; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005580 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005580
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionNAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic
Genome locationtig00000638:5958..8219
RNA-Seq ExpressionPI0005580
SyntenyPI0005580
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Homology Show/hide homology
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QKX48535.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 2 [Luffa acutangula]2.3e-21782.65Show/hide
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G3ETU2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, chloroplastic8.7e-21883.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P0CC50 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic2.4e-22083.14Show/hide
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P0CC51 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B, chloroplastic2.4e-22083.14Show/hide
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P0CC92 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic2.2e-21882.35Show/hide
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P0CC93 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 B, chloroplastic2.2e-21882.35Show/hide
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P0CD32 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic1.4e-21782.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07689.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein4.2e-0733.57Show/hide
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                 + F  K  LF+       YFL  +G++TSV+
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ATCG00890.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein5.3e-14374.74Show/hide
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        LAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFA I+ FGLRTGTDNIRDYAG   K  F +L   + L+ L      + FF K  LFWC
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ATCG01250.1 NADH-Ubiquinone/plastoquinone (complex I) protein5.3e-14374.74Show/hide
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        YNS    + L                          S     +F    S   + + +   F   FYFSSNEWHLLLEILAILSMI GNLIAITQTSMKRM
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Query:  LAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFARIVSFGLRTGTDNIRDYAGYTQKILFGSLFSPMSLI-LRRSSSTSRFFRKTSLFWC
        LAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFA I+ FGLRTGTDNIRDYAG   K  F +L   + L+ L      + FF K  LFWC
Subjt:  LAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFARIVSFGLRTGTDNIRDYAGYTQKILFGSLFSPMSLI-LRRSSSTSRFFRKTSLFWC

Query:  VEAGRLYFLVSIGLLTSVVSIYYYLKIIKLLMTGRNQEITPHVRNYRRSPLRSNNSIELSMIVCVIASTIPGISMNPIIEIAQDTLFS
             LYFLVSIGLLTSV+SIYYYLKIIKLLMTGRNQEITPH+RNYR SPLRSNNSIELSMIVCVIASTIPGISMNPII IAQDTLFS
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ATMG00285.1 NADH dehydrogenase 2A6.7e-2127.93Show/hide
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        RI    F+L L     + PE  +I    +LL   ++ STS + D P L   +    L+  +  LL      P+++     ++  F+ +NF    Q  +LL
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Query:  CSTLCIPLSVEYIECTEMAITEFLLFVLTATLGGMFLCGANDLITIFVAPECFSLCSYLLSGYTKKDVRSNEATTKYLLMGGASSSILVHGFSWLYGSSG
         +   I +  +  +       EF++ +   T G +F+  A+DLI +++A E  SLC Y+++   +K   S EA +KYL++G  SS IL+ G S +YGS+G
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Query:  GE--IELQEIVNGLLNTQMYNSQEFQLRLYSSLRCFSF------------CYFESS------------CFSFSHSNFRYSFYFS-SNEWHLLLEILAILS
             +L +I+ G   T   +S  F + + S    F F              +E S              S S +  R S Y S       +    +I S
Subjt:  GE--IELQEIVNGLLNTQMYNSQEFQLRLYSSLRCFSF------------CYFESS------------CFSFSHSNFRYSFYFS-SNEWHLLLEILAILS

Query:  MILGNLIAITQTSMKRMLAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFARIVSFGLRTGTDNIRDYAGYTQKILFGSL-FSPMSLILR
        MILG L A+ QT +KR LA+SSIG +GY+  G   G    G  S++  +  Y  M +  FA IVS   +T    I D     +     ++ FS       
Subjt:  MILGNLIAITQTSMKRMLAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLFYIAMNLGTFARIVSFGLRTGTDNIRDYAGYTQKILFGSL-FSPMSLILR

Query:  RSSSTSRFFRKTSLFWCVEAGRLYFLVSIGLLTSVVSIYYYLKIIKLLMTGRNQEITPHVRNYRRSPLRSNNSIELSMIVCVIASTI
             + F  K  LF+       YFL  +G++TSV+  +YY++++K +        TP        P+  N S+ L+M    I S++
Subjt:  RSSSTSRFFRKTSLFWCVEAGRLYFLVSIGLLTSVVSIYYYLKIIKLLMTGRNQEITPHVRNYRRSPLRSNNSIELSMIVCVIASTI

ATMG01320.1 NADH dehydrogenase 2B6.7e-2127.93Show/hide
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        RI    F+L L     + PE  +I    +LL   ++ STS + D P L   +    L+  +  LL      P+++     ++  F+ +NF    Q  +LL
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         +   I +  +  +       EF++ +   T G +F+  A+DLI +++A E  SLC Y+++   +K   S EA +KYL++G  SS IL+ G S +YGS+G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCTAATTTTTGGCCTAATTCTTCTTCTGATGATCGATTCAACCTCTGATCAAAAAGATATACCTTGGTTATATTTCATCTCTTCAACAAGTTTAGTAATGAGCATAACGG
CCCTATTGTTCCGATGGAGAGAAGAACCTATGATTAGCTTTTCGGGAAATTTCCAAACGAACAATTTCAACGAAATCTTTCAATTTCTTATTTTACTATGTTCAACTCTA
TGTATTCCTCTATCCGTAGAGTACATTGAATGTACAGAAATGGCTATAACAGAGTTTCTGTTATTCGTATTAACAGCTACTCTAGGAGGAATGTTTTTATGCGGTGCTAA
TGATTTAATAACTATCTTTGTAGCTCCAGAATGTTTCAGTTTATGCTCCTACCTATTATCTGGATATACCAAGAAAGATGTACGGTCTAATGAGGCTACTACGAAATATT
TACTCATGGGTGGGGCAAGTTCTTCTATTCTGGTTCATGGTTTCTCTTGGCTATATGGTTCATCCGGGGGAGAGATCGAGCTTCAAGAAATAGTAAATGGTCTTCTCAAT
ACACAAATGTATAACTCCCAGGAATTTCAATTGCGCTTATATTCATCACTTCGTTGCTTTTCTTTCTGTTACTTCGAAAGTAGCTGCTTCAGCTTCAGCCACTCGAATTT
TCGATATTCCTTTTATTTCTCATCAAACGAATGGCATCTTCTTCTGGAAATCCTAGCTATTCTTAGCATGATATTGGGGAATCTCATTGCTATTACTCAAACAAGCATGA
AACGTATGCTTGCGTATTCGTCCATCGGTCAAATCGGATATGTAATTATTGGAATAATTGTTGGAGACTCAAATGGTGGATATGCAAGCATGATAACTTATATGCTCTTC
TATATCGCCATGAATCTAGGAACTTTTGCTCGCATTGTATCATTTGGTCTACGTACCGGAACTGATAACATTCGAGATTATGCAGGATATACACAAAAGATCCTCTTTGG
CTCTCTCTTTAGCCCTATGTCTCTTATCCTTAGGAGGTCTTCCTCCACTAGCAGGTTTTTTCGGAAAACTTCATTATTCTGGTGTGTGGAGGCAGGCAGGCTATATTTCT
TGGTTTCAATAGGACTACTTACGAGCGTTGTTTCTATCTACTATTATCTAAAAATAATCAAGTTATTAATGACTGGACGAAACCAAGAAATAACCCCTCACGTGCGAAAT
TATAGAAGATCTCCTTTAAGATCAAACAATTCCATCGAATTGAGTATGATTGTATGTGTGATAGCATCTACTATACCAGGAATATCAATGAACCCGATTATTGAAATTGC
TCAGGATACCCTTTTTAGTTTAGCTTCTAGAATCTATTTCTTAGTTCAAGATCCCTCTTACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTAATTCATGATCTGGCATGTACAGAATGAAAACTTCATTCTCGATTCTACGAGAATTTTTATGAAAGCCTTTCATTTGCTTCTCTTCGATGGAAGTTTTATTTTCCCA
GAATGTATCCTAATTTTTGGCCTAATTCTTCTTCTGATGATCGATTCAACCTCTGATCAAAAAGATATACCTTGGTTATATTTCATCTCTTCAACAAGTTTAGTAATGAG
CATAACGGCCCTATTGTTCCGATGGAGAGAAGAACCTATGATTAGCTTTTCGGGAAATTTCCAAACGAACAATTTCAACGAAATCTTTCAATTTCTTATTTTACTATGTT
CAACTCTATGTATTCCTCTATCCGTAGAGTACATTGAATGTACAGAAATGGCTATAACAGAGTTTCTGTTATTCGTATTAACAGCTACTCTAGGAGGAATGTTTTTATGC
GGTGCTAATGATTTAATAACTATCTTTGTAGCTCCAGAATGTTTCAGTTTATGCTCCTACCTATTATCTGGATATACCAAGAAAGATGTACGGTCTAATGAGGCTACTAC
GAAATATTTACTCATGGGTGGGGCAAGTTCTTCTATTCTGGTTCATGGTTTCTCTTGGCTATATGGTTCATCCGGGGGAGAGATCGAGCTTCAAGAAATAGTAAATGGTC
TTCTCAATACACAAATGTATAACTCCCAGGAATTTCAATTGCGCTTATATTCATCACTTCGTTGCTTTTCTTTCTGTTACTTCGAAAGTAGCTGCTTCAGCTTCAGCCAC
TCGAATTTTCGATATTCCTTTTATTTCTCATCAAACGAATGGCATCTTCTTCTGGAAATCCTAGCTATTCTTAGCATGATATTGGGGAATCTCATTGCTATTACTCAAAC
AAGCATGAAACGTATGCTTGCGTATTCGTCCATCGGTCAAATCGGATATGTAATTATTGGAATAATTGTTGGAGACTCAAATGGTGGATATGCAAGCATGATAACTTATA
TGCTCTTCTATATCGCCATGAATCTAGGAACTTTTGCTCGCATTGTATCATTTGGTCTACGTACCGGAACTGATAACATTCGAGATTATGCAGGATATACACAAAAGATC
CTCTTTGGCTCTCTCTTTAGCCCTATGTCTCTTATCCTTAGGAGGTCTTCCTCCACTAGCAGGTTTTTTCGGAAAACTTCATTATTCTGGTGTGTGGAGGCAGGCAGGCT
ATATTTCTTGGTTTCAATAGGACTACTTACGAGCGTTGTTTCTATCTACTATTATCTAAAAATAATCAAGTTATTAATGACTGGACGAAACCAAGAAATAACCCCTCACG
TGCGAAATTATAGAAGATCTCCTTTAAGATCAAACAATTCCATCGAATTGAGTATGATTGTATGTGTGATAGCATCTACTATACCAGGAATATCAATGAACCCGATTATT
GAAATTGCTCAGGATACCCTTTTTAGTTTAGCTTCTAGAATCTATTTCTTAGTTCAAGATCCCTCTTACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIWHVQNENFILDSTRIFMKAFHLLLFDGSFIFPECILIFGLILLLMIDSTSDQKDIPWLYFISSTSLVMSITALLFRWREEPMISFSGNFQTNNFNEIFQFLILLCSTL
CIPLSVEYIECTEMAITEFLLFVLTATLGGMFLCGANDLITIFVAPECFSLCSYLLSGYTKKDVRSNEATTKYLLMGGASSSILVHGFSWLYGSSGGEIELQEIVNGLLN
TQMYNSQEFQLRLYSSLRCFSFCYFESSCFSFSHSNFRYSFYFSSNEWHLLLEILAILSMILGNLIAITQTSMKRMLAYSSIGQIGYVIIGIIVGDSNGGYASMITYMLF
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YRRSPLRSNNSIELSMIVCVIASTIPGISMNPIIEIAQDTLFSLASRIYFLVQDPSY