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PI0006619 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0006619
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF3511)
Genome locationchr03:22714123..22715446
RNA-Seq ExpressionPI0006619
SyntenyPI0006619
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR021899 - Protein of unknown function DUF3511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039168.1 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 [Cucumis melo var. makuwa]4.9e-3897.7Show/hide
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XP_022930185.1 uncharacterized protein LOC111436683 [Cucurbita moschata]3.2e-3796.55Show/hide
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XP_022974055.1 uncharacterized protein LOC111472683 [Cucurbita maxima]1.3e-3594.25Show/hide
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XP_023536368.1 uncharacterized protein LOC111797558 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.2e-3796.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8Y3 Uncharacterized protein8.2e-3998.85Show/hide
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A0A2P5BV48 Uncharacterized protein5.3e-3079.31Show/hide
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        MEKS+SFP+YSS+ SGEFGF+ RSNSYNFNGP  K +GF TS+DPELQRK+RIASYNVF ME KVKSSV+NSFKWIK+KFSDIRYG+
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A0A5A7T8F8 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 82.4e-3897.7Show/hide
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A0A6J1EWA0 uncharacterized protein LOC1114366831.6e-3796.55Show/hide
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A0A6J1ICY9 uncharacterized protein LOC1114726836.5e-3694.25Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72720.1 Protein of unknown function (DUF3511)2.0e-0839Show/hide
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        EKS+S P           YS+ST   +   T     SN+ +      K  GF    + E+QRK+R+ASYNV+ +E +VK S+K SFKW K   S+  YGL
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AT2G19460.1 Protein of unknown function (DUF3511)3.1e-0655.56Show/hide
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        DP+LQRK+R+ SY  + +E K+K S + SFKWIK K
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AT3G05725.1 Protein of unknown function (DUF3511)1.4e-0645.45Show/hide
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        DPE++RKRR+A Y +++ E K+K +++ S+KWIK + S I +G+
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AT4G09890.1 Protein of unknown function (DUF3511)3.6e-1855.91Show/hide
Query:  MEKSKSFPKYSSS-TSGEFGF-QTRSNSYNFNGPTAKATGFSTSTDPELQRKRRIASYNVFNMENKVKSSVKNSFKWIKTKFS----DIRYGL
        M+ SKS+ +YSSS ++ EFG+ Q RSNSYNFNGP         +TDPE++RK+R+ASYN+F  E K+KS++KNSFKWIK KFS     IRY +
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AT5G11970.1 Protein of unknown function (DUF3511)8.8e-0938.82Show/hide
Query:  YSSSTSGEF-----GFQTRSNSYNFNGPTAKATGFSTS---TDPELQRKRRIASYNVFNMENKVKSSVKNSFKWIKTKFSDIRYG
        Y  +  G+F      + TR N+  ++    K+   S S   TDPELQRK+R+ASY ++ +E KVK S +NSF+W+K +++ + YG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAGAGCAAATCATTCCCCAAGTACTCATCCTCAACCTCGGGTGAGTTTGGTTTCCAAACTCGATCCAACTCTTACAATTTCAACGGCCCGACTGCAAAAGCAAC
CGGGTTCTCGACCTCGACCGATCCCGAGCTCCAAAGGAAGAGAAGGATTGCGTCTTATAATGTTTTCAACATGGAAAACAAAGTCAAGTCGAGTGTAAAGAACAGCTTCA
AGTGGATCAAAACTAAGTTTAGTGACATTCGCTATGGTTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAGATCAATTTGTTGAAGAAATTAAGGGCCAAGTTCTAGGCTATGGAGAAGAGCAAATCATTCCCCAAGTACTCATCCTCAACCTCGGGTGAGTTTGGTTTCCAAACT
CGATCCAACTCTTACAATTTCAACGGCCCGACTGCAAAAGCAACCGGGTTCTCGACCTCGACCGATCCCGAGCTCCAAAGGAAGAGAAGGATTGCGTCTTATAATGTTTT
CAACATGGAAAACAAAGTCAAGTCGAGTGTAAAGAACAGCTTCAAGTGGATCAAAACTAAGTTTAGTGACATTCGCTATGGTTTGTGAGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTT
CTTTTTTGATCACTGTGTAAACAAATTTGGCATTTTGATCTGTCTTTGAAGACTTGGAACCAAATTCAAGATATAATTAAAGAGTTTGGAAGGTGTGTGTGTGTTTGGCT
GTGGCTTTATTTTGTTTCTCCATGCAAATATATAAGCCTTTTTTTCCCAACATATACAAAATCATTTACCTCTAAATTTATTCTTATTTTGGCTGATCTTTTTTTCTAAT
TTCCGTTTTGATTGTGTATTTAGGTTGAATTTTAAAAATCCTCTCTCACCATAAGTTGGCTTCAATTATATGCATGAACTTTTTTTTTTATGGGTGGTAGATTAAACCTC
CAACCTTTGGGACAGAGGTCACTAGTTCAAGCTCACTTTGATTTGAAGTTTGTTATAAAACAATCATGGTAGGTAGTTTACCGCTAAATTCATAAAAGAAAGGGTAGATA
TGTATTTGCTTATGTGAACAAAATCTACACATACACACGAAAAGAAATAAGGGCACATATGCCTGATGTGAACCATAACTGTTGTTGCCATCTTCCTGATCCTTTCAACC
TCAGGCCATCAATTTTGTGTGTTTTTTGTTAAATGATTTTTTTTATGCAAATCTAATTCTCAAATTTACTTTCGATATGTATTTAGATTTGTTTATCTATTATTTTAACA
CATAATTAACCCAGCATAAAACTTTTCATCCATCAATTTAACAGCAAAAATCTTAAGAGTGTTGTTTTTATAAAAATAAAATTAAAGAAAATAAAACGTCCAACAGTTGA
TTTAAAAATTTTCAAAGTTTTGGAGATAATTGAAAATCAAAGTGTCATGGTTCCATAGTATTTTTGGTAATTTAAGCTTTATTTTGAAGTTAATATTTCTTTTAACAAAT
CTTATAAACATAGTTCATGGAAAGGGGTTGAATAAGCAATAACTTGGAGTGAGTACTTGAGAGCCATCTACCTATAAAAAAATATGTATATATAACTCCCTCTATTTACA
TTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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