| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036574.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 7.9e-101 | 64.2 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYE +RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| KAA0043149.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.1e-101 | 64.51 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| KAA0065380.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.2e-104 | 71.58 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + Q + +LNQE+GQ
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
Query: SVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
SVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL
Subjt: SVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
Query: QGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: QGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| XP_008445037.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103488200 [Cucumis melo] | 9.3e-110 | 64.62 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQEVGQSVNEYLATLQPIWT+L+QAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS D T S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
DLHDLLKQVISS STALA T GS SDG DW+GTEGG+II
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
|
|
| XP_031739694.1 uncharacterized protein LOC105434738 [Cucumis sativus] | 8.1e-106 | 60.45 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKPT---------KNDDVDTTIQETTPEN-------------------------
MEK ++ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKPT D D T+QETT E
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKPT---------KNDDVDTTIQETTPEN-------------------------
Query: -----------------------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNP
+LNQE GQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKI+P HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNP
Subjt: -----------------------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNP
Query: LPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
LPSLDAA+QEILFEE RLGI SS+ SD ALATTHSR NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPG +KPKSS S +
Subjt: LPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSV
Query: AVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
AAT D T +FQL+DLHDLLKQVISSNSTALA T GS S+G DWYGTEGGTII
Subjt: AVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3BBA1 uncharacterized protein LOC103488200 | 4.5e-110 | 64.62 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQEVGQSVNEYLATLQPIWT+L+QAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS D T S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
DLHDLLKQVISS STALA T GS SDG DW+GTEGG+II
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGSESSDGPHDWYGTEGGTII
|
|
| A0A5A7SZ66 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 3.8e-101 | 64.2 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYE +RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| A0A5A7UVX4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 2.1e-99 | 63.58 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQEVGQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYE +RAALLHRN LPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+C+Y HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK +GSSSV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| A0A5A7VDW0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 5.7e-105 | 71.58 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + Q + +LNQE+GQ
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTI------QETTPENNLNQEVGQ
Query: SVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
SVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL
Subjt: SVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKL
Query: QGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: QGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
| A0A5D3DG18 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 | 1.0e-101 | 64.51 | Show/hide |
Query: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
MEK+D+ARPISTILDG+NYITWAHQMRSF IGRKLWRIVTGDITKPVKP +KN + T + T+
Subjt: MEKSDIARPISTILDGSNYITWAHQMRSFFIGRKLWRIVTGDITKPVKP--------------------TKNDDVDTTIQETTPEN--------------
Query: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
+LNQE+GQSVNEYLATLQPIWT+LDQAKISP+HIRLIKVL GLRPEYES+RAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Subjt: ------------------------NLNQEVGQSVNEYLATLQPIWTELDQAKISPNHIRLIKVLKGLRPEYESIRAALLHRNPLPSLDAAVQEILFEEKR
Query: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
LGI SS+HSD ALATTH R NE FCK CKL GHK ANCP I+CRY HK+GHIL CPTRP RPPGHSHKPK S +GSSSV AATS T PS S QL
Subjt: LGISSSMHSDTALATTHSRPTNEVTFCKYCKLQGHKIANCPIIKCRYYHKQGHILKICPTRPLRPPGHSHKPKSSPNSGSSSVAVAATSPDTTPSPSFQL
Query: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
DLHDLLKQVISS STALA T G+
Subjt: HDLHDLLKQVISSNSTALAATSGS
|
|
