; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005485 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005485
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationchr04:32651069..32651854
RNA-Seq ExpressionPI0005485
SyntenyPI0005485
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004148508.1 transcriptional regulator SUPERMAN [Cucumis sativus]1.4e-13395.4Show/hide
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XP_008465962.1 PREDICTED: transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucumis melo]9.4e-13395.42Show/hide
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        RLETSTYSAS+E NNG SQDEVLDLELRLGHGPPSS QNLMEKGEKK+SN EAACLKKRSSD
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XP_022159587.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Momordica charantia]1.6e-7166.13Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++  R+ +    G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL 
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        HQAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +    +TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST     FP N++D+  
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            +ST  +++   NG+Q+  LDLELRLGHGP  SA  L+ KG + +
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XP_023533595.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-6964.18Show/hide
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        MAA L L FQYSSS    LP LS+ TRDG  P N ++PMQTPD+VVDDDDSWEVRAFAEDTA+VMGTTWPPRSYTCT+CRREFRSAQALGGHMNVHRRDR
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        ARL HQAPS++  P   SS+SSS+  SNSFIIPT DFNGGG LC+LY FPNP +               I SPSSLFSM H SFN +  STS +  FP+ 
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Query:  NNDNHRRLETS-TYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPPSSAQNLMEKGEKKISNLEAACLKKRSSD
           NHR   +S   S S E+   S ++ +DLELRLG  P  S Q LMEKG  KISN EAACL+KRSSD
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XP_038888762.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Benincasa hispida]3.6e-10883.03Show/hide
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        MAAEL LGFQY SSLPHL+E TRDGQNP N +NPMQ PDVVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL 
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        HQAP SSSNPMKP   SSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINT  STLNAYIHSPSSLFSM HHSFNT+ PSSTSLSP FP+  ND+H
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         RLETST+         S S  +NNGSQ+  LDLELRLGHGPPSS Q LMEKG+ KISNLEAACL+KRSSD
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LF36 C2H2-type domain-containing protein7.0e-13495.4Show/hide
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        RLETSTYSAS+E NNGSQDEVLDLELRLGHGPPSS QNLMEKGEKKIS+ EAACLK+RSSD
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A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like4.5e-13395.42Show/hide
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        RLETSTYSAS+E NNG SQDEVLDLELRLGHGPPSS QNLMEKGEKK+SN EAACLKKRSSD
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like4.5e-13395.42Show/hide
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A0A6J1E087 transcriptional regulator SUPERMAN-like7.6e-7266.13Show/hide
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        MAAE  LG QY  SL H ++  R+ +    G+NPMQTP+VVVDDDDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL 
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Query:  HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSPTFPMNNNDNHR
        HQAP   +NP+KPSS+S S+S+SFIIPTPDFNGGG LCLLYQFPNPNS  G +    +TLNAYIHSPSSLFSM HHSFN    ST     FP N++D+  
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            +ST  +++   NG+Q+  LDLELRLGHGP  SA  L+ KG + +
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A0A6J1HW10 transcriptional regulator SUPERMAN2.7e-6965.62Show/hide
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        MA +L LGFQ+SSSLP   ET R+G N  NG+NPMQTPDVV   DDDDSWEVRAFAEDT NVMGTTWPPRSYTCTYCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRAR
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Query:  LHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSPTFPMNNN--
        L HQAP   SNP KPSS+SSS SNSFIIP PDFNGGG LCLLYQFPNPNSINGGIN              SLFSM +HSFN++  ST++S  FP+N++  
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Query:  -----DNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPPSSAQNLMEKGEKKI
              N  R E   +S S+E  NG+Q+  LDLELRLGHG P S QN   K  + +
Subjt:  -----DNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPPSSAQNLMEKGEKKI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 101.6e-1858.06Show/hide
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        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL      +  P SSS+P  PS   S N +     T  FN
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN1.8e-1433.67Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH-HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGI
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL   Q+PSSSS P  P                             +PNPN      
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH-HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGI

Query:  NTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHS-FNTYPS-STSLSPTF---------PMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQ------------DEVLDLELRLG
                 Y +S  +    PHHS    +P+ S   SP +         P + +      +T   S  VE    ++            DE++ LEL +G
Subjt:  NTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHS-FNTYPS-STSLSPTF---------PMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQ------------DEVLDLELRLG

Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.7e-1235Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL  Q+       + PSST  +            + G  + +  +   P
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP

Query:  NSINGGI------NTSSSTLNAYIHSPSSL---FSMPHHSFNTYPSSTSL----SPTFPMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPP
        N     I      N   S++  Y H    +    S+   S    P    L    S ++     D  R          + + NG  +E LDLELRLG  PP
Subjt:  NSINGGI------NTSSSTLNAYIHSPSSL---FSMPHHSFNTYPSSTSL----SPTFPMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPP

Q9SLB8 Zinc finger protein 118.2e-1555.41Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L          HH  P ++ NP   SS+SSS + + + P+
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT

Q9SR34 Transcriptional regulator TAC19.1e-0649.02Show/hide
Query:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSS
        RSY C++C R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L  +    + + +   S +S
Subjt:  RSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 101.1e-1958.06Show/hide
Query:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL-----HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFN
        + SWE  AFAED A   G+ WPPRSYTC++CRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL      +  P SSS+P  PS   S N +     T  FN
Subjt:  DDSWEVRAFAEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL-----HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFN

AT2G42410.1 zinc finger protein 115.8e-1655.41Show/hide
Query:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT
        WPP++YTC++CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L          HH  P ++ NP   SS+SSS + + + P+
Subjt:  WPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARL----------HHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPT

AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.3e-1533.67Show/hide
Query:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH-HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGI
        +D   ++G +WPPRSYTC++C+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL   Q+PSSSS P  P                             +PNPN      
Subjt:  EDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLH-HQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGI

Query:  NTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHS-FNTYPS-STSLSPTF---------PMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQ------------DEVLDLELRLG
                 Y +S  +    PHHS    +P+ S   SP +         P + +      +T   S  VE    ++            DE++ LEL +G
Subjt:  NTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHS-FNTYPS-STSLSPTF---------PMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQ------------DEVLDLELRLG

AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein9.0e-2542.16Show/hide
Query:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHH------QAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNG
        DDD+SWEV+AF +DT  N+ GTTWPPRSYTC +CRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R H        A S     +  S      + + II +   N 
Subjt:  DDDDSWEVRAFAEDT-ANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHH------QAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNG

Query:  GGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSPTFPMNNNDNHRRLETSTYS----ASVEKNNGSQDEVLDLELRLG
         G L   YQ  NP+ I G    S   +N Y    ++ F   +  F+   S   + P          R +E ST       S+++  G+  + LDLELRLG
Subjt:  GGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSPTFPMNNNDNHRRLETSTYS----ASVEKNNGSQDEVLDLELRLG

Query:  HGPP
        H PP
Subjt:  HGPP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.2e-1335Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C++C REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL  Q+       + PSST  +            + G  + +  +   P
Subjt:  EVRAF--AEDTANVMGTTWPPRSYTCTYCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHHQAPSSSSNPMKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNP

Query:  NSINGGI------NTSSSTLNAYIHSPSSL---FSMPHHSFNTYPSSTSL----SPTFPMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPP
        N     I      N   S++  Y H    +    S+   S    P    L    S ++     D  R          + + NG  +E LDLELRLG  PP
Subjt:  NSINGGI------NTSSSTLNAYIHSPSSL---FSMPHHSFNTYPSSTSL----SPTFPMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDEVLDLELRLGHGPP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCTGAGCTTGTGCTTGGATTCCAATACTCTTCTTCTTTACCTCATCTTTCTGAAACAACTCGAGACGGGCAGAATCCAGACAACGGTGTAAACCCTATGCAAAC
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ATTGTAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAACGTTCACCGTCGTGACCGTGCTCGCCTGCACCACCAAGCTCCTTCGTCGTCATCGAACCCT
ATGAAACCCTCTTCCACTTCTTCCTCAAATTCCAATTCTTTCATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGAGGAAGCTTGTGCCTTCTTTACCAATTCCCAAACCCTAA
TAGTATTAATGGTGGAATCAATACCTCTTCTTCCACATTAAATGCTTACATTCACTCACCCTCTTCTCTTTTCTCCATGCCACATCATTCCTTCAACACCTACCCGTCCT
CGACCTCGTTGTCCCCGACTTTTCCGATGAACAACAACGACAACCACCGTCGTCTCGAAACAAGTACTTACTCAGCCTCCGTGGAAAAGAATAACGGTAGCCAAGACGAA
GTACTTGATCTAGAGCTTAGACTTGGACATGGTCCACCTTCTTCAGCTCAAAATCTCATGGAAAAGGGAGAGAAGAAGATCTCTAATTTAGAAGCTGCATGTTTGAAGAA
GAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCTGAGCTTGTGCTTGGATTCCAATACTCTTCTTCTTTACCTCATCTTTCTGAAACAACTCGAGACGGGCAGAATCCAGACAACGGTGTAAACCCTATGCAAAC
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ATTGTAGAAGAGAGTTTAGGTCAGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAACGTTCACCGTCGTGACCGTGCTCGCCTGCACCACCAAGCTCCTTCGTCGTCATCGAACCCT
ATGAAACCCTCTTCCACTTCTTCCTCAAATTCCAATTCTTTCATCATCCCAACTCCTGATTTTAATGGTGGAGGAAGCTTGTGCCTTCTTTACCAATTCCCAAACCCTAA
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GAGATCATCAGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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MKPSSTSSSNSNSFIIPTPDFNGGGSLCLLYQFPNPNSINGGINTSSSTLNAYIHSPSSLFSMPHHSFNTYPSSTSLSPTFPMNNNDNHRRLETSTYSASVEKNNGSQDE
VLDLELRLGHGPPSSAQNLMEKGEKKISNLEAACLKKRSSD