| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 2.3e-123 | 98.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo] | 2.3e-123 | 98.01 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.9e-122 | 97.21 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPR+TPPSR RSDDE+SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| XP_031736561.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.8e-120 | 94.94 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR SM
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
Query: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
SPTRHSPDTRRSISPR+TPPSR RSDDE+SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| XP_038884086.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Benincasa hispida] | 1.0e-120 | 96.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTR S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPRRTPP RGRSDDE+SP RDNGS DDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 9.2e-123 | 97.21 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPR+TPPSR RSDDE+SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.1e-123 | 98.01 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.1e-123 | 98.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 1.2e-119 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+R+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E+SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| A0A6J1K6Z8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 1.2e-119 | 94.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSR+R+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E+SP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.4e-27 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 8.5e-65 | 62.23 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS DR R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS + ++ A
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.5e-11 | 36.84 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ E +K M + + GR
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
SRSRSP RSR D Y R + RS S +RYD R + SR RS +P R K R RRS S S RS
Subjt: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
Query: SPTRHSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP--ARSDADKNSAQ
SP SP RS+SPRR+ P R R SP+R S +P SRS SP + D D++ +Q
Subjt: SPTRHSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP--ARSDADKNSAQ
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 4.7e-10 | 35.37 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSR-----------SRDRYDRDRPHRSERERYR------SRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERR
R + ++ R + R RSP R R R RSRSR SR +DR + ER R SR RS SP R K R RR
Subjt: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSR-----------SRDRYDRDRPHRSERERYR------SRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERR
Query: SAS-HSDRSMSPTR---HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKR
S S +RS +P + SP R+S SP TP RG + + SP +
Subjt: SAS-HSDRSMSPTR---HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKR
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 4.2e-11 | 30.87 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
LL+ N+ +DL F+++G + D+++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+ E + + M +++ T G
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
Query: RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R DY+R S HRS R RYRS SRS SP R + R S D SP R S RS PR +
Subjt: RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
Query: RSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
R+ SP+ + P+ SR S +RS
Subjt: RSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.0e-66 | 62.23 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS DR R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS + ++ A
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.0e-66 | 62.23 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS DR R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS + ++ A
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDENSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADKNSA
|
|
