; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003849 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003849
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationchr11:20201661..20202452
RNA-Seq ExpressionPI0003849
SyntenyPI0003849
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053284.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]8.5e-12695.6Show/hide
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TYK11877.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]7.2e-12594.8Show/hide
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XP_004138608.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis sativus]9.4e-13395.44Show/hide
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XP_008455958.1 PREDICTED: fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo]1.2e-13295.44Show/hide
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XP_038900968.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.6e-12490.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQV6 FAS1 domain-containing protein4.6e-13395.44Show/hide
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A0A1S3C2T8 fasciclin-like arabinogalactan protein 76.0e-13395.44Show/hide
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A0A5A7UDG5 Fasciclin-like arabinogalactan protein 74.1e-12695.6Show/hide
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A0A5D3CIW8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 73.5e-12594.8Show/hide
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A0A6J1CEN1 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.5e-11585.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 124.7e-2636.48Show/hide
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        + LK  +L++LT +Q   L+ FH +P Y + ++F+ +   +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ 
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        +F    P  PAP P+P+V     + S + +     SS +SP+ +
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 116.3e-2336.41Show/hide
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         +P+ T AG+    ++ LN T +   ++I++G  +  V++SV S   +AVYQVD VLLP A+FG+   PAPAP    +V+    + S   +G  S  S++
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Query:  SPSSSF
        +  + F
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 69.8e-2437.07Show/hide
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        APAPT     +NL  +L     F   +  L +T+V      Q N S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q   L+L+H +P YY+L+D   L   
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Query:  SPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPSPNVAPA-ADTPSAETEGSVSPSS
        +P+ T A    G  + LNFT    S  +++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   P  AP P  + + + AD+P+A+ E   + SS
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Query:  TESPS
         +  S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.5e-6956.65Show/hide
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        ++ +     +  +++CS+   A+TA+ P  V P     P PAP PA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
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         PP PAP P+P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S        +L   + + ISG + LF
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 96.3e-2336.32Show/hide
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        +LL ++ + A  A   PA         APAP PAG  +NL  +L   G F  F+  L  T+V      Q N S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ 
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        D    L+L+H  P YY++ D   L   +P+ T A  +    Y LNFT  +  I++S+G+  T++S+S+    P+AVY VD VLLP  +FG       AP 
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        P        D  S  T+ + SPS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 94.5e-2436.32Show/hide
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        +LL ++ + A  A   PA         APAP PAG  +NL  +L   G F  F+  L  T+V      Q N S EG+T+F P D AF +LK  +L+ L+ 
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Query:  PSPNVAPAADTPSAETEGSVSPS
        P        D  S  T+ + SPS
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 71.1e-7056.65Show/hide
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        ++ +     +  +++CS+   A+TA+ P  V P     P PAP PA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
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Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQLK L+LFH LPHYY+L++FK L Q  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
Subjt:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD

Query:  FPPAPAPVPSPNVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVAGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P+P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S        +L   + + ISG + LF
Subjt:  FPPAPAPVPSPNVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVAGGVLWIQLVLAISGGLLLF

AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 71.1e-7056.65Show/hide
Query:  ELHMIFLFGIWLMLLCSSPVCARTAAKPPAVSPIPAPVPAPAPTPAGDHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFS
        ++ +     +  +++CS+   A+TA+ P  V P     P PAP PA ++VNL +LL+VAGPFH FL YL ST VIETFQ QAN++EEGITIFVPKD AF 
Subjt:  ELHMIFLFGIWLMLLCSSPVCARTAAKPPAVSPIPAPVPAPAPTPAGDHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFS

Query:  SLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTD
        + K P LSNLTKDQLK L+LFH LPHYY+L++FK L Q  P++TFAG QY+L FTD SGT+ I S WT TKVSSSV STDPVAVYQV+ VLLPEAIFGTD
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Query:  FPPAPAPVPSPNVAPAADTPS-AETEGSVSPSSTESPSSSFRVAGGVLWIQLVLAISGGLLLF
         PP PAP P+P V+  +D+PS A++EG+ SP S+   S        +L   + + ISG + LF
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AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 66.9e-2537.07Show/hide
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        APAPT     +NL  +L     F   +  L +T+V      Q N S++G+TIF P D AF+ LK  +L++LT  Q   L+L+H +P YY+L+D   L   
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Query:  SPITTFA----GEQYTLNFTD--ASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPSPNVAPA-ADTPSAETEGSVSPSS
        +P+ T A    G  + LNFT    S  +++S+G   T++++++    P+AVY VD VLLPE +FGT   P  AP P  + + + AD+P+A+ E   + SS
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Query:  TESPS
         +  S
Subjt:  TESPS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 123.3e-2736.48Show/hide
Query:  MELHMIFLFGIWLMLLCSSPVCARTAAKPPAVSPIPAPVPAPAPTPAGDHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAF
        ME  +I L    L+LL ++P              +  P PA AP P G   N+  +L  AG F  F+  L+ST V      Q N+S+ GITIF P D++F
Subjt:  MELHMIFLFGIWLMLLCSSPVCARTAAKPPAVSPIPAPVPAPAPTPAGDHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAF

Query:  SSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEA
        + LK  +L++LT +Q   L+ FH +P Y + ++F+ +   +P+ T AG+     + LN T +  T++I+SG TNT VS +V S   +AVYQVD VLLP+ 
Subjt:  SSLKKPSLSNLTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGE----QYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEA

Query:  IFGTDFPPAPAPVPSPNVAPAADTPSAETEGSVSPSSTESPSSS
        +F    P  PAP P+P+V     + S + +     SS +SP+ +
Subjt:  IFGTDFPPAPAPVPSPNVAPAADTPSAETEGSVSPSSTESPSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACTTCATATGATTTTCTTATTTGGTATTTGGCTGATGCTGCTGTGCTCTTCACCCGTATGTGCTCGAACTGCTGCTAAGCCTCCTGCAGTTAGTCCGATTCCTGC
ACCAGTACCAGCCCCGGCACCTACACCAGCTGGCGATCATGTCAACCTCGCTGATTTGCTTACAGTAGCTGGTCCCTTTCACAAGTTCCTCGGCTACCTTGAATCCACCA
AAGTCATTGAGACCTTCCAAAAGCAAGCCAATGATTCTGAAGAGGGAATTACTATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCTCTTAAGAAGCCCTCTTTGTCCAAT
CTCACCAAGGACCAGCTCAAGTCACTGTTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTACACTTTAGCTGACTTTAAAGAACTAGGCCAAAAGAGTCCTATTACAACATTTGC
CGGTGAGCAGTACACTTTAAATTTTACTGATGCATCTGGCACTATCCACATCAGCTCAGGCTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGTAGCGTGCTTTCGACCGATCCTGTTG
CAGTTTACCAAGTTGATCACGTACTCCTTCCAGAAGCAATCTTTGGAACTGATTTCCCTCCTGCCCCAGCTCCAGTACCGAGCCCCAACGTTGCTCCTGCTGCTGATACT
CCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGTGTTTCTCCATCATCGACAGAATCACCATCTTCTTCCTTTAGGGTTGCTGGAGGGGTACTTTGGATCCAGTTGGTTTTAGCAATTTC
AGGTGGACTGCTCCTATTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACCAGTACCAGCCCCGGCACCTACACCAGCTGGCGATCATGTCAACCTCGCTGATTTGCTTACAGTAGCTGGTCCCTTTCACAAGTTCCTCGGCTACCTTGAATCCACCA
AAGTCATTGAGACCTTCCAAAAGCAAGCCAATGATTCTGAAGAGGGAATTACTATATTTGTACCAAAAGATACTGCATTTTCATCTCTTAAGAAGCCCTCTTTGTCCAAT
CTCACCAAGGACCAGCTCAAGTCACTGTTACTCTTTCATGGCTTACCACATTACTACACTTTAGCTGACTTTAAAGAACTAGGCCAAAAGAGTCCTATTACAACATTTGC
CGGTGAGCAGTACACTTTAAATTTTACTGATGCATCTGGCACTATCCACATCAGCTCAGGCTGGACCAACACAAAAGTGAGTAGTAGCGTGCTTTCGACCGATCCTGTTG
CAGTTTACCAAGTTGATCACGTACTCCTTCCAGAAGCAATCTTTGGAACTGATTTCCCTCCTGCCCCAGCTCCAGTACCGAGCCCCAACGTTGCTCCTGCTGCTGATACT
CCATCTGCTGAAACTGAGGGCAGTGTTTCTCCATCATCGACAGAATCACCATCTTCTTCCTTTAGGGTTGCTGGAGGGGTACTTTGGATCCAGTTGGTTTTAGCAATTTC
AGGTGGACTGCTCCTATTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELHMIFLFGIWLMLLCSSPVCARTAAKPPAVSPIPAPVPAPAPTPAGDHVNLADLLTVAGPFHKFLGYLESTKVIETFQKQANDSEEGITIFVPKDTAFSSLKKPSLSN
LTKDQLKSLLLFHGLPHYYTLADFKELGQKSPITTFAGEQYTLNFTDASGTIHISSGWTNTKVSSSVLSTDPVAVYQVDHVLLPEAIFGTDFPPAPAPVPSPNVAPAADT
PSAETEGSVSPSSTESPSSSFRVAGGVLWIQLVLAISGGLLLF