; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003412 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003412
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1
Genome locationchr02:2957572..2962896
RNA-Seq ExpressionPI0003412
SyntenyPI0003412
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
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GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
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GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588115.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.8e-15996.39Show/hide
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XP_023531642.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.2e-15996.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein4.0e-16599.67Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X24.4e-16499.01Show/hide
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A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X15.6e-15989.29Show/hide
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A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 11.9e-15996.39Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like4.3e-15995.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta3.9e-1630.33Show/hide
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        G  GGGG G GG        GGG GG GG     EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
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           PE               + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  
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        + LA L DD G      AG   G     GP   L              G L     I  D KRFFFD+G N  G FLR+SEV  + R++I +P     +F
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P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha3.0e-1630.39Show/hide
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        G+ GGGG G GG   GG   GGGA GG  ++  EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        
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                  D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP Q   E  + LA
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         L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha2.3e-1630.39Show/hide
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        G+ GGGG G GG  +GG   GGGA GG  ++  EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        
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                  D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP Q   E  + LA
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         L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B3.9e-1628.97Show/hide
Query:  GVAAGGGAGGGGG---------NDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISE-KTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYI------NSDDPE----
        G   GG +GG  G            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE    
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         L DD G     G    SG +                 G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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