; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005829 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005829
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4
Genome locationchr11:4286695..4289008
RNA-Seq ExpressionPI0005829
SyntenyPI0005829
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008458465.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497865 isoform X1 [Cucumis melo]3.4e-3888.89Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASS+DST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESG+LDSGDV ASDSGN LEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
XP_008458466.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497865 isoform X2 [Cucumis melo]3.4e-3888.89Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASS+DST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESG+LDSGDV ASDSGN LEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
XP_011657169.1 uncharacterized protein LOC101223121 [Cucumis sativus]2.8e-4092.93Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
XP_023006464.1 uncharacterized protein LOC111499180 [Cucurbita maxima]5.1e-3482.83Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDS +ASSLKMES+VDRKPPP  AEKARESG+LDSGDV  S+SGN+LEERDPQFDAML+QM GRI+SKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
XP_038875975.1 uncharacterized protein LOC120068322 [Benincasa hispida]7.9e-3584.85Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDST ASSLKMES+ DRKPPP VAEKARESGALD GDV  S+SGN+LEERDPQFDAML+QMVGRI+SKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KCC5 Uncharacterized protein1.4e-4092.93Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
A0A1S3C7E9 uncharacterized protein LOC103497865 isoform X21.7e-3888.89Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASS+DST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESG+LDSGDV ASDSGN LEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
A0A1S3C957 uncharacterized protein LOC103497865 isoform X11.7e-3888.89Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASS+DST ASSLKMESIVDRKPPP VAEKARESG+LDSGDV ASDSGN LEERDPQFDAML+QMVGRIKSKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
A0A6J1H4J6 uncharacterized protein LOC1114599759.5e-3482.83Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDS +ASSLKMES+VDRKPPP  AEKARESGALDSGDV  S+S N+LEERDPQFDAML+QM GRI+SKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
A0A6J1L288 uncharacterized protein LOC1114991802.5e-3482.83Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
        MGQAFRRAAGRIKPASSIDS +ASSLKMES+VDRKPPP  AEKARESG+LDSGDV  S+SGN+LEERDPQFDAML+QM GRI+SKPGGKLEMGE   V+
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQ
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G21400.1 unknown protein1.8e-1345.71Show/hide
Query:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAAS----SLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEK
        MGQ  RRA G+IK       +  S    SL  E +   K  P     A   G  D G   + D  N+LEERDP++D MLNQMVGRIK+KPGGK EMGE  
Subjt:  MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAAS----SLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEK

Query:  KVQAT
         V+ +
Subjt:  KVQAT

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGACAGGCATTTCGTCGAGCAGCTGGAAGAATCAAACCGGCTTCGAGTATCGATTCCACTGCCGCGTCTTCGTTGAAAATGGAGAGCATCGTCGATCGGAAGCCTCC
GCCGCTTGTGGCCGAGAAGGCTCGGGAGAGTGGCGCTCTTGATTCCGGTGATGTCCCGGCAAGTGATTCGGGAAACATGCTTGAAGAACGAGATCCCCAATTTGATGCCA
TGCTTAACCAAATGGTGGGTCGAATAAAATCAAAGCCCGGAGGAAAACTTGAGATGGGGGAGGAGAAAAAAGTCCAAGCTACACCACAATGGAATTTTTTTTTTATAATA
ACTCCTTACTTCAAAATCGTGGTGGTAAATCACATCAGAAGTATGGAGATTTATTTATCTCCATATATATATTGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGACAGGCATTTCGTCGAGCAGCTGGAAGAATCAAACCGGCTTCGAGTATCGATTCCACTGCCGCGTCTTCGTTGAAAATGGAGAGCATCGTCGATCGGAAGCCTCC
GCCGCTTGTGGCCGAGAAGGCTCGGGAGAGTGGCGCTCTTGATTCCGGTGATGTCCCGGCAAGTGATTCGGGAAACATGCTTGAAGAACGAGATCCCCAATTTGATGCCA
TGCTTAACCAAATGGTGGGTCGAATAAAATCAAAGCCCGGAGGAAAACTTGAGATGGGGGAGGAGAAAAAAGTCCAAGCTACACCACAATGGAATTTTTTTTTTATAATA
ACTCCTTACTTCAAAATCGTGGTGGTAAATCACATCAGAAGTATGGAGATTTATTTATCTCCATATATATATTGGTGAGGAGGCAAGTTTTATTCTTTTATTTGGAAGAA
ATTTTTTCTGATCCTTCTTGGTCTAAGCAATTTAGGCAAGGAGATTCCTCTTCTCTTTGGCTTTCTGGATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGQAFRRAAGRIKPASSIDSTAASSLKMESIVDRKPPPLVAEKARESGALDSGDVPASDSGNMLEERDPQFDAMLNQMVGRIKSKPGGKLEMGEEKKVQATPQWNFFFII
TPYFKIVVVNHIRSMEIYLSPYIYW