; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0006803 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0006803
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationchr09:17754761..17755569
RNA-Seq ExpressionPI0006803
SyntenyPI0006803
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648529.1 hypothetical protein Csa_008197 [Cucumis sativus]1.6e-7892.53Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKP KPKLL F+TRA DPESPA DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST +ASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEK
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEK
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEK

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-8491.89Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK HKP+LL F+TRA DPES  +DSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]1.5e-8492.43Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKP KPKLL F+TRA DPESPA DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST +ASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]5.7e-8491.35Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK HKP+LL F+TRA DPES  +DSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]1.1e-7990.81Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTL     P KPKLL FVTRA DPESPAADSE  GSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTA+ SSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GK VI YHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein7.3e-8592.43Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKP KPKLL F+TRA DPESPA DSEQPGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST +ASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016672.8e-8491.35Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK HKP+LL F+TRA DPES  +DSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein9.5e-8591.89Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSK HKP+LL F+TRA DPES  +DSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST +ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELA+GKSVI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061193.9e-7886.1Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASA--SSVYLPPV
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKPHK K L FVTRA DPE+PAAD E PGSDGDDFE+RLAKVR +YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPV
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASA--SSVYLPPV

Query:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        PLKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELA+GK VI YHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+K+
Subjt:  PLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890226.2e-7687.03Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKPHKPK L FV RA DPESPAADSE P SDGDDFEDRLA  R + R GTGKKAEIRKARKS+KGSTA+ASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+ ALVLVELA+GK VI YHTPAIILIQ YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIKS
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein7.0e-4856.98Show/hide
Query:  FPNSLTLPSNSKPHKPKLLN-FVTRATDPES-------PAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPLKE
        FP+   +P+     KP  L  F   ATD ES       P     + G+D D FE RL+ +R RYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKE
Subjt:  FPNSLTLPSNSKPHKPKLLN-FVTRATDPES-------PAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD
        AVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL+LVELA+GKSV+ YHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATTCCCTAACTCTCTAACACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCCAAGCTTCTCAACTTCGTAACCAGAGCAACAGA
TCCGGAATCTCCCGCCGCGGATTCAGAACAACCTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGATTCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGG
CAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAAGGTTCTACCGCTTCTGCCTCGTCGGTGTATCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTG
GAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCTAGCGGAAAAAGCGTCATCACTTA
CCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGTATTTTGTGGCAGCGGTTGCTGCCCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGATGAAATCA
AAAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAGAAATAGAAAACCCAAAAATATAAGGCCCAAACGGTTACAGCGAGTTTATCCTCGAGCTCAGATTTCTCCTCCCATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCACTACAATT
CCCTAACTCTCTAACACTTCCTTCCAATTCAAAGCCTCACAAGCCCAAGCTTCTCAACTTCGTAACCAGAGCAACAGATCCGGAATCTCCCGCCGCGGATTCAGAACAAC
CTGGATCTGACGGCGACGATTTCGAGGACCGACTCGCCAAAGTCCGATTCCGATACCGAAGCGGAACAGGAAAGAAGGCAGAGATACGGAAGGCTCGGAAGTCCAAGAAA
GGTTCTACCGCTTCTGCCTCGTCGGTGTATCTACCGCCAGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGACTTAAAGTGGAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGAT
CAATGGTTGGATTGCGATACTCGGAATATCGGCGTTGGTTCTTGTGGAATTGGCTAGCGGAAAAAGCGTCATCACTTACCATACGCCGGCGATTATACTGATTCAAGTGT
ATTTTGTGGCAGCGGTTGCTGCCCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGATGAAATCAAAAGTTAGAATGAAGCTTTCTTTAATAAATTC
AGTATTTTTTTTGGCTTGATTTTCATTTTCTGTTTCTGAATTTCTACATTTATTTTGAGTTATGTATGAATGAATGAATGAACCCAAGAACTAGAAATGTAAAAAAGTGG
TTCAAGTGTTTAATTTAAATTATATTTATCGTTTAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLTLPSNSKPHKPKLLNFVTRATDPESPAADSEQPGSDGDDFEDRLAKVRFRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTASASSVYLPPVPLKEAVSGGLKV
EFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELASGKSVITYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKS