; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005474 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005474
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 1-like
Genome locationchr07:6811293..6811810
RNA-Seq ExpressionPI0005474
SyntenyPI0005474
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039608 - VQ motif-containing protein 1/10


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063001.1 VQ motif-containing protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]7.9e-3091.36Show/hide
Query:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        MEA HSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V  V EE RRQTGSARNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
Subjt:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

KAG6577059.1 VQ motif-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.9e-2287.84Show/hide
Query:  AAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRID
        AA+STRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVA   EENR   G ARNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRID
Subjt:  AAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRID

KGN53544.1 hypothetical protein Csa_014778 [Cucumis sativus]2.1e-3092.59Show/hide
Query:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        MEA HSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V TV EE RRQTGSARNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
Subjt:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

XP_022142787.1 VQ motif-containing protein 10-like [Momordica charantia]7.6e-1773.24Show/hide
Query:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPR
        A STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP A   E+ R   G + +S L RDSSFKEFQRVLREM +
Subjt:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPR

XP_038889427.1 VQ motif-containing protein 1-like [Benincasa hispida]9.6e-2888.89Show/hide
Query:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD VA   EE  R TG  RNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
Subjt:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXJ0 VQ domain-containing protein1.0e-3092.59Show/hide
Query:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        MEA HSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V TV EE RRQTGSARNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
Subjt:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

A0A0L9UJH2 VQ domain-containing protein2.3e-1155.26Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT--VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        +VVII+T+YV+TDA SFK+VVQKLTGKD   +    + NR   G    S L+RD SFKEF R+LREMP I++L+++
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT--VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

A0A5A7VBD1 VQ motif-containing protein 1-like3.8e-3091.36Show/hide
Query:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
        MEA HSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKD V  V EE RRQTGSARNS LLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD
Subjt:  MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD

A0A6J1CNV7 VQ motif-containing protein 10-like3.7e-1773.24Show/hide
Query:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPR
        A STRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP A   E+ R   G + +S L RDSSFKEFQRVLREM +
Subjt:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPR

A0A6J1FVF7 VQ motif-containing protein 12.7e-1569.44Show/hide
Query:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRI
        AHSTRVVIIDTKYV TDAKSFKTVVQKLTGKDP     EENR+ +G   +  ++ DSSFK+FQ  LREMP I
Subjt:  AHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3U8 VQ motif-containing protein 18.2e-0638.82Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT------------VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYS
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V                + ++R  G  + +   R     EF    REMP + ELY+
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT------------VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYS

Q8VYI5 VQ motif-containing protein 103.3e-0736.96Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPV--------------------ATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELY
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+ +                    + + E+ R+  G     G  R  +  EF R+ +EMP ++ELY
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPV--------------------ATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G17147.1 VQ motif-containing protein5.9e-0738.82Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT------------VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYS
        +VV I+T+YVQTDA+SFKT+VQ+LTGK+ V                + ++R  G  + +   R     EF    REMP + ELY+
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVAT------------VNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYS

AT1G78410.1 VQ motif-containing protein2.4e-0836.96Show/hide
Query:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPV--------------------ATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELY
        +VV I+T+YV+TDA+SFKTVVQ+LTGK+ +                    + + E+ R+  G     G  R  +  EF R+ +EMP ++ELY
Subjt:  RVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPV--------------------ATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGCGGCTCATTCAACTAGGGTTGTGATTATTGATACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAAAAGTTGACAGGCAAAGATCCGGT
GGCGACAGTGAATGAGGAAAACCGACGACAAACTGGTAGCGCTCGAAACTCGGGTCTTTTGAGAGATTCATCGTTCAAAGAGTTCCAAAGAGTGTTGAGAGAGATGCCAA
GAATTGATGAGCTTTATTCTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATTCCTCAAAACCCACTTCTCAATATTTATCCTTTTGTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTAAAAGAGAAAAGAAAAAGAAAAATTCTGCCTAAAAAAAGTTTTCAATTTCCC
AAATGGAAGCGGCTCATTCAACTAGGGTTGTGATTATTGATACCAAGTATGTGCAAACGGATGCCAAGAGCTTCAAGACGGTGGTGCAAAAGTTGACAGGCAAAGATCCG
GTGGCGACAGTGAATGAGGAAAACCGACGACAAACTGGTAGCGCTCGAAACTCGGGTCTTTTGAGAGATTCATCGTTCAAAGAGTTCCAAAGAGTGTTGAGAGAGATGCC
AAGAATTGATGAGCTTTATTCTGATTGAAATGAATACATATAGACTATATATATTTTACATATTACTTGATGATCTATGTTAGTATCATTTGTACTTTATTGATATATAA
TTCTTTCATTAGTTTTTGTTTTTTTTAAACTTTTTTTTTGTTTATGTACATGTGATTAATAAATTTTCATTGTTTATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEAAHSTRVVIIDTKYVQTDAKSFKTVVQKLTGKDPVATVNEENRRQTGSARNSGLLRDSSFKEFQRVLREMPRIDELYSD