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PI0004041 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0004041
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionSWIM-type domain-containing protein
Genome locationchr04:23764545..23764813
RNA-Seq ExpressionPI0004041
SyntenyPI0004041
Gene Ontology termsGO:0010073 - meristem maintenance (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044308.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold46G00290 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-2384.85Show/hide
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KAA0063901.1 hypothetical protein E6C27_scaffold616G00270 [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-2486.36Show/hide
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KGN51592.1 hypothetical protein Csa_008873 [Cucumis sativus]7.4e-2479.17Show/hide
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        M AT+YYW E+SFTEV PNA+LL+EP RPRTTRI NEMDWKESSQS+RCT+ K EGHNRRTCPQ A SSSRH
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TYK02543.1 uncharacterized protein E5676_scaffold201G00230 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-2384.85Show/hide
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XP_031737534.1 uncharacterized protein LOC116402427 [Cucumis sativus]4.3e-2483.08Show/hide
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        YWPE+SFTEV PNA+LL+ P RPRTTRI NEMDWKESSQS+RCTICK EGHNRRTCP+ ASSSRH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KT57 Uncharacterized protein3.6e-2479.17Show/hide
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        M AT+YYW E+SFTEV PNA+LL+EP RPRTTRI NEMDWKESSQS+RCT+ K EGHNRRTCPQ A SSSRH
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A0A5A7TN56 SWIM-type domain-containing protein8.0e-2484.85Show/hide
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A0A5A7VDU8 SWIM-type domain-containing protein1.6e-2486.36Show/hide
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A0A5D3BS92 SWIM-type domain-containing protein8.0e-2484.85Show/hide
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A0A5D3BTJ4 ZnF_PMZ domain-containing protein1.8e-2383.33Show/hide
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        YWPELSFTEVC NA+LL+ PDRPRTTRIH EMDWK+S QS+RCTICK EGHNRRTCPQ A SSSRH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTGCTACTTATTACTACTGGCCAGAGTTATCATTCACTGAAGTTTGCCCAAATGCGAACTTACTTAGAGAACCCGATCGACCCAGAACTACGAGGATCCATAATGA
AATGGATTGGAAGGAGTCCAGTCAATCAGTAAGATGCACGATATGTAAAGCGGAAGGACATAACAGACGTACTTGTCCTCAACATGCTTCTTCTTCAAGACATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACTGCTACTTATTACTACTGGCCAGAGTTATCATTCACTGAAGTTTGCCCAAATGCGAACTTACTTAGAGAACCCGATCGACCCAGAACTACGAGGATCCATAATGA
AATGGATTGGAAGGAGTCCAGTCAATCAGTAAGATGCACGATATGTAAAGCGGAAGGACATAACAGACGTACTTGTCCTCAACATGCTTCTTCTTCAAGACATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTATYYYWPELSFTEVCPNANLLREPDRPRTTRIHNEMDWKESSQSVRCTICKAEGHNRRTCPQHASSSRH