; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003804 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003804
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionHMA domain-containing protein
Genome locationchr04:9142607..9145247
RNA-Seq ExpressionPI0003804
SyntenyPI0003804
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006121 - Heavy metal-associated domain, HMA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581006.1 hypothetical protein SDJN03_21008, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-6781.08Show/hide
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XP_008443474.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487059 isoform X1 [Cucumis melo]1.4e-8295.03Show/hide
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XP_022934914.1 uncharacterized protein LOC111441946 [Cucurbita moschata]8.1e-6780.54Show/hide
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XP_038903053.1 uncharacterized protein LOC120089747 [Benincasa hispida]2.1e-7085.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LC88 HMA domain-containing protein1.4e-8093.37Show/hide
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A0A1S3B868 uncharacterized protein LOC103487059 isoform X16.6e-8395.03Show/hide
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A0A5D3D1F9 Heavy-metal-associated domain-containing protein6.6e-8395.03Show/hide
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A0A6J1F3X5 uncharacterized protein LOC1114419463.9e-6780.54Show/hide
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A0A6J1J0J2 uncharacterized protein LOC1114823591.4e-6478.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14910.1 Heavy metal transport/detoxification superfamily protein2.8e-3349.45Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGCCTCCCTCAGACATTCGCCGGTTCAGGGACGGAGCCTGCCACGCGGCCTGAAACAAGTCAGGGCAGTTGAAGAGGATGCCTCTGTTCCCGAGCTAGGAGTTGAAAGCG
AAGCGTTGTCGCCTTCTCCGTCTGACCCGCCTGCCGTCACCGTGCCCGTCTCCCCCTCTGATGTTCTCACCATGTTCTTTCAGGCAGAGGGGACGCTAAATGAATCAGCT
ATTCCTTCTGTAACTGAGGCTTTGGAGCAAACGGAGGGTATCACCGGGTTGAAAGTCCAAGTTGTTGAGGGCATTGCATCAGTTGCGCTTACAAAACAAACAACAATACA
ATCTACAGGAGTGGCCTCGAGTTTGATCGAGACCATTCAAGGTGCAGGTTTTAAGTTACAAACGTTGAATTTGAGTTTTGAGGATGAGGAAGAAGTTTTTGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGGGAGTGAGTGTAGCGGATAAGCAGGATAGGAATCCCAAAATTCACAAACACAAAACAAACTCAAACCGTCGAGGAAAATGGCTTCAATCTCCACCTTCCCCGCCCTTC
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CGGAGCCTGCCACGCGGCCTGAAACAAGTCAGGGCAGTTGAAGAGGATGCCTCTGTTCCCGAGCTAGGAGTTGAAAGCGAAGCGTTGTCGCCTTCTCCGTCTGACCCGCC
TGCCGTCACCGTGCCCGTCTCCCCCTCTGATGTTCTCACCATGTTCTTTCAGGCAGAGGGGACGCTAAATGAATCAGCTATTCCTTCTGTAACTGAGGCTTTGGAGCAAA
CGGAGGGTATCACCGGGTTGAAAGTCCAAGTTGTTGAGGGCATTGCATCAGTTGCGCTTACAAAACAAACAACAATACAATCTACAGGAGTGGCCTCGAGTTTGATCGAG
ACCATTCAAGGTGCAGGTTTTAAGTTACAAACGTTGAATTTGAGTTTTGAGGATGAGGAAGAAGTTTTTGTTTAGGTACTCTTGATTATGAAGTGTAAGAATTGGAGAGA
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