CuGenDBv2

Gene ID	PI0002446
Organism	Cucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	chr07:2800743..2805831
RNA-Seq Expression	PI0002446
Synteny	PI0002446
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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Query:  VVARDKGMGKKNNLLGLLDSPVPVDTMDLTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
        VVARDKGMGKKNNLLGLLDSPV  DTM LTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREIC
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Query:  RISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
        R SGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAEL
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Query:  SKICHIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMNMFIGVCGKDSHSTAAEALGL
         KICHIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMNMFIGVCGKDSHSTAAEALGL
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G43235.1 unknown protein

1.6e-83

43.33

Show/hide

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        F R F++         LS S P+RR  R     K   +++   D         S S + D  L   +++ +++  A+  F           + FL S  D
Subjt:  FNRRFSSPDSRPLFTPLSCSKPRRRTRRKNSLTKLRSTTHHPLD---------SSSSSSDSKLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFLSSGLD

Query:  AFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFIGQSVLLSFVVVFVVKVLIGIVSRLGNKFSSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARDKGMGKKNNLL
        AF DL+TLI+ DD NR + VSC++ST++F+G  V+L FV  F ++VL+ + S L   F S     VVRRDRSLGG+EVVV        R      K+ + 
Subjt:  AFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFIGQSVLLSFVVVFVVKVLIGIVSRLGNKFSSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARDKGMGKKNNLL

Query:  GLLDSPVPVDTMDLTDISSEVSKN-GVWVGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTEN
                    D    S+   +N  +     LPKWWP ++  ++    ++++YQ EANR+VRA+VDNR SG+D  +DDI+QLR +CRISGV+V+F  +N
Subjt:  GLLDSPVPVDTMDLTDISSEVSKN-GVWVGERLPKWWPPAVPRRN-ATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTEN

Query:  MRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELSKICHIIQIFPPE
          DSFYR S+DFVLN  SR P     + I  ED   F+AGLAE+IG+  + AAR+VSAAVAAR RS+FLQAWAL +Q +HSE+ AELSKIC I +IFPP 
Subjt:  MRDSFYRASVDFVLNIYSRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELSKICHIIQIFPPE

Query:  ESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMNMFIGV-CGKDSHSTAAEALGLEH
        E S EMEM+  GL+K +K+E+R+SL+  F+G+ C +DS  +AAEALGL H
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Sequences

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CDS sequence

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ATGGACACCACAACAACCACACTCTGCCTCTTCCTTCCATATCCATTCACATCCCATCGCCATAACCTCCACTTCAACCGCCGTTTCTCCTCGCCGGACTCCCGACCACT
CTTCACCCCTCTCTCCTGCTCCAAACCACGCCGTCGTACTCGCCGGAAAAACAGCCTCACCAAGCTCCGCTCCACCACCCACCATCCCCTTGACTCCTCATCCTCTTCCT
CTGATTCGAAGCTCCAAACTGTAATTGAACTCGACCAAGTCGCCGCCGAAGCCTCCTCTCTTTTCTACTCCGTTTACTACACTTCCCGCTCCCACCTTCGCCAGTTTCTG
TCATCGGGATTGGACGCTTTCGACGATTTGCGGACATTGATTGCCTTTGATGACCAGAATCGCACGCTTACCGTCTCTTGTCGTCGTTCCACTGTGGAATTCATTGGTCA
GTCGGTGCTGTTGAGCTTCGTTGTGGTCTTTGTAGTTAAGGTTTTAATTGGGATTGTATCCCGTTTAGGTAACAAATTTAGTTCTGGGTATACGGCCCCTGTGGTGAGAA
GGGACCGGAGCCTTGGTGGACGGGAGGTTGTTGTTGGGACTAGGAGGAGTGTTGTAGCGCGAGATAAAGGTATGGGGAAGAAGAATAATCTTTTAGGGTTATTGGACAGT
CCCGTGCCAGTGGACACAATGGATCTGACTGATATTTCAAGTGAAGTTTCGAAGAATGGGGTTTGGGTTGGAGAAAGGTTGCCAAAATGGTGGCCTCCGGCAGTTCCTCG
ACGGAATGCTACGGCGAATAGGCAAGAGTATCAGATAGAAGCTAACAGATTAGTCCGAGCCCTTGTGGACAATAGAATGAGTGGGCGGGATTTCATGGAGGACGATATTG
TTCAATTGCGTGAAATATGCAGGATATCTGGAGTAAAAGTTTCCTTCAACACAGAAAATATGCGTGATTCATTCTATCGAGCATCTGTGGACTTTGTTTTAAATATCTAT
AGCAGGACTCCCATTTACCCACACTTAATTCTTATTAATGGTGAGGATGGTCCAAATTTTGTTGCTGGGCTTGCTGAGGACATTGGCATTGAGAATGTTCGTGCTGCCAG
AATAGTTTCTGCTGCTGTTGCTGCTAGAATGCGTTCGTACTTCTTACAGGCCTGGGCTCTAGTGATGCAAGACAGACATTCAGAAGCAAATGCAGAGTTGTCGAAGATCT
GTCACATTATCCAGATATTCCCTCCTGAGGAGTCCTCGCCTGAGATGGAGATGTTGACTCTAGGCTTGAAGAAACACTTGAAGGTAGAACAGAGAGAATCATTAATGAAT
ATGTTTATTGGTGTTTGTGGTAAAGATAGTCATAGCACCGCTGCGGAAGCTCTTGGTTTGGAACATAATTCTAAACTTCAAAGGTCCAAATCCTATTTGTCTATCCCTTA
G

mRNA sequence

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Protein sequence

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MDTTTTTLCLFLPYPFTSHRHNLHFNRRFSSPDSRPLFTPLSCSKPRRRTRRKNSLTKLRSTTHHPLDSSSSSSDSKLQTVIELDQVAAEASSLFYSVYYTSRSHLRQFL
SSGLDAFDDLRTLIAFDDQNRTLTVSCRRSTVEFIGQSVLLSFVVVFVVKVLIGIVSRLGNKFSSGYTAPVVRRDRSLGGREVVVGTRRSVVARDKGMGKKNNLLGLLDS
PVPVDTMDLTDISSEVSKNGVWVGERLPKWWPPAVPRRNATANRQEYQIEANRLVRALVDNRMSGRDFMEDDIVQLREICRISGVKVSFNTENMRDSFYRASVDFVLNIY
SRTPIYPHLILINGEDGPNFVAGLAEDIGIENVRAARIVSAAVAARMRSYFLQAWALVMQDRHSEANAELSKICHIIQIFPPEESSPEMEMLTLGLKKHLKVEQRESLMN
MFIGVCGKDSHSTAAEALGLEHNSKLQRSKSYLSIP

PI0002446 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome