; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003751 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003751
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationchr11:27715942..27720605
RNA-Seq ExpressionPI0003751
SyntenyPI0003751
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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No hits found
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein7.9e-9849.33Show/hide
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AT4G39140.2 RING/U-box superfamily protein7.9e-9849.33Show/hide
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AT4G39140.3 RING/U-box superfamily protein7.9e-9849.33Show/hide
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AT4G39140.4 RING/U-box superfamily protein7.9e-9849.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCGTACAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTTCATTGCCTTCAACTTC
ATCTTTGTCGACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCGACCAATTCGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATCACCTGTTGCGTCAAGTGT
CTGACAGCCGAATCCGAGGATTGAAATCACCAAGTAGCTATTTAGCTTCAGAAGATAGACCAAGGCTTCCCTCTTGGAGCAATGAATCAGTCCGGGACTCACATGGAGGG
TCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACTCATTTGGCTTCAACGGTGAGAAAATAGC
CAGATCTAGTAGTCAGATCTCAACTTCCTCAGTTGATTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCAAAGCTGCTGACCGAGAAATCCTCATGGAGTAGCCAAAGGATTATTGCTA
ACAATGAACTTTCTGTTGCTGCTGTCCTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCTGATTGCTTGGAGAGTATGACACCCGAGATTCACAAATACGATCCTGCTTGTCCTGTT
TGTACCTTCGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCACTGAAAGCCGAAATGGACTGGAAGAGTCTATACAAGAGATCCAAAAAGTGTATTGCAGATAGCGA
TTTTGATGGCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAACAATGCACGTCTCGAAAGGGGATCGAAATTGTCAGCCAGTTCTAGCATGAGAAGCTCCTCAGGAAAGCCGT
TCTTGAAACGCCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCTAGAGTGATGTCTGATAATCCCTCAACAAGAAGGAAAGGATTCTTCTGGGCAAAATCCAGCAAAGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAACCCAGCTTCAGCCTTTCACCTTCATTTCTCCCTCTAAAACCCTCTCTCTTTCTCTCTCTTCTTTCTCTCTCCTCTTTTGAGTTTGAGTTTGAGCTCTCTGAAGA
CAGAATACATTTTGGCGTTTCTTTGAGAGGCATGGTGCTGGGGTTATTCTCAGAGTTTTAATTTTGACGGCTTCAGCAACTTTTGTGGTGAAGTTATAAAAATCAAAATC
TTGGTCTTTCGCCAGCATGGGATCTGCGTGTTGTGTTGCTGCTAGGGACAAGACTATAGTAAGTGGATCTGGAAGTGAAACCTTATGTAGGAATATTAGGTATTCACCCA
GTTGGAGCTTTCGATGGGATAATCGTGGACGGGTAGCTGGTGAAGAGACTTCGATAAATTGGTTTTCTGATAGTGTTGGCCGCAATGATAGAGTGGAACTGAAATGTGAG
TCAGCATATGCATCAGAGGATGGAAGTCCACTTGAACATCTGCGTAGACGCGGATGGCAAAAGTCCCCACCGCCAGAAGGTACAACTAATCATTCGAGGACTCCTAGTTC
AGGTCAATCAAATTCTAGGAATCTATCGACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTATAGAATCTCCCACAGCTTCGTACAAGTCTCCTGCAAAATTGTCACTTT
CATTGCCTTCAACTTCATCTTTGTCGACATCTCCTTTGTCATCTCAGAGTTATCTGCCTCCGACCAATTCGTCCCTAACAAGATGTTCCCACCGATCTCCAGGACATCAC
CTGTTGCGTCAAGTGTCTGACAGCCGAATCCGAGGATTGAAATCACCAAGTAGCTATTTAGCTTCAGAAGATAGACCAAGGCTTCCCTCTTGGAGCAATGAATCAGTCCG
GGACTCACATGGAGGGTCTTCAGATTGTTGGTCTGTGCATGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACTCATTTGGCTTCA
ACGGTGAGAAAATAGCCAGATCTAGTAGTCAGATCTCAACTTCCTCAGTTGATTTGCAAACTTGCGGAGTTTGCTCAAAGCTGCTGACCGAGAAATCCTCATGGAGTAGC
CAAAGGATTATTGCTAACAATGAACTTTCTGTTGCTGCTGTCCTAACCTGTGGACATGTTTATCATGCTGATTGCTTGGAGAGTATGACACCCGAGATTCACAAATACGA
TCCTGCTTGTCCTGTTTGTACCTTCGGGGAGAAGCATACTCAAAAGTTGTCTGAAAAGGCACTGAAAGCCGAAATGGACTGGAAGAGTCTATACAAGAGATCCAAAAAGT
GTATTGCAGATAGCGATTTTGATGGCGATTTTGCTGCAAACGACCCTTTCAAAAACAATGCACGTCTCGAAAGGGGATCGAAATTGTCAGCCAGTTCTAGCATGAGAAGC
TCCTCAGGAAAGCCGTTCTTGAAACGCCACTTCTCCTTCGGCTCAAAGGGATCTTCTAGAGTGATGTCTGATAATCCCTCAACAAGAAGGAAAGGATTCTTCTGGGCAAA
ATCCAGCAAAGTATGATAGATTCTAACGGCCCCTCCACGTCGTGTCGGGAAGTTGTGTTTCGTGAAACAAGGGAACCATTGACTTCTGTGCCTCGTCAATGGAAACATGG
CCATAAGAAGTAAAGTTGTGTTCCCACGTCCATTGCAGCCATTGAAATATGCTGCTCACTCAAAACCCAGGTGCCTTCCACAAAATTGTTTGTAGTCTTGAAAAGTTTCA
TGAAACAAGGAATTGTCAGTCAACTTCATAACTCCAATTTAAAATGTCTGTATACATATCAAAGATATGATATATAAATGTTATTTGAGTTGAAATTCTTTGTTATGGGT
TCTTGTTTATACACACTCAGCATTTGTGTAAAACAGATTCCAATTCTAATCTTTCTCTATAATCTGTGAGTGTGGTTAGCAGCATACTCCCATTTTTATTTCTAGCATGT
TACTAAAACACATATGTTTACAATCTTCATGCTTTAACCTTTCATATTTTAATAAAAGCTTATTAGATTTTCCTATCCGTTGGTCGAAGTCTGTCATATAATATATATGG
TTGAAACTTGTCTGTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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CTFGEKHTQKLSEKALKAEMDWKSLYKRSKKCIADSDFDGDFAANDPFKNNARLERGSKLSASSSMRSSSGKPFLKRHFSFGSKGSSRVMSDNPSTRRKGFFWAKSSKV