; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002448 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002448
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein FAR1-RELATED SEQUENCE 4
Genome locationchr04:24378191..24378746
RNA-Seq ExpressionPI0002448
SyntenyPI0002448
Gene Ontology termsGO:0006313 - transposition, DNA-mediated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0004803 - transposase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061274.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold455G001170 [Cucumis melo var. makuwa]9.3e-5583.46Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DK  CRPSD+INYMKIHHGVN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+ +ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S C ID NSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

TYK29863.1 MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]3.8e-5684.92Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD
        +DK  CRPSD+INYMKIHHGVN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S C IDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

XP_008455803.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo]1.2e-5483.33Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD
        +DK  CRPSD+INYMKIHH VN+SYDKAW GREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S C IDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

XP_016901440.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991253 [Cucumis melo]1.2e-5481.89Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DKT CRPSD+INYMKIHH VNVSYDKAWRGREIALNSIRGTP+ SY MLSTFSDALIRNN  TYT +EADDEGRFK+YF  LA SIDAWN C+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGA MKNKYLGTL+S C IDGNSQI+P
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

XP_016902696.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991824 [Cucumis melo]4.9e-5683.46Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DK  CRPSD+INYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S C +DGNSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C300 uncharacterized protein LOC1034958995.9e-5583.33Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD
        +DK  CRPSD+INYMKIHH VN+SYDKAW GREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S C IDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

A0A1S4E0D5 uncharacterized protein LOC1079912535.9e-5581.89Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DKT CRPSD+INYMKIHH VNVSYDKAWRGREIALNSIRGTP+ SY MLSTFSDALIRNN  TYT +EADDEGRFK+YF  LA SIDAWN C+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGA MKNKYLGTL+S C IDGNSQI+P
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

A0A1S4E392 uncharacterized protein LOC1079918242.4e-5683.46Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DK  CRPSD+INYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S C +DGNSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

A0A5A7V1Z6 CCHC-type domain-containing protein4.5e-5583.46Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV
        M+DK  CRPSD+INYMKIHHGVN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+ +ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S C ID NSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

A0A5D3E198 MuDRA-like transposase1.8e-5684.92Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD
        +DK  CRPSD+INYMKIHHGVN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLS FSDALIRNN  TYT EEADDEGRFK+YF  LAASIDAWN C+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S C IDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCIIDGNSQIVP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCTTCTGACATTATTAATTATATGAAGATTCATCATGGAGTCAATGTAAGTTATGATAAGGCTTGGAGGGGACGTGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCCGGAGGCCTCATATGCCATGTTATCAACATTCTCGGATGCACTGATTCGAAACAACTCAAGAACATATACGACTGAAGAAGCAGACGATG
AAGGTAGGTTTAAGTATTATTTCACGACGCTTGCTGCTTCAATTGATGCATGGAATTCTTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGGTGCAGCCATGAAGAATAAATACCTT
GGTACGTTAATGTCTCCATGCATTATTGATGGTAATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTGTATCTGGAATTACAATGTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCTTCTGACATTATTAATTATATGAAGATTCATCATGGAGTCAATGTAAGTTATGATAAGGCTTGGAGGGGACGTGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCCGGAGGCCTCATATGCCATGTTATCAACATTCTCGGATGCACTGATTCGAAACAACTCAAGAACATATACGACTGAAGAAGCAGACGATG
AAGGTAGGTTTAAGTATTATTTCACGACGCTTGCTGCTTCAATTGATGCATGGAATTCTTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGGTGCAGCCATGAAGAATAAATACCTT
GGTACGTTAATGTCTCCATGCATTATTGATGGTAATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTGTATCTGGAATTACAATGTATTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDDKTSCRPSDIINYMKIHHGVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSTFSDALIRNNSRTYTTEEADDEGRFKYYFTTLAASIDAWNSCLPIISVDGAAMKNKYL
GTLMSPCIIDGNSQIVPGITTLYLELQCI