; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002058 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002058
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionzf-RVT domain-containing protein
Genome locationchr09:21857081..21862847
RNA-Seq ExpressionPI0002058
SyntenyPI0002058
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR026960 - Reverse transcriptase zinc-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BBN69274.1 TatD related DNase [Prunus dulcis]5.6e-1535.09Show/hide
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        W  +L     +WV+
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KAA0035739.1 hypothetical protein E6C27_scaffold403G00100 [Cucumis melo var. makuwa]3.7e-1941.32Show/hide
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        W  + SLF + W  D + S++
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TYK21876.1 hypothetical protein E5676_scaffold494G00090 [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-2042.15Show/hide
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        D R WS+E  G+FS KSL  HL  +S M++  + A+ +S SPRR++IL+WIM+F  +N S ++Q K P + + PS+CPLCL+  +NL H+F  C   +  
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        W  + SLF + W  D + S++
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XP_022153214.1 uncharacterized protein LOC111020765 [Momordica charantia]1.9e-1547.73Show/hide
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XP_038903695.1 uncharacterized protein LOC120090219 [Benincasa hispida]1.7e-2444.72Show/hide
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        S D+R+WS+  + +++VKSL  HL+P S + +  +  +WK+ SPRRV+IL+WIM+FG LN + V+Q K P+  L P+VCP CL   E   HLFF+C Y +
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         CW  LL  F +   +   F SN
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T2Y0 zf-RVT domain-containing protein1.8e-1941.32Show/hide
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        W  + SLF + W  D + S++
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A0A5D3DE60 zf-RVT domain-containing protein1.6e-2042.15Show/hide
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A0A5H2XQW2 TatD related DNase2.7e-1535.09Show/hide
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A0A6J1DIE2 uncharacterized protein LOC1110207659.3e-1647.73Show/hide
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M5X8A1 zf-RVT domain-containing protein (Fragment)6.0e-1535.65Show/hide
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         W  +L     +WV+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGATTGAACTAAAAAATCTCAGCAGCTCCCTCGCGGTAATTTCTCTACCTCCTCCAATCGCCGGCCACCGATTTGCTGCCGTCGACGAACTTTCCAGCCGCCGCGC
GTTTTCTCCGTCGAACGTGTCCTCCTCTGACGTAACCCGCCGCCACGCTCCACTGTTGCTGTCGGTCAATGCCGGATTTGAGGTTGTGGGTAAGGATTTGGTGATTCAAG
ATTTTAGAGTCCAGTACTGTCCCAAGTCCAGAGCATTTGGTGCGTTTTTGGTTGAGGTCTTTGTTTGGAGTTTGAAAGAGGCTTTGGATCAAACCACACTTTGGCAGAGT
GAATGCAACTCCAGTCTGAACATTATTATTGTCCTTCATGAATCTCTGGATAGAAGGCTTTGGTCTTTAGAACCATCCGGCAAGTTTTCAGTCAAATCTCTTGTGGCTCA
CCTTTCGCCATCATCTCTTATGAATAGAGAGACCTACAAAGCCTTATGGAAATCCAACAGCCCTAGGAGAGTTGATATTTTAGTATGGATTATGATATTTGGGTTATTAA
ACTGTTCATTGGTCATGCAAATGAAGCTTCCAAGCAGTTGCCTCTTGCCCTCAGTATGCCCTCTTTGCCTTCAAGAAGACGAAAACTTGCAGCACCTGTTCTTCTCCTGC
TCTTATCCAGCTAAGTGTTGGGGTAATTTGCTCTCTTTATTCGAAGTTGATTGGGTTGTTGATGGCACATTCAGCTCCAATTATTGTATGGACATGATGAGGACGCTAAA
GGCCCCGGGTATCAAAGCAGTCCCGCTTAATCTGCAATGGCCCACGGTGGACGGAATCCATAACAGTTTTCTGACAGCAAAGTTCAAATCAGAGGAAATCAGAAATGCTT
TAAAACAGTTGGGGAAAAATAAAGCTGCAAGGCCCACAGCTTCACAGTGGAATTTTTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SYPAKCWGNLLSLFEVDWVVDGTFSSNYCMDMMRTLKAPGIKAVPLNLQWPTVDGIHNSFLTAKFKSEEIRNALKQLGKNKAARPTASQWNFY