; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0004765 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0004765
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HOX11-like
Genome locationchr01:26429656..26430922
RNA-Seq ExpressionPI0004765
SyntenyPI0004765
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135907.1 homeobox-leucine zipper protein HOX11 [Cucumis sativus]1.6e-16395.4Show/hide
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XP_023513861.1 homeobox-leucine zipper protein HOX11-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-13884.83Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBJ3 Homeobox domain-containing protein7.8e-16495.4Show/hide
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A0A1S3CEP0 homeobox-leucine zipper protein HOX11-like3.8e-16696.01Show/hide
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A0A5D3CJS2 Homeobox-leucine zipper protein HOX11-like3.8e-16696.01Show/hide
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A0A6J1GQQ3 homeobox-leucine zipper protein HOX11-like8.7e-13986.44Show/hide
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A0A6J1JXM6 homeobox-leucine zipper protein HOX11-like6.7e-13986.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YW03 Homeobox-leucine zipper protein HOX277.3e-5848.02Show/hide
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         A ++ +A    T  +       R + +S
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A2Z1U1 Homeobox-leucine zipper protein HOX115.4e-6163.72Show/hide
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        G   ++SPN++A SF M +F  +G GGN     D    G     G  +R+ SRASDED+ G  RKKLRLSKEQSAFLEESFKEH+TLNPKQKLALAKQLN
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         + GG   +SSS   +A    H+ ++
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P46665 Homeobox-leucine zipper protein HAT144.2e-6652.16Show/hide
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        P N   R       G      E +E E+   S     P+S  SSFQ++FG+   G      +  +++       E ER++SRAS+E   DENG TRKKLR
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        LSK+QSAFLE+SFKEH+TLNPKQK+ALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCE+LTEENRRLQKE++ELR LKT+   YMQLPATTL
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        TMCPSCERV +S+A  + +A   +
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Q67UE2 Homeobox-leucine zipper protein HOX117.0e-6148.6Show/hide
Query:  MELGLSLGDAPKPFRFRRLSRKDLGFCVDLSIGRSVAGDKEDDEDKPNQGEDE--------SDGNEDPPIQLDLLPHNPVPRNLTNPYQGFPWPSSEN--
        MELGLSLG+A        ++       + L +GR     +    D   + E E           + +P ++L LLP  P    L  P+   P PSSE+  
Subjt:  MELGLSLGDAPKPFRFRRLSRKDLGFCVDLSIGRSVAGDKEDDEDKPNQGEDE--------SDGNEDPPIQLDLLPHNPVPRNLTNPYQGFPWPSSEN--

Query:  -------------------------DEGEDRTA------SPNSAASSFQM-EFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDEDENGCTRKKL
                                 +E +D  A      SPN++A SF M +F  +G GGN     D    G     G  +R+ SRASDED+ G  RKKL
Subjt:  -------------------------DEGEDRTA------SPNSAASSFQM-EFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDEDENGCTRKKL

Query:  RLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATT
        RLSKEQSAFLEESFKEH+TLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKEL ELRALKT +  YM LPATT
Subjt:  RLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATT

Query:  LTMCPSCERVTSSSAASTV--AATEGVTKRSGLAIGGGRPSSSSFPFSAKTQSHQSTA
        L+MCPSCERV S+SA +T   AAT            GG  ++SS   +A    H+ ++
Subjt:  LTMCPSCERVTSSSAASTV--AATEGVTKRSGLAIGGGRPSSSSFPFSAKTQSHQSTA

Q6YPD0 Homeobox-leucine zipper protein HOX271.6e-5748.02Show/hide
Query:  MELGLSLGDAPKPFRFRRLSRKDLGFCVDLSIGRSVAGDKEDDEDKPNQGED---------ESDGNEDPPIQLDLLP----HNPVPRNLTN---------
        MELGLSLGDA       RL   +L   + + +G   AG +  +E++  + ED          +  + +P ++L L+     H P     +          
Subjt:  MELGLSLGDAPKPFRFRRLSRKDLGFCVDLSIGRSVAGDKEDDEDKPNQGED---------ESDGNEDPPIQLDLLP----HNPVPRNLTN---------

Query:  --PYQGFPWPSSENDE-----GEDRTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDEDENGCTRKKLRLSKEQSAFLEES
          P      P  E+DE         ++SPN +  SF ++    G  G+          G     G  ER+SSRASD+DE    RKKLRLSKEQSAFLEES
Subjt:  --PYQGFPWPSSENDE-----GEDRTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDEDENGCTRKKLRLSKEQSAFLEES

Query:  FKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTLTMCPSCERVTSS
        FKEH+TLNPKQK+ALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRL KEL ELRALKT    YM LPATTL+MCPSCERV S+
Subjt:  FKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTLTMCPSCERVTSS

Query:  SAASTVAATEGVTKRSGLAIGGGRPSSSS
         A ++ +A    T  +       R + +S
Subjt:  SAASTVAATEGVTKRSGLAIGGGRPSSSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 49.8e-5062.44Show/hide
Query:  ASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERAS------SRASDEDENG---CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAK
        +SPNSA SS      L G+  +++  R   EN       E+ERAS      S  SD+++ G    +RKKLRLSK+Q+  LEE+FKEH+TLNPKQKLALAK
Subjt:  ASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERAS------SRASDEDENG---CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAK

Query:  QLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAASTVAATEGVT
        QLNLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCC+ LTEENRRLQKE+ ELRALK +  LYM + P TTLTMCPSCERV+SS+A  T A +   T
Subjt:  QLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAASTVAATEGVT

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 32.4e-4861.19Show/hide
Query:  DEGEDRTASPNSAASSF----QMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERAS----SRASDEDENG----CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTL
        DEG    +SPNS  SS     + E  L  + G +         G   E  E ERAS      + DED +G     +RKKLRLSKEQ+  LEE+FKEH+TL
Subjt:  DEGEDRTASPNSAASSF----QMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERAS----SRASDEDENG----CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTL

Query:  NPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAASTV
        NPKQK+ALAKQLNLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCE LT+ENRRLQKE+ ELRALK +  LYM + P TTLTMCPSCERV  +S++S+V
Subjt:  NPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAASTV

Query:  A
        A
Subjt:  A

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.0e-4656.93Show/hide
Query:  RTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGE--SER-ASSRASD--EDENGCT-RKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQ
        R  S +S  SSF        S G +  R  ++  G   E  E  +ER   SR SD  +DE G + RKKLRL+K+QSA LE++FK H+TLNPKQK ALA+Q
Subjt:  RTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGE--SER-ASSRASD--EDENGCT-RKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQ

Query:  LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTLTMCPSCERVTSSSAASTVAATEGVTKRSGL
        LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCETLT+ENRRLQKELQ+L+ALK +   YM +PA TLTMCPSCER+          A +  T +   
Subjt:  LNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTLTMCPSCERVTSSSAASTVAATEGVTKRSGL

Query:  AI
        +I
Subjt:  AI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana3.0e-6752.16Show/hide
Query:  MELGLSLGD-APKPFRFRR--------------LSRKDLGFCVDL--------SIGRSVAGDKEDDEDKPNQGEDESD-----GNEDPPIQLDL-----L
        MEL LSLGD   K F F                 S KDLGFC+ L        S+  S +   ED++ KP     +SD      + DPP+QL L     L
Subjt:  MELGLSLGD-APKPFRFRR--------------LSRKDLGFCVDL--------SIGRSVAGDKEDDEDKPNQGEDESD-----GNEDPPIQLDL-----L

Query:  PHNPVPRNLTNPYQGFPWPSSENDEGEDRTAS-----PNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDE---DENGCTRKKLR
        P N   R       G      E +E E+   S     P+S  SSFQ++FG+   G      +  +++       E ER++SRAS+E   DENG TRKKLR
Subjt:  PHNPVPRNLTNPYQGFPWPSSENDEGEDRTAS-----PNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDE---DENGCTRKKLR

Query:  LSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTL
        LSK+QSAFLE+SFKEH+TLNPKQK+ALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCE+LTEENRRLQKE++ELR LKT+   YMQLPATTL
Subjt:  LSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTL

Query:  TMCPSCERVTSSSAASTVAATEGV
        TMCPSCERV +S+A  + +A   +
Subjt:  TMCPSCERVTSSSAASTVAATEGV

AT5G47370.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein5.4e-4852.65Show/hide
Query:  PIQLDLLPHNPVPRNLTNPYQGFPW------------------PSSENDEGEDRTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGES----
        P+Q++L P++    +L+N  Q  PW                  PS+ N E +   +SPNS  SS             IS +R + E      VG      
Subjt:  PIQLDLLPHNPVPRNLTNPYQGFPW------------------PSSENDEGEDRTASPNSAASSFQMEFGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGES----

Query:  ----ERASSR-ASDEDENG--CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEEN
            +R  SR  SDE+E+G   +RKKLRLSK+QSAFLEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+LNL  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRC E LTEEN
Subjt:  ----ERASSR-ASDEDENG--CTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYLKRCCETLTEEN

Query:  RRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAAS
        RRLQKE  ELR LK +   Y Q+ P TTL MCPSCERV   S+++
Subjt:  RRLQKELQELRALKTTNSLYMQL-PATTLTMCPSCERVTSSSAAS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTTGGCCTGAGCTTGGGCGACGCCCCCAAGCCCTTCCGCTTCCGGCGACTTTCCCGGAAAGACTTAGGGTTCTGTGTCGACTTATCGATTGGCCGTTCGGTCGC
CGGAGATAAAGAAGACGACGAAGACAAACCTAATCAAGGAGAAGATGAATCCGACGGTAATGAAGATCCACCGATTCAACTCGATCTTCTCCCTCATAATCCCGTTCCTC
GAAACCTAACTAATCCGTACCAAGGATTTCCATGGCCGTCGTCCGAAAACGATGAAGGCGAAGATCGAACCGCATCGCCGAATAGCGCAGCGTCGTCGTTTCAAATGGAA
TTTGGACTGTACGGCAGCGGAGGTAACATTTCTTGCCGGAGAGATCAAATGGAAAATGGCGTAATGAACGAAGTAGGTGAATCTGAAAGAGCTTCTTCAAGAGCTAGCGA
TGAAGACGAAAATGGCTGTACAAGGAAGAAACTCAGACTCTCTAAAGAACAATCCGCTTTTCTTGAAGAAAGCTTCAAAGAGCACAACACATTGAACCCTAAACAGAAAC
TGGCACTGGCTAAGCAACTGAATCTTCGTCCTCGCCAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGAAGAGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGTGAGTATTTG
AAAAGATGTTGTGAGACATTAACAGAAGAAAATCGACGGCTTCAAAAGGAGCTTCAAGAATTAAGAGCTTTGAAAACCACAAATTCACTCTACATGCAATTACCAGCTAC
AACACTAACTATGTGTCCGTCTTGTGAAAGAGTAACCTCATCTTCCGCCGCTTCCACCGTCGCAGCGACGGAGGGAGTTACAAAACGATCTGGGTTAGCCATTGGTGGTG
GGCGACCAAGTTCTTCTTCTTTCCCATTTTCTGCTAAAACACAGTCCCACCAGTCAACAGCTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGCTTGGCCTGAGCTTGGGCGACGCCCCCAAGCCCTTCCGCTTCCGGCGACTTTCCCGGAAAGACTTAGGGTTCTGTGTCGACTTATCGATTGGCCGTTCGGTCGC
CGGAGATAAAGAAGACGACGAAGACAAACCTAATCAAGGAGAAGATGAATCCGACGGTAATGAAGATCCACCGATTCAACTCGATCTTCTCCCTCATAATCCCGTTCCTC
GAAACCTAACTAATCCGTACCAAGGATTTCCATGGCCGTCGTCCGAAAACGATGAAGGCGAAGATCGAACCGCATCGCCGAATAGCGCAGCGTCGTCGTTTCAAATGGAA
TTTGGACTGTACGGCAGCGGAGGTAACATTTCTTGCCGGAGAGATCAAATGGAAAATGGCGTAATGAACGAAGTAGGTGAATCTGAAAGAGCTTCTTCAAGAGCTAGCGA
TGAAGACGAAAATGGCTGTACAAGGAAGAAACTCAGACTCTCTAAAGAACAATCCGCTTTTCTTGAAGAAAGCTTCAAAGAGCACAACACATTGAACCCTAAACAGAAAC
TGGCACTGGCTAAGCAACTGAATCTTCGTCCTCGCCAAGTGGAAGTTTGGTTTCAAAACAGAAGAGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGTGAGTATTTG
AAAAGATGTTGTGAGACATTAACAGAAGAAAATCGACGGCTTCAAAAGGAGCTTCAAGAATTAAGAGCTTTGAAAACCACAAATTCACTCTACATGCAATTACCAGCTAC
AACACTAACTATGTGTCCGTCTTGTGAAAGAGTAACCTCATCTTCCGCCGCTTCCACCGTCGCAGCGACGGAGGGAGTTACAAAACGATCTGGGTTAGCCATTGGTGGTG
GGCGACCAAGTTCTTCTTCTTTCCCATTTTCTGCTAAAACACAGTCCCACCAGTCAACAGCTTCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELGLSLGDAPKPFRFRRLSRKDLGFCVDLSIGRSVAGDKEDDEDKPNQGEDESDGNEDPPIQLDLLPHNPVPRNLTNPYQGFPWPSSENDEGEDRTASPNSAASSFQME
FGLYGSGGNISCRRDQMENGVMNEVGESERASSRASDEDENGCTRKKLRLSKEQSAFLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLNLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEYL
KRCCETLTEENRRLQKELQELRALKTTNSLYMQLPATTLTMCPSCERVTSSSAASTVAATEGVTKRSGLAIGGGRPSSSSFPFSAKTQSHQSTAS