; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002409 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002409
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionCOPII coat assembly protein SEC16, putative
Genome locationchr08:17833545..17834982
RNA-Seq ExpressionPI0002409
SyntenyPI0002409
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK07441.1 putative COPII coat assembly protein SEC16 [Cucumis melo var. makuwa]5.2e-7093.67Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKSAAQLTYPPPSPS RRT FLPSSPMPPPNA VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILP  SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFI SSIIPAIIRAFRFCICL
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

XP_008462609.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500927 [Cucumis melo]1.4e-7094.3Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKSAAQLTYPPPSPS RRTTFLPSSPMPPPNA VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILP  SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFI SSIIPAIIRAFRFCICL
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

XP_011657724.1 early nodulin-20 [Cucumis sativus]2.5e-7294.27Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKS+AQLTYPPPSPS RRTTFLPSSPMPPPN AVSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILPS+SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCIC
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSI+PAIIRAFRFCIC
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCIC

XP_022979075.1 uncharacterized protein LOC111478820 [Cucurbita maxima]1.4e-5176.69Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPS-----FRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNR
        MAKSAAQ TYPPPSPS       R + +PSS MPP N  +SP P PSPI+L LLS KSSSQSYTSLKDILPSS   A AVNSPTAASPANS YEI IRNR
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPS-----FRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNR

Query:  LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPN FHRF LRFSTGNPI SC GFIR  IIP+IIR FR CIC+
Subjt:  LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

XP_038883302.1 uncharacterized protein LOC120074291 [Benincasa hispida]9.9e-6182.93Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPS---FRRTTFLPSSPMPPPN---AAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRN
        MAKSAAQ+TYPPPSPS    R   F+PSSPMPPPN   + VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILPS   A+AAVNSPTAASPANS YEISIRN
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPS---FRRTTFLPSSPMPPPN---AAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRN

Query:  RLVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        RLVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRF LRFST NPIY C GFIR +IIPAIIR FRFCICL
Subjt:  RLVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHJ9 Uncharacterized protein1.2e-7294.27Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKS+AQLTYPPPSPS RRTTFLPSSPMPPPN AVSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILPS+SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCIC
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSI+PAIIRAFRFCIC
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCIC

A0A1S3CHC6 uncharacterized protein LOC1035009276.6e-7194.3Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKSAAQLTYPPPSPS RRTTFLPSSPMPPPNA VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILP  SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFI SSIIPAIIRAFRFCICL
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

A0A5A7SL81 Putative COPII coat assembly protein SEC166.6e-7194.3Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKSAAQLTYPPPSPS RRTTFLPSSPMPPPNA VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILP  SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFI SSIIPAIIRAFRFCICL
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

A0A5D3C6C7 Putative COPII coat assembly protein SEC162.5e-7093.67Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA
        MAKSAAQLTYPPPSPS RRT FLPSSPMPPPNA VSPPP PSPINL LLSFKSSSQSYTSLKDILP  SA+AAAVNSPTAASPANS YEISIRNRLVKQA
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQA

Query:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFI SSIIPAIIRAFRFCICL
Subjt:  AWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

A0A6J1IS66 uncharacterized protein LOC1114788206.9e-5276.69Show/hide
Query:  MAKSAAQLTYPPPSPS-----FRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNR
        MAKSAAQ TYPPPSPS       R + +PSS MPP N  +SP P PSPI+L LLS KSSSQSYTSLKDILPSS   A AVNSPTAASPANS YEI IRNR
Subjt:  MAKSAAQLTYPPPSPS-----FRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNR

Query:  LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL
        LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPN FHRF LRFSTGNPI SC GFIR  IIP+IIR FR CIC+
Subjt:  LVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G52520.1 unknown protein2.3e-0740Show/hide
Query:  NAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQS----YTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRF
        N AVS       ++L L+S   SS+     YTSLKDILPSSS    +     A + A S   I+IRNRLVKQAA +YLQP S  + S+ P+F  R     
Subjt:  NAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQS----YTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYLQPMSASSYSAGPNFFHRFCLRF

Query:  STGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAF
             + S F  + S+   A++R F
Subjt:  STGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAF

AT5G06280.1 unknown protein1.1e-0637.33Show/hide
Query:  PSPSFRRTTFLPS-SPMPPPNAA--VSPPPSPSPINLTLLSFKSSS-QSYTSLKDILPS---SSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYL
        P+   RRT  + + + + PP     ++  P PS  +  L+S K SS  +YTSL+DI+ S   SS    ++N   +   + ++ +ISIRNRLVKQAA +YL
Subjt:  PSPSFRRTTFLPS-SPMPPPNAA--VSPPPSPSPINLTLLSFKSSS-QSYTSLKDILPS---SSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYL

Query:  QP--MSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFR
        QP  +++S  SAG  FF R  L  S G      F F+R  +   I ++FR
Subjt:  QP--MSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFR

AT5G06280.3 unknown protein1.1e-0637.33Show/hide
Query:  PSPSFRRTTFLPS-SPMPPPNAA--VSPPPSPSPINLTLLSFKSSS-QSYTSLKDILPS---SSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYL
        P+   RRT  + + + + PP     ++  P PS  +  L+S K SS  +YTSL+DI+ S   SS    ++N   +   + ++ +ISIRNRLVKQAA +YL
Subjt:  PSPSFRRTTFLPS-SPMPPPNAA--VSPPPSPSPINLTLLSFKSSS-QSYTSLKDILPS---SSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYL

Query:  QP--MSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFR
        QP  +++S  SAG  FF R  L  S G      F F+R  +   I ++FR
Subjt:  QP--MSASSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAATCCGCCGCCCAATTAACCTATCCACCGCCGTCTCCATCATTCCGCCGCACAACTTTCCTTCCCTCCTCCCCCATGCCTCCGCCAAACGCAGCCGTTTCCCC
TCCTCCATCGCCATCTCCGATTAACTTAACTCTCCTCTCCTTCAAATCATCTTCTCAATCCTACACTTCTCTCAAGGACATCCTTCCCTCCTCCTCTGCCGCCGCCGCCG
CCGTCAACTCTCCCACCGCGGCTTCTCCCGCTAACTCCTCCTACGAAATCTCCATCCGCAATCGTCTCGTTAAGCAGGCTGCTTGGGCTTATCTCCAGCCTATGTCCGCT
TCTTCCTATTCCGCCGGCCCCAATTTCTTCCACCGTTTCTGCCTCCGTTTCTCTACTGGAAATCCGATCTACAGTTGTTTTGGATTCATCAGAAGCAGTATCATTCCGGC
TATAATCCGTGCTTTTCGGTTCTGCATTTGCTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGATATGTTTGTAAATATTTTTAGAATTTTGCATATAAAACAAATTTTCAAATTTAAATTTTTAAAAGAAAAGAAATGAAGAGGAAAACACGTAAGAAAGAGAGAAAGG
GTTGAGCAAATAATTGGAAAAAGAATTGAAGCCGCCGTGTTTAGTTTTGCCTCAACGTTTCTCTTTTCCTTTTCCTCCATCTCTCTCTCTCTTTTTAAGCCTTTTCGTAA
ATTCCATGGCCAAATCCGCCGCCCAATTAACCTATCCACCGCCGTCTCCATCATTCCGCCGCACAACTTTCCTTCCCTCCTCCCCCATGCCTCCGCCAAACGCAGCCGTT
TCCCCTCCTCCATCGCCATCTCCGATTAACTTAACTCTCCTCTCCTTCAAATCATCTTCTCAATCCTACACTTCTCTCAAGGACATCCTTCCCTCCTCCTCTGCCGCCGC
CGCCGCCGTCAACTCTCCCACCGCGGCTTCTCCCGCTAACTCCTCCTACGAAATCTCCATCCGCAATCGTCTCGTTAAGCAGGCTGCTTGGGCTTATCTCCAGCCTATGT
CCGCTTCTTCCTATTCCGCCGGCCCCAATTTCTTCCACCGTTTCTGCCTCCGTTTCTCTACTGGAAATCCGATCTACAGTTGTTTTGGATTCATCAGAAGCAGTATCATT
CCGGCTATAATCCGTGCTTTTCGGTTCTGCATTTGCTTGTGACGCCGTCGTTTTCTCGGATTTTGGACTCGCGTATTGACGACGACTTCTTCAGCCGCTGTAATTGACCT
AGATCGATTTGATTCCGCTCTTTTTCTCACAATTACAAACCTCTCTATGATTGTGGTTTAATTCGCCTTAACCGAGCTCGAACCGATGGGGGATAAGGAGATGCAGGTTT
ATCTTCTTCATTAACGAAACTCTCTGTTTCGCAGAAGTCCGGCGATTGACCATCGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKSAAQLTYPPPSPSFRRTTFLPSSPMPPPNAAVSPPPSPSPINLTLLSFKSSSQSYTSLKDILPSSSAAAAAVNSPTAASPANSSYEISIRNRLVKQAAWAYLQPMSA
SSYSAGPNFFHRFCLRFSTGNPIYSCFGFIRSSIIPAIIRAFRFCICL