; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0001557 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0001557
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description30S ribosomal protein S11, chloroplastic
Genome locationchr04:24559381..24559788
RNA-Seq ExpressionPI0001557
SyntenyPI0001557
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
YP_004841816.1 ribosomal protein S11 [Cucumis melo subsp. melo]6.9e-5484.44Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6B9M5Z9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5485.19Show/hide
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A0A6H0EQE1 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5484.44Show/hide
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A0A6H0ES45 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5485.19Show/hide
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A0A6H0EWD9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5484.44Show/hide
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A0A6H0EWZ6 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5484.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0ZZ68 30S ribosomal protein S11, chloroplastic8.5e-5581.48Show/hide
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A6MM69 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.5e-5480.74Show/hide
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Q0ZIY6 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.8e-5582.22Show/hide
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Q2L937 30S ribosomal protein S11, chloroplastic8.5e-5581.48Show/hide
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Q4VZK2 30S ribosomal protein S11, chloroplastic2.6e-5683.7Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31817.1 Ribosomal L18p/L5e family protein6.3e-0530.77Show/hide
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AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein3.0e-0731.86Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein3.0e-0731.86Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein2.3e-0732.74Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S112.1e-5380Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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