; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002898 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002898
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationchr08:22498998..22499933
RNA-Seq ExpressionPI0002898
SyntenyPI0002898
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038905456.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X1 [Benincasa hispida]2.5e-6390.21Show/hide
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XP_038905457.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X2 [Benincasa hispida]1.5e-6089.93Show/hide
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XP_038905460.1 uncharacterized protein LOC120091479 isoform X3 [Benincasa hispida]1.8e-6189.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LD07 Uncharacterized protein9.6e-6190.34Show/hide
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A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X12.3e-6290.48Show/hide
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A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X21.6e-6089.8Show/hide
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A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X35.6e-6188.89Show/hide
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A0A5D3DN19 Uncharacterized protein2.3e-6290.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.2 unknown protein5.7e-1339.86Show/hide
Query:  GTTDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSYSSKTEGN-------SKYKEC-------KNESTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD
        G++ +SS S +HIFGP  S S+ +S       KS     S+ T+GN       +KY+         + E + ++E  S+  E+   PC+LSSSIYYGGQD
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         Y+ +  T    + K+DG E DS  ASRGNWW+GS  Y
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AT3G55646.1 unknown protein9.3e-1643.07Show/hide
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        ++ +SSLSS +HIFGP  SSS   S  S  G     F   S  +           G+ KY+    K E ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGGQ+ 
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        Y+    T  + + K+DG E DS  ASRGNWW+GSLYY
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AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).3.3e-2147.68Show/hide
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        +KKAS     SS S TS+LFG+ +  SS SS+ I G +F    K        Q +  GG       +SKT GN      +N          + Q+QR  P
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        CHLSSSIYYGG DVY Q   +  NS+ K+DGGEDDSG ASRGNWWQGSLYY
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AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).2.7e-0739.37Show/hide
Query:  EKKASDG---SSFSFTSDLFGTTDT-SSLSSNHIFGPVFSSSFK------ASQHSEVGGKSQAFSYSSKTEGNSKYKECKNESTSSREMGSFYQEQRTNP
        +KKAS     SS S TS+LFG+ +  SS SS+ I G +F    K        Q +  GG       +SKT GN      +N          + Q+QR  P
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        CHLSSSIYYGG DVY Q   +  NS++
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AT5G59080.1 unknown protein6.7e-1441.1Show/hide
Query:  ASDGSSFSFTSDLFGTTDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSYSSKTEGNSKYKECKNESTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQD
        +S  +S SFT++LFG+ D S  SS+     +FS+ F    H   G        S++   NSK+      S + R      QE R  PCHLSSS+YYGGQD
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        VY ++        +K D    GEDD+ G      SRGNWWQGSLYY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAAGCATCTGATGGCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGACCACAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCATCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACAAGCTTTTTCATACTCCTCCAAAACTGAAGGTAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGAATG
AGAGCACATCAAGCAGAGAGATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATGTCTATACTCAAAAT
CCGGGAACTGGGTTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATGGGGGAGAAGATGATTCTGGTGGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTTTACTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGAGAAGAAAGCATCTGATGGCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTTGGGACCACAGACACTTCTTCACTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCATCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGCACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACAAGCTTTTTCATACTCCTCCAAAACTGAAGGTAATTCCAAATATAAGGAATGCAAGAATG
AGAGCACATCAAGCAGAGAGATGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATGTCTATACTCAAAAT
CCGGGAACTGGGTTCAACTCCTCTTTAAAGAGAGATGGGGGAGAAGATGATTCTGGTGGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTTTACTATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEKKASDGSSFSFTSDLFGTTDTSSLSSNHIFGPVFSSSFKASQHSEVGGKSQAFSYSSKTEGNSKYKECKNESTSSREMGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDVYTQN
PGTGFNSSLKRDGGEDDSGGASRGNWWQGSLYY