; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0004983 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0004983
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionDNA polymerase delta subunit 4
Genome locationchr09:4305045..4306755
RNA-Seq ExpressionPI0004983
SyntenyPI0004983
Gene Ontology termsGO:0000731 - DNA synthesis involved in DNA repair (biological process)
GO:0006261 - DNA-dependent DNA replication (biological process)
GO:0043625 - delta DNA polymerase complex (cellular component)
GO:0003887 - DNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007218 - DNA polymerase delta, subunit 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605696.1 DNA polymerase delta subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.4e-4680Show/hide
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XP_022957680.1 uncharacterized protein LOC111459143 [Cucurbita moschata]2.4e-4680Show/hide
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XP_038875328.1 DNA polymerase delta subunit 4 [Benincasa hispida]1.1e-5491.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KND6 Uncharacterized protein2.7e-5996.8Show/hide
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A0A1S3CT23 DNA polymerase delta subunit 45.5e-6097.6Show/hide
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A0A5A7UNL0 DNA polymerase delta subunit 45.5e-6097.6Show/hide
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A0A6J1H180 uncharacterized protein LOC1114591431.2e-4680Show/hide
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A0A6J1K4T3 uncharacterized protein LOC1114911822.9e-4578.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59835 DNA polymerase delta subunit 41.5e-0653.49Show/hide
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        E +L  FD    YGP LGMTRM RW+RA +  LNPP+ +G +L
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Q3T0X9 DNA polymerase delta subunit 41.4e-0745.45Show/hide
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        +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +L++  G  + +C LW
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Q9CWP8 DNA polymerase delta subunit 42.3e-0753.49Show/hide
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Q9HCU8 DNA polymerase delta subunit 42.7e-0843.75Show/hide
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        +D+  A   +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +LK   G  + +C LW
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09815.1 polymerase delta 45.4e-3660.8Show/hide
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        MA+T   LK FYKQ KS+       SK SSRK  +P ++A+ GSD  QPAAL+SHGS+DL +DY   E MLRQFDMN+ YGPCLGMTR+ RWERA  LG+
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        NPP +I  LLK GKVQ +CLW  RV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCAACACGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAGGCAAAGGCTTCAAAGTCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGC
CAACTCTGCATCTTTGGGCTCCGATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGCGTCTGAGAATATGCTGAGGCAAT
TTGATATGAACATGGCATATGGACCTTGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGAACACTCTTA
AAGGCTGGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTGTGGGATTCTCGAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGAAAGGCCGCATCAAATAAGACCTCCAAAAGCAACAACGAGAACAAATTTGAAAATTGAAATTCCCAAGTCGATCGATCGCAGAGAAGGAGCAAAATAAAAAATGGCA
TCAACACGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAGGCAAAGGCTTCAAAGTCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGCCAACTC
TGCATCTTTGGGCTCCGATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGCGTCTGAGAATATGCTGAGGCAATTTGATA
TGAACATGGCATATGGACCTTGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGGTGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGAACACTCTTAAAGGCT
GGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTGTGGGATTCTCGAGTTTAAACTACTATATGTGCTTAGTGTATTATTTTTGTTTAATGTATGAAGTGCAGGCTGTGCTTTTGCTTTTG
GACAAATTGTTCAGCCCCTGGCTGAAACGATAATCACTTTTCCTGTGATGTGAATGGGCTTAGAATGTTTGCTGATGACAGAAATCCCCTAGTTATTTACTTCTTACTTT
TGTTGAAAACCTCTAACAAGTAGTTGTATAGTTAAATTTGGTGATATTTTCCTTTCCTAGTGTTGTTATACTTGAACTTGATATGATGTGTGAATCATTGATTAAGGACG
CCTTTCGATTCCCAATAAGTAAAGAGGGAGGGATATTTGTGACATAGTAGCATTTCAAATTTTTGTCAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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