; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0003927 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0003927
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionbasic-leucine zipper transcription factor A
Genome locationchr05:1822386..1823375
RNA-Seq ExpressionPI0003927
SyntenyPI0003927
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063552.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold329G00590 [Cucumis melo var. makuwa]8.9e-7892.73Show/hide
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XP_008460859.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499607 [Cucumis melo]4.0e-7893.33Show/hide
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XP_011650096.1 NEDD8-specific protease 1 [Cucumis sativus]2.9e-7693.25Show/hide
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XP_023536962.1 uncharacterized protein LOC111798189 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-5978.88Show/hide
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XP_038890730.1 homeobox protein MOX-2 [Benincasa hispida]1.9e-7593.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL60 Uncharacterized protein1.4e-7693.25Show/hide
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A0A1S3CDF1 uncharacterized protein LOC1034996071.9e-7893.33Show/hide
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A0A5D3BFQ4 Uncharacterized protein4.3e-7892.73Show/hide
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A0A6J1FDP2 uncharacterized protein LOC1114444391.0e-5878.26Show/hide
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A0A6J1HQB7 uncharacterized protein LOC1114657106.5e-5878.26Show/hide
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        AS DF YDALSY+LNFDEGYDEGHVDD FPLRNFSSRLPASPPKS PSSS  SREM TA+S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G01430.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NHL domain-containing protein (TAIR:AT5G14890.1)1.3e-0753.45Show/hide
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        G    R S    FRYD LSYSLNFD+G   GH DDEFP R++S R  A S P S+  S
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AT5G14890.1 NHL domain-containing protein8.7e-0744.44Show/hide
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        FI R GR+         G        FRYD+ SYSLNFD+G   GH +DEFP R++S R  A S P S+  S
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AT5G35090.1 unknown protein3.1e-1237.16Show/hide
Query:  SLKEMLKSSLCLSCCLRKHRNGHHHHHHH-----HHRRMSISSDGDSP-GPLMRCSS---AKDKSRSRE-CHDIKDRLPNFISRLGRHG---RRHSASAD
        SL++ LKS  C++ C    R  +HHHH +         ++      SP G  M+  S    +  S+S E C  +  R+   +  +G HG   RRH  +AD
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Query:  FRYDALSYSLNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPASPPKSSPSSSTA
        F YD  SY+LNFD+G ++ ++ D FPLRNFS+RLP SPP S+ ++ ++
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AT5G62865.1 unknown protein5.3e-0441.03Show/hide
Query:  RLPNFISRLG---RHGRRHSASADFRYDALSYSLNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPASP------PKSSPSSSTA
        R   FI R     R GR   AS  F+YD LSYSLNFD+  +E        LR+FS+R  + P      P  SP+S +A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGATTCCAACGAACACAAAGGAAATTCCTCACCCTCGTCTCTGAAAGAGATGCTTAAATCTTCTCTATGTTTATCTTGTTGCCTTCGTAAGCACCGGAATGGACA
TCATCATCATCACCATCATCACCACCGGCGGATGTCGATTTCGTCCGACGGTGATTCGCCCGGACCGCTCATGAGATGTTCTTCTGCAAAGGATAAATCCAGATCTCGTG
AGTGTCATGATATTAAAGATCGACTTCCGAATTTCATTTCCCGACTCGGTCGCCATGGACGTCGTCACTCTGCTTCGGCTGATTTCCGTTACGATGCACTTAGTTATTCG
CTTAATTTCGATGAAGGATATGATGAAGGTCATGTTGATGATGAGTTCCCTCTCAGGAATTTCTCCTCTAGGTTACCGGCTTCTCCTCCGAAATCCTCACCGTCTTCGTC
TACTGCGTCGAGGGAGATGATCACGGCATTTAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACGACTCAATATTAAATGACGAAAGTACCCCTAATCATTTGTCCTTTATCGTAATTTCATCCCTCCACCCACACAATATATATAAACCCCCAAACTTCCCTCTTTTCTC
TAACCGCGTTCTTCAGTTATAACAAATGGATGATTCCAACGAACACAAAGGAAATTCCTCACCCTCGTCTCTGAAAGAGATGCTTAAATCTTCTCTATGTTTATCTTGTT
GCCTTCGTAAGCACCGGAATGGACATCATCATCATCACCATCATCACCACCGGCGGATGTCGATTTCGTCCGACGGTGATTCGCCCGGACCGCTCATGAGATGTTCTTCT
GCAAAGGATAAATCCAGATCTCGTGAGTGTCATGATATTAAAGATCGACTTCCGAATTTCATTTCCCGACTCGGTCGCCATGGACGTCGTCACTCTGCTTCGGCTGATTT
CCGTTACGATGCACTTAGTTATTCGCTTAATTTCGATGAAGGATATGATGAAGGTCATGTTGATGATGAGTTCCCTCTCAGGAATTTCTCCTCTAGGTTACCGGCTTCTC
CTCCGAAATCCTCACCGTCTTCGTCTACTGCGTCGAGGGAGATGATCACGGCATTTAGTTAATTAATCGAATCGATCGAATTATATTTATGTGGAAGTCGTTTTGAGGTT
TAATTCGCAGCCGATCGTTAATAATTTTATTACGGCAAACGGATCGGTGTGGTTATACTTATGAACGACGAGGTTCACTGGAACGGAAGAGATCGAATTCCAAAAGGTAC
ATTTGTCCCAGTTTTTTCAATGTATAAATCCTCTGGAAATGCGTTTTGGTTTTTTTTGCATAACTTTTTCTTCATGGAAATATCATATAAATATATATACATATATGTAA
TTGCCTGTGTTTATGTAGCATATTCTGATTTTGCAACATAGTTTCCCATATTGTTCTTGTTTCATATATATAATATATATAAATCTCATTTTGTTCTGGTTTGGGGGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDDSNEHKGNSSPSSLKEMLKSSLCLSCCLRKHRNGHHHHHHHHHRRMSISSDGDSPGPLMRCSSAKDKSRSRECHDIKDRLPNFISRLGRHGRRHSASADFRYDALSYS
LNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPASPPKSSPSSSTASREMITAFS