; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002572 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002572
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein FAR1-RELATED SEQUENCE 4
Genome locationchr08:8755863..8756419
RNA-Seq ExpressionPI0002572
SyntenyPI0002572
Gene Ontology termsGO:0006313 - transposition, DNA-mediated (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0004803 - transposase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK22587.1 uncharacterized protein E5676_scaffold195G00040 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-5586.78Show/hide
Query:  CRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVDDAAMK
        CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD AAMK
Subjt:  CRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVDDAAMK

Query:  NKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        NKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  NKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

TYK29863.1 MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-5684.92Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD

Query:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
         AAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

XP_008455803.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo]6.4e-5684.13Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAW GREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD

Query:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
         AAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

XP_016901440.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991253 [Cucumis melo]3.2e-5581.89Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV
        M+DKT CRPSDVINYMKIHH VNVSYDKAWRGREIALNSIRGTP+ SY MLS F D LIRNN GTYT++E DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV

Query:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        D A MKNKYLGTL+S CTIDGNSQI+P
Subjt:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

XP_016902696.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991824 [Cucumis melo]3.4e-5784.25Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV

Query:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        D AAMKNKYLGTL+S CT+DGNSQIVP
Subjt:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C300 uncharacterized protein LOC1034958993.1e-5684.13Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAW GREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD

Query:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
         AAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

A0A1S4E0D5 uncharacterized protein LOC1079912531.5e-5581.89Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV
        M+DKT CRPSDVINYMKIHH VNVSYDKAWRGREIALNSIRGTP+ SY MLS F D LIRNN GTYT++E DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV

Query:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        D A MKNKYLGTL+S CTIDGNSQI+P
Subjt:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

A0A1S4E392 uncharacterized protein LOC1079918241.7e-5784.25Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISV

Query:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        D AAMKNKYLGTL+S CT+DGNSQIVP
Subjt:  DDAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

A0A5D3DFW1 Uncharacterized protein9.1e-5686.78Show/hide
Query:  CRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVDDAAMK
        CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD AAMK
Subjt:  CRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVDDAAMK

Query:  NKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
        NKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  NKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

A0A5D3E198 MuDRA-like transposase6.3e-5784.92Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRGREIALNSIRGTPE SYAMLSAF D LIRNN GTYT+EE DDEGRFK+YFMAL  SIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVD

Query:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP
         AAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  DAAMKNKYLGTLMSLCTIDGNSQIVP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCTTCTGACGTTATTAATTATATGAAGATTCATCATAGAGTCAATGTAAGTTATGACAAGGCTTGGAGGGGGCGTGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCCAGAGGCCTCATATGCCATGTTATCAGCATTCTTGGATCCACTGATCCGAAACAACCTAGGAACATATACGTCTGAAGAAACAGACGACG
AAGGTAGATTTAAGTATTATTTCATGGCGCTTGTTGTTTCAATTGATGCATGGAATTATTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGATGCAGCGATGAAGAATAAATACCTT
GGTACGCTAATGTCTCTATGCACTATTGATGGTAATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTGTATCTAGAATTACAACCTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCTTCTGACGTTATTAATTATATGAAGATTCATCATAGAGTCAATGTAAGTTATGACAAGGCTTGGAGGGGGCGTGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCCAGAGGCCTCATATGCCATGTTATCAGCATTCTTGGATCCACTGATCCGAAACAACCTAGGAACATATACGTCTGAAGAAACAGACGACG
AAGGTAGATTTAAGTATTATTTCATGGCGCTTGTTGTTTCAATTGATGCATGGAATTATTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGATGCAGCGATGAAGAATAAATACCTT
GGTACGCTAATGTCTCTATGCACTATTGATGGTAATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTGTATCTAGAATTACAACCTATTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDDKTSCRPSDVINYMKIHHRVNVSYDKAWRGREIALNSIRGTPEASYAMLSAFLDPLIRNNLGTYTSEETDDEGRFKYYFMALVVSIDAWNYCLPIISVDDAAMKNKYL
GTLMSLCTIDGNSQIVPGITTLYLELQPI