; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0004219 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0004219
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionMal d 1-associated protein
Genome locationchr04:5853961..5859797
RNA-Seq ExpressionPI0004219
SyntenyPI0004219
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]2.4e-7087.42Show/hide
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XP_023005676.1 uncharacterized protein LOC111498606 [Cucurbita maxima]7.6e-6177.22Show/hide
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-6177.85Show/hide
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]6.0e-7489.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein1.1e-7087.42Show/hide
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867047.6e-7591.03Show/hide
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193931.4e-5775Show/hide
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        MGWVWRD+ G+ D    D       +  SS DRCSTR VV+SQC+TEEVEPG+FVRKCERTEEILRDC+GRP EVIQSNKEFTEEDV DQ+VNRSFS G 
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        S HQPF FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  ESSS
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458454.8e-6177.22Show/hide
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         SE+QPF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLF+RE SSS
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986063.7e-6177.22Show/hide
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         SE+QPF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPP+FNRE SSS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein7.9e-4556.52Show/hide
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        MGWVW+DD    G ++ S AD        SP    DRCSTR VVR+QCKTEEVEPG+F+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV+QSNKE+TE+DVTDQ++  S 
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        S G +++  F+FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein7.4e-3853.74Show/hide
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        MGW+W DD+     + AD        S ++++ CST +VVRSQCKTEEVEPG+FVRKC++TEEILR C G+P+EV+QSN E TEEDVTDQMV RS     
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          +  P +FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATGGGTCTGGAGAGACGACACCGGCGATTTGGATTCATCCCCAGCCGATGGCGCTAAGTTCAACAATTACACCTCTCCCTCCTCCAGCGATCGGTGTTCGACCAG
AAGTGTGGTGAGGTCCCAGTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAGATTCGTCAGGAAGTGCGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGAGACTGCATTGGAAGGCCAGCCG
AAGTGATACAGTCCAACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCTCGTTGGGATTGTCAGAACATCAACCATTTGATTTCCCTGGG
CTCCGTAGCGATATTGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAGGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAACGGTTTCTTTGGTTCTTTAAGAGATCC
ACCCCTATTCAACAGAGAGTCTTCCTCCTCCCATCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCGTGTCTTCTCGAGCCGTGGCGCTCAAGAAAAACTCCATTGTAAAAGAGAATCTCGTGGCGGTGAGGAAGGTTCGCGATATTGAGCTTCGAAAATGGGATGGGTCTGG
AGAGACGACACCGGCGATTTGGATTCATCCCCAGCCGATGGCGCTAAGTTCAACAATTACACCTCTCCCTCCTCCAGCGATCGGTGTTCGACCAGAAGTGTGGTGAGGTC
CCAGTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAGATTCGTCAGGAAGTGCGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGAGACTGCATTGGAAGGCCAGCCGAAGTGATACAGTCCA
ACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCTCGTTGGGATTGTCAGAACATCAACCATTTGATTTCCCTGGGCTCCGTAGCGATATT
GATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAGGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAACGGTTTCTTTGGTTCTTTAAGAGATCCACCCCTATTCAACAG
AGAGTCTTCCTCCTCCCATCGATGAGACGTGGCATACCCATTGAAGATCATGATCCAGTGTTCTTCTCCAACCCAAATGAGCCCGATTCTGGTCACGTTGACTTATCTGG
ATTGGCCAGGGATGTCTAAATGCCCTAAATGAACCTTATTGCCCCTTTCTTTTTCAGATGTTAGATACGACGGGTACACAGTTTACGGTCTTTAATTTTGGTGGCTGTAC
ATTTGGTAATCAATAAAATACTCTTTGTTTTCCTTCAGCTAGTTTTGTTTTTCCCTGGAAGAGATCAAGTCTAAGCAATTATTGTGATGTATTCAACTTTTGCTTATAGA
TATTGACATATCGATTAGTTATGTGTGGGAATCTTTCTTGAATAGTGCAAAATTGTTGGTTTTAAAACAACCAAGTTTTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGWVWRDDTGDLDSSPADGAKFNNYTSPSSSDRCSTRSVVRSQCKTEEVEPGRFVRKCERTEEILRDCIGRPAEVIQSNKEFTEEDVTDQMVNRSFSLGLSEHQPFDFPG
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