; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0001838 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0001838
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionGlycine-rich protein family
Genome locationchr07:21473865..21475426
RNA-Seq ExpressionPI0001838
SyntenyPI0001838
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7024647.1 hypothetical protein SDJN02_13465, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-1248.97Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDK--VKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVD
        M Y KT + LGLLLA LFVSS VSAR LEE K  V++DG   HG H                          GH+  G H  G HG DA     N  G+D
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDK--VKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVD

Query:  NHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPH
         H GH+GGGHGGH    HG DADV +LDGH GHHDH  HH HH H
Subjt:  NHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPH

XP_008463760.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo]3.8e-4675.47Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLI LGLLLA LF+SSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGGHYG       GGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
         N+QG+D+HGGH+GGGH                  GHGG    GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

XP_011654035.2 cold and drought-regulated protein CORA [Cucumis sativus]1.5e-5579.07Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDY------HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG----GGGHYG-----GGGHYGGGHGL
        MTYPKTLI  GLLLA LF+SSQVSARLLEEDKVK+DGLDY       GGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG    GGGHYG     GGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDY------HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG----GGGHYG-----GGGHYGGGHGL

Query:  DADTKKSNEQGVD----NHGGHYGGGHGGHYGGG-HGLDADVKNLDGHGG--HHDHGHHHCHHPHCPESVKN
        DA+TK+SN+QG+D     HGGH+GGGHGGH+GGG HGLDADVKNLD HGG  HHDHGHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  DADTKKSNEQGVD----NHGGHYGGGHGGHYGGG-HGLDADVKNLDGHGG--HHDHGHHHCHHPHCPESVKN

XP_022138889.1 histidine-rich membrane protein KE4 homolog 2-like [Momordica charantia]2.1e-1248Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH
        M Y KT + LGLLLA LFVSS VSARLL E K   +G D+H  H           +  GH+    H    GH+     + GGH  DAD        +D+H
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH

Query:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
         GH+GGGHGGH+GGGHG DAD+ +LD H GHHDHGHH   H    + VKN
Subjt:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

XP_038900076.1 histidine-rich glycoprotein-like [Benincasa hispida]4.3e-1349.68Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH
        M Y KTL+ LGLLLA LFVSS VSARLLEEDK   +  D+HG H          H+  GH+    H+  G H    GH+G  H  + D       G+D H
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH

Query:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGH------GGHHDHGHHHCHHPH-CPESVKN
         GH+GGGH GH+GG HG DA+V +LDGH       GHHDHGH H HH H   +SVKN
Subjt:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGH------GGHHDHGHHHCHHPH-CPESVKN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4K0 Uncharacterized protein2.5e-4377.33Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDY------HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG----GGGHYG-----GGGHYGGGHGL
        MTYPKTLI  GLLLA LF+SSQVSARLLEEDKVK+DGLDY       GGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG    GGGHYG     GGGHYGGGHGL
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDY------HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYG----GGGHYG-----GGGHYGGGHGL

Query:  DADTKKSNEQGVD----NHGGHYGGGHGGHYGGG-HGLDADVKNLDGHGG
        DA+TK+SN+QG+D     HGGH+GGGHGGH+GGG HGLDADVKNLD HGG
Subjt:  DADTKKSNEQGVD----NHGGHYGGGHGGHYGGG-HGLDADVKNLDGHGG

A0A1S3CJZ6 cold and drought-regulated protein CORA-like1.8e-4675.47Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLI LGLLLA LF+SSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGGHYG       GGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
         N+QG+D+HGGH+GGGH                  GHGG    GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

A0A5D3DWK2 Cold and drought-regulated protein CORA-like1.8e-4675.47Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK
        MTYPKTLI LGLLLA LF+SSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY GGGHYGGGGHY GGGHYGGGGHYGGGGHYG       GGGHYGGGHGLDADTKK
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHY-GGGHYGGGGHY-GGGHYGGGGHYGGGGHYG-------GGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
         N+QG+D+HGGH+GGGH                  GHGG    GHHHCHHPHCPESVKN
Subjt:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

A0A6J1CBC6 histidine-rich membrane protein KE4 homolog 2-like1.0e-1248Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH
        M Y KT + LGLLLA LFVSS VSARLL E K   +G D+H  H           +  GH+    H    GH+     + GGH  DAD        +D+H
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH

Query:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN
         GH+GGGHGGH+GGGHG DAD+ +LD H GHHDHGHH   H    + VKN
Subjt:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN

A0A6J1IKT3 histidine-rich glycoprotein-like5.1e-1247.55Show/hide
Query:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH
        M Y KT + LGLLLA LFVSS VSAR LEE K   +  D HG H         GH+  GH                      HG DA     N  G+D H
Subjt:  MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNH

Query:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPH
         GH+GGGHGGH    HG DADV +LDGH GHHDH  HH HH H
Subjt:  GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05440.2 GLYCINE RICH PROTEIN 94.9e-0748.39Show/hide
Query:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK
        K LI LGL    L VS   +AR         E+ V+ +G  Y GGH G GGH GGGGH  GGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG G       
Subjt:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNH----GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP
         +  G   H    GGHYGGG GGH GGGH          G GGHH  G H  + P
Subjt:  SNEQGVDNH----GGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP

AT2G05440.4 GLYCINE RICH PROTEIN 96.4e-0748.34Show/hide
Query:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK
        K LI LGL    L VS   +AR         E+ V+ +G  Y GGH G GGH GGGGH  GGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG G       
Subjt:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP
                 GGHYGGG GGH GGGH          G GGHH  G H  + P
Subjt:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP

AT2G05440.5 GLYCINE RICH PROTEIN 93.7e-0747.68Show/hide
Query:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK
        K LI LGL    L VS   +AR         E+ V+ +G  Y GGH G GGH GGGGH  GGH GGGGH      GGGGHY GGGGHYGGG         
Subjt:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLL------EEDKVKADGLDYHGGHYG-GGHYGGGGHYGGGHYGGGGH-----YGGGGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKK

Query:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP
                 GGHYGGG GGH GGGH          G GGHH  G H  + P
Subjt:  SNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHP

AT2G05510.1 Glycine-rich protein family6.8e-0952.17Show/hide
Query:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSA-------RLLEEDKVKADGL-DYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGG--GGHY-GGGGHYGGGHGLDADT
        K LI LG L A L V S+VSA       +   E  V+ +G    HGGH GGGHYGGGGH  GGH GGGGH    YGG  GGHY GGGGHYGGG G     
Subjt:  KTLISLGLLLAFLFVSSQVSA-------RLLEEDKVKADGL-DYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGG--GGHY-GGGGHYGGGHGLDADT

Query:  KKSNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDG
                   GGHYGGG G H GGGHGL+  V+   G
Subjt:  KKSNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDG

AT2G05510.4 Glycine-rich protein family2.9e-0759.57Show/hide
Query:  HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGG--GGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDG
        HGGH GGGHYGGGGH  GGH GGGGH    YGG  GGHY GGGGHYGGG G                GGHYGGG G H GGGHGL+  V+   G
Subjt:  HGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGH----YGG--GGHY-GGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNHGGHYGGGHGGHYGGGHGLDADVKNLDG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTTACCCTAAAACCCTTATCAGTCTCGGTCTCCTCCTCGCTTTTCTTTTCGTCTCCTCCCAGGTCTCGGCTCGTCTGCTCGAGGAAGACAAAGTTAAGGCCGATGG
CTTAGATTATCACGGTGGACACTATGGCGGAGGACACTATGGCGGCGGGGGACACTACGGTGGAGGACACTATGGCGGAGGGGGTCACTATGGCGGAGGGGGACACTACG
GCGGAGGAGGACACTACGGCGGAGGACATGGCCTTGATGCTGACACCAAAAAGTCAAACGAACAAGGTGTAGATAACCATGGTGGACACTACGGTGGTGGACATGGGGGA
CACTACGGCGGAGGACATGGCCTTGATGCTGACGTTAAAAACTTGGACGGTCACGGCGGGCACCACGACCATGGCCACCACCACTGCCACCACCCCCACTGCCCTGAGAG
TGTTAAGAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGGTTTTGATTAATTTTGATATAAAAGAAATGAGAAGTGTTAGATTTTGGATCATCTTTGAAGACATGGTCAATTATTTATTGTGTTAAACAAAGATTACTTGTAGGTT
TTTCTCAACCAAAATACTTTCTTTTTGACTAAATTTCCATTAATTCATTCATCACTCAATACCAATACCTAACCCAAACCTCCAACTCTCTATAAATTGATAGTGATAAT
GCAATGTTTAAGCACCAAAAAATAGCCCAAGTTAATTAGCAAAAACACTTAGCATTTCCAACTTAGCTTTGTTAACCAAAAATGACTTACCCTAAAACCCTTATCAGTCT
CGGTCTCCTCCTCGCTTTTCTTTTCGTCTCCTCCCAGGTCTCGGCTCGTCTGCTCGAGGAAGACAAAGTTAAGGCCGATGGCTTAGATTATCACGGTGGACACTATGGCG
GAGGACACTATGGCGGCGGGGGACACTACGGTGGAGGACACTATGGCGGAGGGGGTCACTATGGCGGAGGGGGACACTACGGCGGAGGAGGACACTACGGCGGAGGACAT
GGCCTTGATGCTGACACCAAAAAGTCAAACGAACAAGGTGTAGATAACCATGGTGGACACTACGGTGGTGGACATGGGGGACACTACGGCGGAGGACATGGCCTTGATGC
TGACGTTAAAAACTTGGACGGTCACGGCGGGCACCACGACCATGGCCACCACCACTGCCACCACCCCCACTGCCCTGAGAGTGTTAAGAATTAGAACCCTAAAACCTACA
CCCCATCTGCTACCATGTTTGGTTCAAAATAAAAGCATATTATTGTACGATGAAATAAAGTTTGTTTTATGTGTGTGTTGTGTTTTAAATTTAAATAAAGCATAAGATAT
GTTGTATGAAATGGGGATGATGCTAAAATATTATACTTTTGTTTGTTACAACTTATGATCTTTCTAGTTTTCATATTATATATGTCATGTCAAACTATATATAAACTTCA
TTTTGCTTTCCACGTACCTTAATTTTTCATAATAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTYPKTLISLGLLLAFLFVSSQVSARLLEEDKVKADGLDYHGGHYGGGHYGGGGHYGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGGHYGGGHGLDADTKKSNEQGVDNHGGHYGGGHGG
HYGGGHGLDADVKNLDGHGGHHDHGHHHCHHPHCPESVKN