; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0001807 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0001807
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationchr01:1942442..1947239
RNA-Seq ExpressionPI0001807
SyntenyPI0001807
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031487.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold139G002480 [Cucumis melo var. makuwa]2.7e-4797.3Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTS
        EVTKELENTT+
Subjt:  EVTKELENTTS
XP_004136872.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus]1.2e-4796.43Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVTKELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
XP_008455213.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495430 [Cucumis melo]2.7e-4796.43Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVTKELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
XP_031744799.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X2 [Cucumis sativus]1.2e-4797.3Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTS
        EVTKELENTT+
Subjt:  EVTKELENTTS
XP_038886856.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X2 [Benincasa hispida]5.0e-4692.86Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVT+ELENTT++
Subjt:  EVTKELENTTSM
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein5.8e-4896.43Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVTKELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
A0A1S3C1M4 uncharacterized protein LOC1034954301.3e-4796.43Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVTKELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
A0A5A7SPS8 Uncharacterized protein1.3e-4797.3Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLD LQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAEVHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTS
        EVTKELENTT+
Subjt:  EVTKELENTTS
A0A6J1CLE5 uncharacterized protein LOC1110122424.1e-4692.86Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFA+ASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAE+HV+
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVT+ELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X24.1e-4691.96Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEM SNL+SLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQ

Query:  EVTKELENTTSM
        EVT+ELENTT +
Subjt:  EVTKELENTTSM
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein1.8e-3876.11Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEM SNLDSLQKLLLKKAV+V+++TF+RASL SEQARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHV

Query:  QEVTKELENTTSM
        Q+VTKELENTT +
Subjt:  QEVTKELENTTSM

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCTGT
CTATGTAGATGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTG
CTATCACCGCTGCAGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAAGCAGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAAGTACATGTGCAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACA
AGTATGAAATATCTTACTTTTTTCCACCCTCATCTTCTAATTTTCTTGACTCTTAGTCCATTTTCATTTCTTAATAAAAATATTGATAGACTAGCCTTGACATCATACTC
AAACATTCCCAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTATGGAAAGACAAATGGCACAAATACGAAATCTAAGAACAACAATAACGCGGTAAAATCGAATGCCCAAAACATGATCATCGGGTGGGTTCTTAGCTCCCTCGCTAAG
TCTCTACACGGATCATGAAGTTCAACCATAGTTGAATTGTGAATTTGCAAAACTGCAAGCGTCGGAGAAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGCAAAGGAACGGACAGAT
GGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGACCTCCAACCTCGACTCACTCCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCTGTCTATGTAGATGACGAGACGTTTGCCAGAGCT
TCATTGTGCTCCGAACAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGGGAACTCGATGCTGCTATCACCGCTGCAGCTCATGCTCGTTCAGA
AAAACGTCAAGCAGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAAGTACATGTGCAGGAGGTCACTAAAGAGCTCGAGAACACTACAAGTATGAAATATCTTACTTTTTTCCACCCTC
ATCTTCTAATTTTCTTGACTCTTAGTCCATTTTCATTTCTTAATAAAAATATTGATAGACTAGCCTTGACATCATACTCAAACATTCCCAAGTGAGAAAAAATTTCTATA
TTATTCTCCCATGCTTCACTACTACATTTTATTAGCATTATTTTCTGATGCATTGAGACATTTTTGCAAACATGATTCATCTTATGAATTTTGAATAAGAAGCGTCATTT
GAAGAAATGGGAAGAGATTAATCCTTAAAAGATACAAATGGGAAGAGATTAATCCTTAAAAGATACAAACCTGGAAAGGAGCGAAGGAATGATTTATTTTGTCTAGTGAA
GTATTAATATACTCTCTTATGTTTTCAATGAATTTCTTTTTAAGATAGGAGACTACAGTTTTTGTTTGGAAACGTACAATAGGAACGATTGTTTAAAATTTCACCACGGT
ATTCTTTTCTTTATACAACTTAAAATCAACAGTTTATCTGTTGGGCAGCCAGTCTGTCTATTTGGCCGTTGGCCTTCAGTATTGTGGGGTTCTGGGTGTGTTGTCGAATT
CTTGTGATTGGAGATGACATTGTGATATATACACATTTTATCAATTATAAATTTGTCTTTTTGTTTTCTCCTTTTTAGCACCCACAGAAAGTTACACGAGCAAACAAAAA
TAGTTAGGTGAAACTTCACGTTTTTTACTATATATGTGTGTGTGTGTATTGTGAAATCAACTATTATGGTAAATGAGCACGGTTACATTTCTTTTTATGAGACTTGAGTT
TGTAAGACATACCCCATCTTCAGCAGAATAGAACACAGAAGGGAGTGAAACTTCTGCAGAAGATTCAGTTTAATAGGCTGTTTCTAAAGTTTTGATCGAGGTCAATATGT
ACCTTGAAATATTGGTGATTCGGCAGTGATGGAATCAAGTTTATATTATTTACATGATCTAACACTACCTTATTCATTTCAATTGAATTCTTTTTTTTGTTCCAATCCAA
CCACTCAGTGCGGCCATACTAATCTTCAAAGAGTGAATATTGGAATTATAAAGGAAAGGAAACATTTTCCATTATGTCATAATTTGGAAAGTTGAAATAATTTTCCTTTC
TTTAATATTTATTTTATTTAAGTGAACTCGGTAGTCTATGACTCTATGATTCCTCCTAGTCTCAGATGAAGGCGTTAACTTTGATATGAAGACAGATTATTCGATCTCAA
TGAAATGGTCTCTTATGAAAATAATAAATAGAAAAAAGAGAATTTATTAATAGGCAATTATGGTTCTTCATGGCACAGTACCATAGGAAATTTCCTTGAAATAGAGGTAT
TTCAACTGCATATGGATGAATTATGCGCGAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAAGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAAACTCTTGGTGGGAAAGAATAA
AGTCTGCAAATATGTGAGGTTTAGATTTTGATTATTAGGATGTTAGTATTTTTCTTTGTTTTGTGGGTGAAGTTTTAGTGTAAAATATTTATGGATAGTCTGGTTGAATC
TGATTAGGAATTTGGTGTGTAATATATTATTTTGAACTTAGTGAAGTAACAGTTTTTAGAATATGGATAAATCAAATTCAAATTACATTTCATTGGATGACAATGTCCAA
GTTATTTGCTCCCAGTGCCAACTACTATGAGAATAAAAGAAAATCAGAATGAAACAGAGTTTTAGTTTTTGAGGATGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMTSNLDSLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSEQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAEVHVQEVTKELENTT
SMKYLTFFHPHLLIFLTLSPFSFLNKNIDRLALTSYSNIPK