; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0005884 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0005884
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationchr03:7896579..7902514
RNA-Seq ExpressionPI0005884
SyntenyPI0005884
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140918.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]1.1e-18495.18Show/hide
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XP_038885313.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]3.5e-17589.83Show/hide
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XP_038885315.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]6.4e-17790.86Show/hide
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A0A0A0KE83 Uncharacterized protein5.3e-18595.18Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X12.5e-18796.03Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic1.7e-16788.83Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic2.2e-16789.14Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic5.0e-16789.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D2WKD9 Farnesol dehydrogenase9.7e-1931.96Show/hide
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         L EV+ TN +GL++C ++A + M  +   GHI +I+   G      P+   Y A+K +V  +T++++ ELR      + V ++SPG+V T++L
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic7.1e-5447.6Show/hide
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        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD VVI SRS E V  ++  L E   E                 V GT CDV + EDVK LV F +  L  IDIWI
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        NNAG+N   F+PLV  SDED+ ++V+TN +G ++C REA+ +M +Q +GGH+FN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     SL  E R      V VH
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic2.9e-13282.37Show/hide
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        ++  MVPPYNVLITGSTKGIGYALA++FLK GDNVVICSRSAERVES+V  L++EFGEQHVWG  CDVREG+DVK LV F +  +KYIDIWINNAGSNAY
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        S+KPLVE SDE L+EV+TTN LGLMICCREAI MM NQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M +V NV+VHNLSPGMVT
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Query:  TDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
        TDLLMSGA TKQAKFFIN+LAEP  VVA+YLVPNIR+IPTN S +PTYIRFLTGLKAYS+IFSR+AFGARRN+Y+ ED
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic1.5e-13675Show/hide
Query:  FIPPPFQIRLSLYKFKSFSLSIPRSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ
        F+ P  + RL   +F   ++ + R         N  V  +S + + +   ++EPM PPYN+LITGSTKGIGYALAR+FLK GDNVVICSRSAERVE++VQ
Subjt:  FIPPPFQIRLSLYKFKSFSLSIPRSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ

Query:  SLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA
        SL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGA
Subjt:  SLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA

Query:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIR
        GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIR
Subjt:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIR

Query:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
        FLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY+ E+
Subjt:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED

Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic6.2e-5044Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10310.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein3.0e-1531.19Show/hide
Query:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP
        +V    VLITG +KG+G ALA +  K G  V+ C+RS E++ +    L       H+  T  DV+    V+ +   + +     DI +NNAG+   + K 
Subjt:  MVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKP

Query:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL
        + E S ED   V+ TN  G+    R  I +ML + +G  +    G G  G      A Y A+K ++  L++++  E+    V+ + V  L+PG++ T+LL
Subjt:  LVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLL

Query:  MS
         S
Subjt:  MS

AT1G24360.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.4e-1428.95Show/hide
Query:  TNSVVNSNSVSTK--PQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVA
        + SVV + + +T+  P E  QK   V    V+ITG+++GIG A+A    K G  V++  +RSA+  E   + + E  G+   +G   DV +  DV  ++ 
Subjt:  TNSVVNSNSVSTK--PQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVI-CSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVA

Query:  FVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTK
                ID+ +NNAG    +   L+        EV+  N  G+ +C + A+K+M+ + R G I NI       G+ G+     A Y A K  V+  +K
Subjt:  FVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA----GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTK

Query:  SLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL
        +   E      +N+ V+ + PG + +D+
Subjt:  SLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDL

AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein4.4e-5144Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITGST+G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.6e-4843.2Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI
        P NV+ITG  +G+G ALAR+FL  GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L  I+IWI
Subjt:  PYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWI

Query:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH
        NNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E       NV +H
Subjt:  NNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVH

Query:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  NLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT5G04900.1 NYC1-like1.1e-13775Show/hide
Query:  FIPPPFQIRLSLYKFKSFSLSIPRSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ
        F+ P  + RL   +F   ++ + R         N  V  +S + + +   ++EPM PPYN+LITGSTKGIGYALAR+FLK GDNVVICSRSAERVE++VQ
Subjt:  FIPPPFQIRLSLYKFKSFSLSIPRSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNVVICSRSAERVESSVQ

Query:  SLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA
        SL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGHIFNIDGA
Subjt:  SLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGA

Query:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIR
        GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS +PTYIR
Subjt:  GSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIR

Query:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
        FLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY+ E+
Subjt:  FLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTTCAACTTCTTCTTCTTCTTCCTCCCTCCTCTTGACGTCTCCGTTCATCTTCCATAACCATGGCTCATTCATCCCTCCTCCTTTTCAAATCCGCTTATCACT
CTACAAATTCAAGAGTTTCAGTCTTTCCATACCTCGTTCGCGCAAGATTTCCAACATTCCGACGAACAGCGTCGTGAATTCCAATTCCGTATCCACAAAGCCCCAAGAAT
TTCAGCAGAAGGAGCCTATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACTGGCTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCTAGACAGTTTCTGAAAGAAGGTGACAATGTC
GTTATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTTGAATCTTCTGTTCAAAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGATGTGCGAGAAGGAGA
GGATGTAAAGAATTTAGTTGCATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAACCTTTGGTCGAGGCTT
CAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACAACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTC
AACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGACGACCAACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCGTTACAGGCAGAACTGCG
GATGCAGGACGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTTATGTCTGGTGCTAATACGAAGCAGGCGAAATTTTTCATCAATG
TTTTGGCGGAACCACCTGAAGTGGTGGCAGAATATCTCGTCCCAAACATAAGATCCATCCCAACCAATGGTTCAAGAAGGCCCACATACATTCGTTTCCTCACTGGACTA
AAAGCTTATTCCCAGATTTTCTCAAGACTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAGATATCTTCTAGAAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACTAGACGTTGCTTAAAGAAAAACGAGAAACTAAAAAATTTTATCCATAAATTAATCAATCTGGAAATTTCTACCGCGCAGAAATGGCTTCTTCAACTTCTTCTTCTTCT
TCCTCCCTCCTCTTGACGTCTCCGTTCATCTTCCATAACCATGGCTCATTCATCCCTCCTCCTTTTCAAATCCGCTTATCACTCTACAAATTCAAGAGTTTCAGTCTTTC
CATACCTCGTTCGCGCAAGATTTCCAACATTCCGACGAACAGCGTCGTGAATTCCAATTCCGTATCCACAAAGCCCCAAGAATTTCAGCAGAAGGAGCCTATGGTTCCTC
CTTACAACGTTTTGATCACTGGCTCCACTAAAGGAATAGGATATGCATTGGCTAGACAGTTTCTGAAAGAAGGTGACAATGTCGTTATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGG
GTTGAATCTTCTGTTCAAAGCTTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGATGTGCGAGAAGGAGAGGATGTAAAGAATTTAGTTGCATTTGT
GCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAACCTTTGGTCGAGGCTTCAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCA
CAACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGGGGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGA
CGACCAACCCCTAGGTTTGCTGCATACGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACGAAGTCGTTACAGGCAGAACTGCGGATGCAGGACGTGAAAAATGTTGTAGT
GCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTTATGTCTGGTGCTAATACGAAGCAGGCGAAATTTTTCATCAATGTTTTGGCGGAACCACCTGAAGTGGTGG
CAGAATATCTCGTCCCAAACATAAGATCCATCCCAACCAATGGTTCAAGAAGGCCCACATACATTCGTTTCCTCACTGGACTAAAAGCTTATTCCCAGATTTTCTCAAGA
CTTGCTTTTGGTGCAAGAAGAAACAGATATCTTCTAGAAGATTGATACGAAAAGAATAATTTTTACAAGTACAATTTCCCATCCTCATGGTGGACCCATTGGACTGCTAA
AACACGACGCAAAGGAAATGATGCCTTCTTGTCTTCCACCTCTCTCTCCCTCTCTATAAAAACTGTTGTTTTTTTTTTTCATTGATTTACTCGATAAATGATCAATTGTA
ATTTATTGTTTATATTTACTTTAAAAATTGTGCTCTATCATTTTTTTTATTCGTTTTTACCATAGCATTGGCTGAATATTTTCCTTTCTTCAAATGTAACTGAACAGGGG
TTGCATTAACTTGGAGATATCGTTCGAGGAGGTTGCTATAATGTGATGTATAGAAGAGAAGCAAAAGTACTTTAAATATGTTTAATAGCACACAAATTTTTTAGTCTATA
TCAACTTTAGGTATGAAAGTGATTTTGAAATAGGTGAAATTACTTTTCTTATACTCAAAATTACTATAAAACACATTTTTATTCATTCAAAATTGGTTTAGGATTTTTTT
TTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASSTSSSSSSLLLTSPFIFHNHGSFIPPPFQIRLSLYKFKSFSLSIPRSRKISNIPTNSVVNSNSVSTKPQEFQQKEPMVPPYNVLITGSTKGIGYALARQFLKEGDNV
VICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIF
NIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSRRPTYIRFLTGL
KAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED