| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0045532.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] | 4.6e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| KAA0056839.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-84 | 55.83 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FW E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| KAA0057507.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| TYK08190.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.9e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| TYK28859.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TQA8 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.2e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| A0A5A7US62 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.9e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| A0A5A7UTI6 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 1.4e-84 | 55.83 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FW E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| A0A5D3CA17 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 3.8e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| A0A5D3DZM5 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 2.9e-85 | 56.18 | Show/hide |
Query: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
MDYLSR+L HLE I+GV N N++HLLFADD+LIFVE+N+ YL LQ L LFEKA+GL N SKS I PINIS R D +A+ +G ++FLP N
Subjt: MDYLSRILHHLELTEQIRGV-VTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSN
Query: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Y G+PLGG PRS +FWD E IHKK+N WKYS +SKGGRLTL+ ASL+SLPTYQLS FKAP S YK+IE++WRDFLW G+ + K H I+W
Subjt: YFGMPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISW
Query: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
+ T PK+ GG I+ + TN LLCKWLWRYH +S++LW+K IDAKY+K G++P+ R SS N+ W +I K DW+ + I
Subjt: SKITIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSIIKNIDWFNAHI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O00370 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein | 6.4e-05 | 20.85 | Show/hide |
Query: EQIRGVVTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSNYFGMPLGGKPRSMAF
++I+G+ + LFADD+++++EN + L + F K +G +N+ KS + N ++ + + Y G+ L + + F
Subjt: EQIRGVVTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPSNYFGMPLGGKPRSMAF
Query: WDN---ITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSV--FKAPNSTYKKIERYWRDFLW---KGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKITIPK
+N + + I + N WK S GR+ ++ ++ Y+ + K P + + ++E+ F+W + ++L +QKN+ IT+P
Subjt: WDN---ITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSV--FKAPNSTYKKIERYWRDFLW---KGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKITIPK
Query: DKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRK
K + T T W W Y + W +
Subjt: DKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRK
|
|
| P08548 LINE-1 reverse transcriptase homolog | 5.6e-09 | 23.18 | Show/hide |
Query: IRGVVTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPS--NYFGMPLGGKPRSM--
I+G+ S + LFADD+++++EN D L + + +G +N KSV + I + N+A+ K IP +P Y G+ L + +
Subjt: IRGVVTNSLNLTHLLFADDILIFVENNDDYLKTLQFTLHLFEKATGLNVNLSKSVIYPINISKNRADHVANKWGIPSQFLPS--NYFGMPLGGKPRSM--
Query: AFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSV--FKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKITIPKDKGG
++ + + I + +N WK S GR+ ++ S+ Y + KAP S +K +E+ F+W NQK I+ + ++ GG
Subjt: AFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSV--FKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKITIPKDKGG
Query: HDITNIATTNTTLLCKWLWRYH-TKSSTLWRKL
+ ++ +++ K W +H + +W ++
Subjt: HDITNIATTNTTLLCKWLWRYH-TKSSTLWRKL
|
|
| P0C2F6 Putative ribonuclease H protein At1g65750 | 6.8e-15 | 28.4 | Show/hide |
Query: MPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKI
MP+ K + + I E + +++ W+ LS GRLTL A L+S+P + +S P S ++++ R FLW E K + H + WSK+
Subjt: MPLGGKPRSMAFWDNITENIHKKINSWKYSYLSKGGRLTLINASLASLPTYQLSVFKAPNSTYKKIERYWRDFLWKGNHENNMLDPNQKNRLHPISWSKI
Query: TIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSI
PK +GG + + N L+ K WR + ++LW ++ KY + + S ++ WRSI
Subjt: TIPKDKGGHDITNIATTNTTLLCKWLWRYHTKSSTLWRKLIDAKYSKTQAGNLPLTSRYSSNNALWRSI
|
|
