGTTGCTTCCTCTCTGAGACGATGAACGGCGGCCCCTCCGGTTTCAACAATGCCCCCGTCACCCGGACCTTCATCATCGC
CTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGTTCAATTAAGCTTGGTTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTCCGAATCTGGAAGTTAGTAATGTCAG
TTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTTGGACTGTTTCTGCTATATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAAATAGGTTCCAACAAATACTCGGTCTTTATATTG
TTCTCTATAATTACCTCATTACTTTTTGAGGTCCTTGCGATATCACTACTTAAAGATCCTGCAGCGAATCTAGTGACTTCTGGACCTTATGGTCTTTTGTTTGCTTCCTT
TGTACCCTTCTTCTTTGATATTCCTGTTTCAACTCGGTTCCGTGTATTTGGAGTTCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCTT
CGTGGAGAAGATCTATCTTACCAGGGATATGCGGAATTCTTGCTGGTTCCTTATATCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTTATCAGTTCA
TTTTTTTCAAGACTTTCTTTGCCTTCTGCGGGTAATCCTCCAGCAGCCCCAAATAGAGATGTTAGAGGAAACATGCCATCCTTCATGAGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTA
TCCTTCTGTGCCAACTGCCACAGAACCATCAGAAGATGCCATTGCTACACTTGTTTCAATGGGATTCGATAGAAACTCAGCCAGGCAGGCCCTTGTGCAGGCCAGAAACG
ACGTTAACATTGCAACAAACATACTTCTTGAATCACAATCGCACTAATTTGAAGAATTTTGTGGGGTATATGAAAACTTTGATGTCCCAGGTCCAAGAAACAACCAAATT
GAGTATCGAGGGTTGATGAATTTGCTGACAACTGAGTTTTGATGGTTGGAGGAACTCACCGAGCTGTTTTTTTCTAAACTCTTTCAGGTTTCCCTTTTGTGTTCCTCTAC
CGTAGCTCTCAAATTTTCTTGATAATTAATGTCTGATTACACAAGATTGCTTAGTTTGTACGTATTACTACTGACTAGTAGAAATGTTTATGGAACCATAATGTGCAGAA
TTCTTTTGTTATGTTACAATCTAAATTTCAGATTATTTAGAAAGCAACAATGCAATTTCTCTTACTTTTGTGTATGTATAATGTTTTATTCAGTCCCTTGCAATCCTTAG
ATTGTTCTTTTCTTTAAACCATATGTACCTTTATTATTAATTTTAAAAATATGTTCTAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGGPSGFNNAPVTRTFIIASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRIWKLVMSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIITSLLFEVLAISLL
KDPAANLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGLQLLLSSWRRSILPGICGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFISSFFSRLSLPSAGNPPAAP
NRDVRGNMPSFMSRQVERNYPSVPTATEPSEDAIATLVSMGFDRNSARQALVQARNDVNIATNILLESQSH