; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0006594 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0006594
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationchr07:633879..634446
RNA-Seq ExpressionPI0006594
SyntenyPI0006594
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]5.7e-5390.83Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]1.4e-5188.43Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]6.4e-5289.26Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-5289.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein2.8e-5391.8Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 332.8e-5390.83Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 16.9e-5288.43Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 13.1e-5289.26Show/hide
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A0A6J5XM33 Uncharacterized protein8.2e-2957.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 333.6e-2652.89Show/hide
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Q945T0 Rapid alkalinization factor6.4e-2350.85Show/hide
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        P  L   +   AFF+     ++ A     + +W+    +   C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+PG
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 238.4e-2346.32Show/hide
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        +  +S   A+  ++  +A  V + S+A+ + S++ + ++   E  C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR
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Q9MA62 Protein RALF-like 223.9e-2064Show/hide
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Q9SRY3 Protein RALF-like 14.5e-2453.57Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 13.2e-2553.57Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1647.37Show/hide
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AT3G05490.1 ralf-like 222.8e-2164Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 236.0e-2446.32Show/hide
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        +  +S   A+  ++  +A  V + S+A+ + S++ + ++   E  C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR
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         N IPCSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 332.6e-2752.89Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAACTCCTCTTCTCCACCTGCCTTATCTACTCTCATTTTCACAATAGCCTTCTTCGTCTTTTCGTCCTCTTTAGCGATCATGGCCATGAGCAGTGACCGAAGTCT
CAATTGGCTCTCAACAGAAGCACGATGTCATGGACGTTCAATAAGCGAATGCATGATGAATATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTT
CGAGTTACATAAGTTACAAGTCATTGAGAGCAAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGG
GGTTGTACCGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGCAACCATGGGCAACTCCTCTTCTCCACCTGCCTTATCTACTCTCATTTTCACAATAGCCTTCTTCGTCTTTTCGTCCTCTTTAGCGATCATGGCCATGAGCAGTGAC
CGAAGTCTCAATTGGCTCTCAACAGAAGCACGATGTCATGGACGTTCAATAAGCGAATGCATGATGAATATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTT
AGCCACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCATTGAGAGCAAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCCGGAGCCGAAGCTAACCCGT
ATCAGCGGGGTTGTACCGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAAGAAAAACTCTATCTTCTTGTTTGATTTTTCCCGTTATTGTCTTTGTAACATAGAATAAATTTGAAAAAG
GCTGTTGCCATGTTTGGGTTTGGAGTGTTATCAAGTATTTAGATTTTAACATTATTGTAAACTTATCTTTATGTCTTTGTAACATTAATCTTTACAAATATAAAATAACA
AATTCTTGGGAGAAAATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GCTAITRCRS