; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003464 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003464
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRetrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94
Genome locationchr04:31563368..31564117
RNA-Seq ExpressionPI0003464
SyntenyPI0003464
Gene Ontology termsGO:0015074 - DNA integration (biological process)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036574.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa]4.6e-10279.92Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

KAA0043149.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-10280.32Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYESVRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

KAA0052024.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-9776.31Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATT+ R  NE          GHK ANCP I+CRYCH++GHIL+ CPT PP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S    SSSVV AATS D T   S QL DLHDLLKQ+ISS STA A TSGTSWLLDS CCNHMTSDISL SS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGT++TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

KAA0058316.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-10079.12Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRN LPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+C+YCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK    +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS TPVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

KAA0065380.1 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-94 [Cucumis melo var. makuwa]1.2e-10280.32Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYESVRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SZ66 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-942.2e-10279.92Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

A0A5A7U9K0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-945.7e-9876.31Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATT+ R  NE          GHK ANCP I+CRYCH++GHIL+ CPT PP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S    SSSVV AATS D T   S QL DLHDLLKQ+ISS STA A TSGTSWLLDS CCNHMTSDISL SS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGT++TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

A0A5A7UVX4 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-945.5e-10179.12Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYE VRAALLHRN LPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+C+YCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK    +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS TPVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

A0A5A7VDW0 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-945.8e-10380.32Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYESVRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

A0A5D3DG18 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon TNT 1-945.8e-10380.32Show/hide
Query:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC
        MGL PEYESVRAALLHRNPLPSLDA VQEILFEEKRLGI SS+HSD ALATTH R  NE          GHK ANCP I+CRYCHK+GHIL+ CPTRPP 
Subjt:  MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNE----------GHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPC

Query:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA
        PPGHSHKPK S  +GSSSVVAAATS  T PS S QL DLHDLLKQVISS STA A T GTSWLLDSACCNHMTSDISLLSS  PVQSLPPIHS DGN M+
Subjt:  PPGHSHKPKSSPNSGSSSVVAAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMA

Query:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV
        ISHIGTV+TPTI LS+TYHVPNLTFNLASVGQLCDLGL IIFSS+GCQV
Subjt:  ISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASVGQLCDLGLNIIFSSNGCQV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGACTCTGTCCAGAGTATGAATCTGTTCGGGCTGCCCTCTTACACCGCAACCCTCTACCATCTCTTGATGCCACCGTTCAGGAAATCCTATTTGAGGAGAAAAGACT
TGGCATTAGCTCCTCTATGCACTCTGATACTGCCCTTGCAACCACTCATTCACGGCCTACTAATGAGGGACACAAGATTGCTAATTGTCCTATCATTAAGTGCAGGTACT
GTCACAAGCAAGGTCACATCTTGGAAATCTGTCCAACTCGTCCACCGTGCCCTCCTGGTCACTCACACAAACCCAAGTCCTCACCTAATTCGGGTTCCTCATCTGTGGTT
GCTGCTGCCACCTCACCTGACACTACACCATCTCCAAGCTTTCAGTTACATGACCTCCATGACTTACTGAAACAGGTGATCTCTTCCAACTCTACTGCCTTTGCTGCCAC
ATCAGGTACTTCCTGGCTCCTTGATTCCGCCTGTTGCAACCATATGACCTCTGACATTTCATTATTGTCCTCTCCTACCCCTGTCCAATCCCTTCCACCAATCCACTCTG
GTGATGGTAATCAAATGGCTATTTCTCACATTGGAACTGTTCACACACCCACCATCAACCTTTCCCACACTTATCATGTTCCAAATCTAACATTCAACCTAGCCTCTGTT
GGCCAATTATGTGACCTTGGACTTAACATTATCTTTTCCTCTAATGGTTGTCAGGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGACTCTGTCCAGAGTATGAATCTGTTCGGGCTGCCCTCTTACACCGCAACCCTCTACCATCTCTTGATGCCACCGTTCAGGAAATCCTATTTGAGGAGAAAAGACT
TGGCATTAGCTCCTCTATGCACTCTGATACTGCCCTTGCAACCACTCATTCACGGCCTACTAATGAGGGACACAAGATTGCTAATTGTCCTATCATTAAGTGCAGGTACT
GTCACAAGCAAGGTCACATCTTGGAAATCTGTCCAACTCGTCCACCGTGCCCTCCTGGTCACTCACACAAACCCAAGTCCTCACCTAATTCGGGTTCCTCATCTGTGGTT
GCTGCTGCCACCTCACCTGACACTACACCATCTCCAAGCTTTCAGTTACATGACCTCCATGACTTACTGAAACAGGTGATCTCTTCCAACTCTACTGCCTTTGCTGCCAC
ATCAGGTACTTCCTGGCTCCTTGATTCCGCCTGTTGCAACCATATGACCTCTGACATTTCATTATTGTCCTCTCCTACCCCTGTCCAATCCCTTCCACCAATCCACTCTG
GTGATGGTAATCAAATGGCTATTTCTCACATTGGAACTGTTCACACACCCACCATCAACCTTTCCCACACTTATCATGTTCCAAATCTAACATTCAACCTAGCCTCTGTT
GGCCAATTATGTGACCTTGGACTTAACATTATCTTTTCCTCTAATGGTTGTCAGGTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLCPEYESVRAALLHRNPLPSLDATVQEILFEEKRLGISSSMHSDTALATTHSRPTNEGHKIANCPIIKCRYCHKQGHILEICPTRPPCPPGHSHKPKSSPNSGSSSVV
AAATSPDTTPSPSFQLHDLHDLLKQVISSNSTAFAATSGTSWLLDSACCNHMTSDISLLSSPTPVQSLPPIHSGDGNQMAISHIGTVHTPTINLSHTYHVPNLTFNLASV
GQLCDLGLNIIFSSNGCQV