; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0002994 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0002994
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotein OSB1, mitochondrial-like
Genome locationchr03:1574270..1577797
RNA-Seq ExpressionPI0002994
SyntenyPI0002994
Gene Ontology termsGO:0000002 - mitochondrial genome maintenance (biological process)
GO:0006264 - mitochondrial DNA replication (biological process)
GO:0045910 - negative regulation of DNA recombination (biological process)
GO:0051096 - positive regulation of helicase activity (biological process)
GO:0042645 - mitochondrial nucleoid (cellular component)
GO:0003697 - single-stranded DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011344 - Single-stranded DNA-binding protein
IPR012340 - Nucleic acid-binding, OB-fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004152725.1 protein OSB1, mitochondrial [Cucumis sativus]4.5e-10175.38Show/hide
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XP_008444653.1 PREDICTED: protein OSB1, mitochondrial-like [Cucumis melo]2.4e-10277.61Show/hide
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XP_023002011.1 protein OSB1, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]5.4e-8667.56Show/hide
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XP_038886148.1 protein OSB1, mitochondrial-like [Benincasa hispida]5.0e-10074.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNI3 Uncharacterized protein2.2e-10175.38Show/hide
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A0A1S3BBN5 protein OSB1, mitochondrial-like1.2e-10277.61Show/hide
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A0A5A7VHQ1 Protein OSB11.2e-10277.61Show/hide
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A0A6J1GJW3 protein OSB1, mitochondrial-like7.6e-8666.79Show/hide
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A0A6J1KK72 protein OSB1, mitochondrial-like2.6e-8667.56Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8GWJ4 Protein OSB3, chloroplastic/mitochondrial3.6e-0833Show/hide
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Q8GXH3 Protein OSB2, chloroplastic3.0e-0747.46Show/hide
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        W+    +P +WWDNR  K N K PDF+HK T EALWL  + P W+    KL   K K+E
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Q9FYJ2 Protein OSB4, chloroplastic2.2e-0542.86Show/hide
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        W+    + ++WWDNR  K  PK PDF+HK T   LWL  + P W+ ++L
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Q9SX99 Protein OSB1, mitochondrial1.2e-3238.89Show/hide
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            H      S+N      ++      S  + +YLWQVFFS+P++WWDNR  K NPK+PDF+HK T EALWL    P WI+++L+L D K +  D +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G47720.1 Primosome PriB/single-strand DNA-binding8.7e-3438.89Show/hide
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AT4G20010.1 plastid transcriptionally active 92.2e-0847.46Show/hide
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AT4G20010.2 plastid transcriptionally active 92.2e-0847.46Show/hide
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AT5G44785.1 organellar single-stranded DNA binding protein 32.5e-0933Show/hide
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AT5G44785.2 organellar single-stranded DNA binding protein 32.5e-0933Show/hide
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        +S+L  ++ N +     N V  L  +    +G+  +  R  +W+    +P +WWDNR  K NPK PDF+HK T EALW+  + P W   +L  L    ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GAATCATGTATTGGACGTCTTAAACCCAATGACTACATTTATGTTGCTGGTACTTTAGAGTCTTATAAGAGGGATGAAAAGTTCGGGAAGCCTTGTTTATCTTACAAGTT
AACTGTCTCGGAGTTGAATTGGATTGAACATAATGATCAATGCTCAAAAAGTCAAAATTCTGTAGGCATGTTACATGAAGAAGGACATGCTGGTAGGGGTAGTTACGGGG
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GAGGCCCTGTGGCTTCGGCCAACAGATCCTCCATGGATCAGCAAACAGCTCAAGTTGCTCGACACCAAAATGAAAAAAGAAGATCATGACGGTCATTTTTTTTCTGATTC
CAGCATTCAAATTGGTTATATACCTGAAGATGCTGTATCTTCTGCTTTCCACATTGGTTCTTCTGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAATATAAACCCTAGTATTCGCGTAACAGCAGCAACGCCACTGGAGCAGCAAACGGACACGTCAGAAACTGTCGGAAAACTCTGCCGAGAAAGTTAGACTGGATTGA
TCACCGTCGCCGGACCTCCACATTGCCGTTCAGTTACTATGAAGGCCGTTCGCCTTCTCTTTTTTTCCCTTAGACGAGTAACTACATCGCCTTCGCCATCGGTAGCGTTA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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