| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0059280.1 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.7e-214 | 93.13 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
|
|
| TYK04047.1 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 7.6e-223 | 93.35 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_008462135.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 [Cucumis melo] | 7.6e-223 | 93.35 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| XP_008462138.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP50A isoform X2 [Cucumis melo] | 1.7e-214 | 92.34 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASST
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK S T
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASST
|
|
| XP_011659558.1 nuclear pore complex protein NUP50A [Cucumis sativus] | 1.4e-221 | 92.7 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAAGEKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTV SESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDEC S
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
G+KNED DP RGDKNE+E+PSEGNEIQNKETGE EK E+EENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSG GRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST+DGK GLST GVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KAD0 RanBD1 domain-containing protein | 6.9e-222 | 92.7 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAAGEKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTV SESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDEC S
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
G+KNED DP RGDKNE+E+PSEGNEIQNKETGE EK E+EENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSG GRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST+DGK GLST GVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A1S3CHQ9 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X2 | 8.2e-215 | 92.34 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASST
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK S T
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASST
|
|
| A0A1S4E3Q0 nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 | 3.7e-223 | 93.35 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| A0A5A7UW04 Nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 | 8.2e-215 | 93.13 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK
|
|
| A0A5D3BX12 Nuclear pore complex protein NUP50A isoform X1 | 3.7e-223 | 93.35 | Show/hide |
Query: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPG DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRR+VKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV+ DTEAA EKAG
Subjt: MGDAENATSTKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGEKAG
Query: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
SDEANGKDIPHE TQK G AKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLV ESNKIENEEP GGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Subjt: SDEANGKDIPHEATQKMG-------------IIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
DKNEDE PARGDKNENE+PSEGNEIQNKETGEQEK ENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDGVGLTTSF
Query: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
GLSNNGSSALFGTSGSS VSKSE+SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Subjt: GLSNNGSSALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYP
Query: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
DMKLTNMDKRGITFACMNST DGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
Subjt: DMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTVLKTPENSP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0B4K7J2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 | 3.0e-12 | 34.59 | Show/hide |
Query: PSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKRGITFACMNSTSDG
P EV V TGEE E + F + + LF ++D WKERG G +K+ + TG R+LMR +++ N ++ D+ + + DK+ + +A N +D
Subjt: PSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLT----NMDKRGITFACMNSTSDG
Query: KDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASS
+ L F V+FK + EEFR A T+ A S
Subjt: KDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASS
|
|
| Q9C829 Nuclear pore complex protein NUP50A | 1.3e-84 | 46.68 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGE
MGD+EN +KKR A ++LSRDNPGLDDD+D +E E+GTFK+AS+EVLA+RR+V+V+R ++AP +SNPFAGI+LVP T + A T A
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGE
Query: KAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVSGDKNEDEDPA
A K P EA + + K +++ V S+ V D + E+ K ++++ K+ + ++ +E + VS D N +
Subjt: KAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVSGDKNEDEDPA
Query: RGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKD---GVGLTTSFGLSNNGS
G ++ + P E K++G + ++ E+ E + + + +SFQQ SS++NAFTGLA T S S+FSFG + +D G G FGL ++ S
Subjt: RGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKD---GVGLTTSFGLSNNGS
Query: SALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNM
S++FG +GSSI+ KSE SGFP QEV+ ETGEENEKV F+ADSI+FE++DG WKERGKGELKVNV +S G+ R++MRA+GNYRLILNASLYP+MKL NM
Subjt: SALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNM
Query: DKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
DK+GITFAC+NS S+GK+GLSTF +KFKD +IVEEFR A+ +HK + S+ LKTPENSP
Subjt: DKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
|
|
| Q9LW88 Nuclear pore complex protein NUP50B | 4.7e-82 | 45.66 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRR--GSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV--------
MGD++NA ++KR A +ELSRDNPGL DDDED S E+GTF AS+EVLA+RR+++VRR S + P+SNPF GIRLVP T + S A
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRR--GSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV--------
Query: -KCDTEAAGEKAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
K +T A G + E +G ++ +K I +V K + + ++ I + + N +E GG NE D K + E +
Subjt: -KCDTEAAGEKAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETG----EQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDG---
G++ +D N N EG++ K+TG E+E KE + N++ + G ++ L+SF Q SSS+NAFTGLA TGFS S+FSFG +P++G
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETG----EQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDG---
Query: ---VGLTTSFGLSNNGSSALFGTS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRAR
+ SFG +NNG+S+LFG S +SI +KS + + FPS Q+V+VETGEENEK F ADS++FE+++G WKERGKGELKVN+ T+ + R++MR++
Subjt: ---VGLTTSFGLSNNGSSALFGTS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRAR
Query: GNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
GNYRL LNASLYP+MKL MDK+GITFAC+NS SD KDGLST +KFKD ++VEEFRA + EHK S LKTPENSP
Subjt: GNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G52380.1 NUP50 (Nucleoporin 50 kDa) protein | 9.3e-86 | 46.68 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGE
MGD+EN +KKR A ++LSRDNPGLDDD+D +E E+GTFK+AS+EVLA+RR+V+V+R ++AP +SNPFAGI+LVP T + A T A
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGLDDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRRGSTASAP--SSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEVKCDTEAAGE
Query: KAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVSGDKNEDEDPA
A K P EA + + K +++ V S+ V D + E+ K ++++ K+ + ++ +E + VS D N +
Subjt: KAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVSGDKNEDEDPA
Query: RGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKD---GVGLTTSFGLSNNGS
G ++ + P E K++G + ++ E+ E + + + +SFQQ SS++NAFTGLA T S S+FSFG + +D G G FGL ++ S
Subjt: RGDKNENEKPSEGNEIQNKETGEQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKD---GVGLTTSFGLSNNGS
Query: SALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNM
S++FG +GSSI+ KSE SGFP QEV+ ETGEENEKV F+ADSI+FE++DG WKERGKGELKVNV +S G+ R++MRA+GNYRLILNASLYP+MKL NM
Subjt: SALFGTSGSSIVSKSEKSGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNM
Query: DKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
DK+GITFAC+NS S+GK+GLSTF +KFKD +IVEEFR A+ +HK + S+ LKTPENSP
Subjt: DKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHK--------GKASSTVLKTPENSP
|
|
| AT3G15970.1 NUP50 (Nucleoporin 50 kDa) protein | 3.3e-83 | 45.66 | Show/hide |
Query: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRR--GSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV--------
MGD++NA ++KR A +ELSRDNPGL DDDED S E+GTF AS+EVLA+RR+++VRR S + P+SNPF GIRLVP T + S A
Subjt: MGDAENATS-TKKRAAGRELSRDNPGL-DDDEDVSEQETGTFKRASEEVLATRRMVKVRR--GSTASAPSSNPFAGIRLVPPTENSGSVAEV--------
Query: -KCDTEAAGEKAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
K +T A G + E +G ++ +K I +V K + + ++ I + + N +E GG NE D K + E +
Subjt: -KCDTEAAGEKAGSDEANGKDIPHEATQKMGIIAKSVPKVQPVDQNSTVLSESAISKVDDNLVSESNKIENEEPVGGDKTGNEELVRDAEKESENDECVS
Query: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETG----EQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDG---
G++ +D N N EG++ K+TG E+E KE + N++ + G ++ L+SF Q SSS+NAFTGLA TGFS S+FSFG +P++G
Subjt: GDKNEDEDPARGDKNENEKPSEGNEIQNKETG----EQEKKENEENKEDKSEGEPSKEAAPLNSFQQLSSSQNAFTGLAGTGFSTSTFSFGNIPKDG---
Query: ---VGLTTSFGLSNNGSSALFGTS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRAR
+ SFG +NNG+S+LFG S +SI +KS + + FPS Q+V+VETGEENEK F ADS++FE+++G WKERGKGELKVN+ T+ + R++MR++
Subjt: ---VGLTTSFGLSNNGSSALFGTS-GSSIVSKSEK--SGFPSMQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEFIDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRAR
Query: GNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
GNYRL LNASLYP+MKL MDK+GITFAC+NS SD KDGLST +KFKD ++VEEFRA + EHK S LKTPENSP
Subjt: GNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGLSTFGVKFKDVSIVEEFRAAVTEHKGKASSTV-----LKTPENSP
|
|
| AT5G58590.1 RAN binding protein 1 | 9.5e-06 | 28.8 | Show/hide |
Query: MQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEF--IDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGL
++EVAV TGEE+E V + S ++ F WKERG G +K+ + TG+ R++MR ++ N + M + + G +C+ +D DG
Subjt: MQEVAVETGEENEKVVFNADSILFEF--IDGSWKERGKGELKVNVPTSGTGRGRILMRARGNYRLILNASLYPDMKLTNMDKRGITFACMNSTSDGKDGL
Query: ---STFGVKFKDVSIVEEFRAAVTE
F ++F + + F TE
Subjt: ---STFGVKFKDVSIVEEFRAAVTE
|
|
