; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0006138 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0006138
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1218)
Genome locationchr07:3587647..3590815
RNA-Seq ExpressionPI0006138
SyntenyPI0006138
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR009606 - Modifying wall lignin-1/2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576843.1 Protein MODIFYING WALL LIGNIN-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-5258.94Show/hide
Query:  FSACHFPLNKFLLLSSFSFPAIEILVPTPKPPP------KTLILSLLFIYFYFIFYSS---SYSQEMEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKG
        FSAC F L+++LLL              P PP         LI S       F+  +S   S + EME+K AL V  VVA LG++++ATGFAAE TR KG
Subjt:  FSACHFPLNKFLLLSSFSFPAIEILVPTPKPPP------KTLILSLLFIYFYFIFYSS---SYSQEMEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKG

Query:  NQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCY
        NQV++V P MCKYP+SPA  LGLTAALSLL AQI I  STGC+CC RGPRPPASKWRTAV+CF +SW T+VIAFLL LTGAALN+GR EQ +YF  Y CY
Subjt:  NQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCY

Query:  VLKPGVF
        VLKPGVF
Subjt:  VLKPGVF

XP_004146885.1 uncharacterized protein LOC101221478 [Cucumis sativus]4.7e-6790.91Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+K+AL+V+YVVAILGIVMIATGFAAEATRTK NQV KVAPD+CKYPRSPA+GLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        W+TYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYF  Y CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

XP_008453825.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494435 [Cucumis melo]1.9e-6387.41Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+KAALVV++VVA LGIVMIATGFAAEATRTKG QV +VAPD+CKYPRSPAMGLG TAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPP  KWRTAVICFT+S
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        WITYVIAFLLFLTGAALNNGR +QRNY G+Y+CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

XP_023551924.1 uncharacterized protein LOC111809750 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-5173.76Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+K AL V  VVAILG++++ATGFAAE TR KGNQV++V P MCKYP+SPA  LGLTAALSLL AQI I  STGC+CC RGPRPPASKWRTAV+CF +S
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF
        W T+VIAFLL LTGAALN GR EQ +YF  Y CYVLKPGVF
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF

XP_038903791.1 uncharacterized protein LOC120090266 [Benincasa hispida]2.2e-5680.42Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+KA LV   VV ILGI+M+ATGFAAEATRTK N V  VAP+MCKYPRSPAMGLGLTAAL+LLFAQI +KA TGC+CC+RGPRPPASKWRTAVICFTIS
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        WI YVIA LLFLTGAALN+G GE+ N+FGSY+CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU80 Uncharacterized protein2.3e-6790.91Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+K+AL+V+YVVAILGIVMIATGFAAEATRTK NQV KVAPD+CKYPRSPA+GLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        W+TYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYF  Y CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

A0A1S3BX72 uncharacterized protein LOC1034944359.0e-6487.41Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+KAALVV++VVA LGIVMIATGFAAEATRTKG QV +VAPD+CKYPRSPAMGLG TAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPP  KWRTAVICFT+S
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        WITYVIAFLLFLTGAALNNGR +QRNY G+Y+CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

A0A5D3D069 DUF1218 domain-containing protein9.0e-6487.41Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+KAALVV++VVA LGIVMIATGFAAEATRTKG QV +VAPD+CKYPRSPAMGLG TAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPP  KWRTAVICFT+S
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF
        WITYVIAFLLFLTGAALNNGR +QRNY G+Y+CYVLKPGVF F
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFF

A0A6J1CG96 uncharacterized protein LOC1110114035.6e-5070.92Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+KA  V   VVA LG++++ATGFAAE TR K +QVI+V P+ C YPRSPA+GLGL AALSLL AQ+TI  STGC+CCIRGPRPPASKWRT V+CF IS
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF
        W T++IAFLL LTGAALN+ RGE+  YFG Y+CYVLKPGVF
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF

A0A6J1E6P1 uncharacterized protein LOC1114304661.3e-5173.05Show/hide
Query:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS
        ME+K AL V  VVA LG++++ATGFAAE TR KGNQV++V P MCKYP+SPA  LGLTAALSLL AQI I  STGC+CC RGPRPPASKWRTAV+CF +S
Subjt:  MEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTIS

Query:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF
        W T+VIAFLL LTGAALN+GR EQ +YF  Y CYVLKPGVF
Subjt:  WITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G68220.1 Protein of unknown function (DUF1218)2.1e-0426.39Show/hide
Query:  ALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPD------MCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTI
        A+ V  +  +  + ++A  FA  A R +   V    PD      +CKY    +   G++A   LL +Q  +   T C+C  +G     S    A++ F +
Subjt:  ALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPD------MCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTI

Query:  SWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQ--CYVLKPGVF
        SW++++ A    L G+A N    +    +   +  C VL  GVF
Subjt:  SWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQ--CYVLKPGVF

AT4G27435.1 Protein of unknown function (DUF1218)9.0e-0829.08Show/hide
Query:  AALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGN--QVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWI
        A+ +V  +V +  ++      AAE  R+     Q  +V  + C Y    A G G+ A L  + +QI I   + C CC + P  P      A+I F +SW+
Subjt:  AALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGN--QVIKVAPDMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWI

Query:  TYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYF--GSYQCYVLKPGVF
         ++IA +  L G+  N    + R  F      C  L+ GVF
Subjt:  TYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYF--GSYQCYVLKPGVF

AT5G17210.1 Protein of unknown function (DUF1218)8.1e-3347.89Show/hide
Query:  KKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPD---MCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTI
        ++  +V+  V+ +LG++   T F AEATR K +QV     D    C YPRSPA  LG T+AL L+ AQI +  S+GC CC +GP P  S W  ++ICF +
Subjt:  KKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAPD---MCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTI

Query:  SWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF
        SW T+VIAFL+ L+GAALN+   E+    G+Y CY++KPGVF
Subjt:  SWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF

AT5G17210.2 Protein of unknown function (DUF1218)1.7e-2754.64Show/hide
Query:  CKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF
        C YPRSPA  LG T+AL L+ AQI +  S+GC CC +GP P  S W  ++ICF +SW T+VIAFL+ L+GAALN+   E+    G+Y CY++KPGVF
Subjt:  CKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTTCATTCATAGTACGCAACGTCAAAGTTTCAGCGCCTGTCATTTTCCCCTCAACAAATTTCTCCTACTCTCTTCCTTCTCCTTCCCCGCCATTGAAATACTCGT
CCCTACTCCTAAACCTCCACCCAAAACTCTCATCCTTTCTCTTTTATTTATTTATTTTTATTTTATTTTTTATTCTTCCAGTTACTCGCAGGAGATGGAGAAGAAGGCGG
CTCTGGTGGTGCGTTATGTGGTTGCTATTTTAGGGATTGTGATGATCGCCACTGGCTTCGCCGCTGAAGCCACAAGAACTAAGGGGAATCAAGTTATTAAAGTTGCTCCT
GATATGTGCAAATATCCCCGAAGTCCAGCGATGGGCCTTGGTTTGACAGCCGCTCTATCGCTTTTGTTTGCTCAAATAACGATAAAGGCTTCGACGGGATGCGTTTGCTG
CATTAGAGGTCCTCGGCCTCCTGCTTCTAAATGGAGAACAGCTGTGATCTGCTTTACCATTTCGTGGATTACATATGTGATAGCATTCCTCCTGTTCCTCACCGGTGCTG
CACTGAACAACGGACGGGGCGAACAAAGAAACTATTTCGGTTCCTATCAGTGCTATGTTCTAAAACCTGGAGTTTTTTTCTTTCGCCACCATTATAGGTGCTGCAAGTTT
ATCACTGGGAATGTCCTACTTCCTCATATTGAACTCTGCAAAGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATCAAAGGTAAAACGCCGTCGTTTACTGTCACCGCCACATCTTCCTCGCAACTACAATCCAAATTCCAAGTACTTTATGTCCTTCATTCATAGTACGCAACGTCAAAGTT
TCAGCGCCTGTCATTTTCCCCTCAACAAATTTCTCCTACTCTCTTCCTTCTCCTTCCCCGCCATTGAAATACTCGTCCCTACTCCTAAACCTCCACCCAAAACTCTCATC
CTTTCTCTTTTATTTATTTATTTTTATTTTATTTTTTATTCTTCCAGTTACTCGCAGGAGATGGAGAAGAAGGCGGCTCTGGTGGTGCGTTATGTGGTTGCTATTTTAGG
GATTGTGATGATCGCCACTGGCTTCGCCGCTGAAGCCACAAGAACTAAGGGGAATCAAGTTATTAAAGTTGCTCCTGATATGTGCAAATATCCCCGAAGTCCAGCGATGG
GCCTTGGTTTGACAGCCGCTCTATCGCTTTTGTTTGCTCAAATAACGATAAAGGCTTCGACGGGATGCGTTTGCTGCATTAGAGGTCCTCGGCCTCCTGCTTCTAAATGG
AGAACAGCTGTGATCTGCTTTACCATTTCGTGGATTACATATGTGATAGCATTCCTCCTGTTCCTCACCGGTGCTGCACTGAACAACGGACGGGGCGAACAAAGAAACTA
TTTCGGTTCCTATCAGTGCTATGTTCTAAAACCTGGAGTTTTTTTCTTTCGCCACCATTATAGGTGCTGCAAGTTTATCACTGGGAATGTCCTACTTCCTCATATTGAAC
TCTGCAAAGAATGACCCTTCTACTGTGTGGGGCCATCCTTCCGTTCCTCCTCAACCAAACATCGCAATGGCACAACCCCAGTTCCCACCCCCTCCTCCACCTCCACAGAG
AACTGCCGACCCCGTATTCGTTCACGAAGACACATACATGAGACGACAATTCACGTGATTGGAAAATGTAGGTCGACACCAAATGCGTTTAAGAAACAACCGTGTTAACT
CATACCACTAGATTGATGTATCTTTTTAAACCAGGGATTGAAGGTGCACAAATATGTTGGCTCTATAGAAATTATTTGTTTTGGAGTTGTATAGGCTCTCTTTCATAGAA
TTGATTTTGTGAAAGGTGTCATTTTATTTCCCTTTGATCCAAGGGAAGTGAATAAATTGTAATGTAATAAAATGTATATCCACTGTTGATTTGTTGTGGGAAGTAGCTGT
TTCTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFIHSTQRQSFSACHFPLNKFLLLSSFSFPAIEILVPTPKPPPKTLILSLLFIYFYFIFYSSSYSQEMEKKAALVVRYVVAILGIVMIATGFAAEATRTKGNQVIKVAP
DMCKYPRSPAMGLGLTAALSLLFAQITIKASTGCVCCIRGPRPPASKWRTAVICFTISWITYVIAFLLFLTGAALNNGRGEQRNYFGSYQCYVLKPGVFFFRHHYRCCKF
ITGNVLLPHIELCKE