; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005027 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005027
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein FAR1-RELATED SEQUENCE 2-like
Genome locationchr08:12232161..12232683
RNA-Seq ExpressionPI0005027
SyntenyPI0005027
Gene Ontology termsGO:0006313 - transposition, DNA-mediated (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0004803 - transposase activity (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061274.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold455G001170 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-4978.74Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHHGVN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+ +ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S CTID NSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

TYK29863.1 MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]1.3e-5080.16Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHHGVN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

XP_008455803.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo]4.1e-4978.57Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAW G EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

XP_016901440.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991253 [Cucumis melo]2.4e-4977.95Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DKT CRPSDVINYMKIHH VNVSYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT++EADDE RFK+YFMALA SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGA MKNKYLGTL+S CTIDGNSQI+P
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

XP_016902696.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC107991824 [Cucumis melo]2.2e-5078.74Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S CT+DGNSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C300 uncharacterized protein LOC1034958992.0e-4978.57Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAW G EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

A0A1S4E0D5 uncharacterized protein LOC1079912531.2e-4977.95Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DKT CRPSDVINYMKIHH VNVSYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT++EADDE RFK+YFMALA SIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGA MKNKYLGTL+S CTIDGNSQI+P
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

A0A1S4E392 uncharacterized protein LOC1079918241.1e-5078.74Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHH VN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S CT+DGNSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

A0A5A7V1Z6 CCHC-type domain-containing protein2.0e-4978.74Show/hide
Query:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV
        M+DK  CRPSDVINYMKIHHGVN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+ +ISV
Subjt:  MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISV

Query:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        DGAAMKNKYLGTL+S CTID NSQIVP
Subjt:  DGAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

A0A5D3E198 MuDRA-like transposase6.2e-5180.16Show/hide
Query:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD
        +DK  CRPSDVINYMKIHHGVN+SYDKAWRG EIALNSIRGT            DALIRNNP TYT+EEADDE RFK+YFMALAASIDAWNYC+P+ISVD
Subjt:  DDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGT-----------LDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVD

Query:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP
        GAAMKNKYLGTL+S CTIDGNSQIVP
Subjt:  GAAMKNKYLGTLMSPCTIDGNSQIVP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCATCTGACGTTATTAATTATATGAAGATTCATCATGGAGTCAATGTAAGTTATGACAAGGCTTGGAGGGGGTATGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCTGGATGCACTGATCCGAAACAACCCAGAAACATATACGTCTGAAGAAGCAGACGACGAAGATAGGTTTAAGTATTATTTCATGGCACTTG
CTGCTTCAATTGATGCATGGAATTATTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGGTGCAGCCATGAAGAATAAATACCTTGGTACGCTAATGTCTCCATGCACTATTGATGGT
AATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTATATCTGGAATTACACCGTATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATGACAAGACTTCATGTCGTCCATCTGACGTTATTAATTATATGAAGATTCATCATGGAGTCAATGTAAGTTATGACAAGGCTTGGAGGGGGTATGAGATTGCTTT
GAATTCAATTAGGGGTACTCTGGATGCACTGATCCGAAACAACCCAGAAACATATACGTCTGAAGAAGCAGACGACGAAGATAGGTTTAAGTATTATTTCATGGCACTTG
CTGCTTCAATTGATGCATGGAATTATTGTCTCCCAATAATTTCAGTTGATGGTGCAGCCATGAAGAATAAATACCTTGGTACGCTAATGTCTCCATGCACTATTGATGGT
AATTCTCAAATTGTGCCTGGAATTACAACTCTATATCTGGAATTACACCGTATTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDDKTSCRPSDVINYMKIHHGVNVSYDKAWRGYEIALNSIRGTLDALIRNNPETYTSEEADDEDRFKYYFMALAASIDAWNYCLPIISVDGAAMKNKYLGTLMSPCTIDG
NSQIVPGITTLYLELHRI