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PI0003086 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003086
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSWIM-type domain-containing protein
Genome locationchr09:9542836..9543104
RNA-Seq ExpressionPI0003086
SyntenyPI0003086
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044308.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold46G00290 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-2283.33Show/hide
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KAA0063901.1 hypothetical protein E6C27_scaffold616G00270 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-2181.82Show/hide
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KGN51592.1 hypothetical protein Csa_008873 [Cucumis sativus]5.1e-2580.56Show/hide
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TYK02543.1 uncharacterized protein E5676_scaffold201G00230 [Cucumis melo var. makuwa]2.4e-2283.33Show/hide
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XP_031737534.1 uncharacterized protein LOC116402427 [Cucumis sativus]2.8e-2384.62Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KT57 Uncharacterized protein2.5e-2580.56Show/hide
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A0A5A7SW50 SWIM-type domain-containing protein1.7e-2180.3Show/hide
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A0A5A7TN56 SWIM-type domain-containing protein1.2e-2283.33Show/hide
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A0A5A7VDU8 SWIM-type domain-containing protein9.7e-2281.82Show/hide
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A0A5D3BS92 SWIM-type domain-containing protein1.2e-2283.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AATGGATTGGAAGGAGTCTCGTCCATCAATTAGATGCACGATTTGTAAAACAGAAGGACATAACAGACGTACTTGTCCTGAACGTGCTTCTTCTTCAAGACATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATGCTACTTATTACTATTGGCTAGAGTTATCATTCACTGAAGTTCGCCCAAATGCGAACTTACTTAGTGAACCCGGTCGATCCAGAACTACTAGGATCCATAACGA
AATGGATTGGAAGGAGTCTCGTCCATCAATTAGATGCACGATTTGTAAAACAGAAGGACATAACAGACGTACTTGTCCTGAACGTGCTTCTTCTTCAAGACATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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