; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0006941 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0006941
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationchr03:4279095..4280288
RNA-Seq ExpressionPI0006941
SyntenyPI0006941
Gene Ontology termsGO:0010017 - red or far-red light signaling pathway (biological process)
GO:0010099 - regulation of photomorphogenesis (biological process)
GO:0010114 - response to red light (biological process)
GO:0010218 - response to far red light (biological process)
GO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-6596.84Show/hide
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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]4.1e-6798.73Show/hide
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XP_022962152.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita moschata]6.6e-6596.2Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]6.6e-6595.57Show/hide
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XP_023545723.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-6495.57Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein2.0e-6798.73Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY52.0e-6798.73Show/hide
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A0A6J1BRS2 transcription factor HY5-like2.0e-6798.73Show/hide
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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like3.2e-6595.57Show/hide
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F1DQG1 BZIP22.0e-6798.73Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY53.0e-5278.48Show/hide
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        SAQQARERKKAYL++LE RVKDLE KNSELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Q54WN7 Probable basic-leucine zipper transcription factor F4.7e-0544.44Show/hide
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        ++  KR +RL++NR +AQ  R+R+KAY+ DLE +V DL   NSE   R+  L +EN+++R+ L
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Q8TFU8 Transcriptional activator hacA1.4e-0439.24Show/hide
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        RKR ++  +KE +R++R+LRNR +AQ +RERK+  +  LE    D+E++N  L +RL+ ++ EN  L Q +   +A  R
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Q8W191 Transcription factor HY5-like2.8e-1849.3Show/hide
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        P+ +  SSSS  + + +   ESDEE+  VP++  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERK
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        K Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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Q9SM50 Transcription factor HY52.4e-4979.75Show/hide
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        MQEQATSS AASSLPSSSERSSSSAL  E+KEG+ESD+EIRRVPE+GGE+ G TSASGRD  S AG  + Q S   QRKRGRSPADKE+KRLKRLLRNRV
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        SAQQARERKKAYL DLE RVK+LE KN+ELEERLSTLQNENQMLR ILKNTTA  + G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog1.2e-1646.09Show/hide
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        + L+   G  S     +  +    S    +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE R  +L
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        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.2 HY5-homolog2.0e-1949.3Show/hide
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        K Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.9e-1752.63Show/hide
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        VP++  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL
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         NEN MLR++L NT
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AT3G17609.4 HY5-homolog4.2e-1746.09Show/hide
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        + L+   G  S     +  +  G +   S+S  D   V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE R  +L
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        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein2.1e-5378.48Show/hide
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        SAQQARERKKAYL++LE RVKDLE KNSELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTTCCAGCAGTGAAAGATCTTCCAGCTCTGCTCTTCAACTCGAAGTTAAAGAAGGAATAGAGAGCGA
TGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGAACATCGGCTTCCGGGAGGGATACTGGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGG
AGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAAGAGACTCAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCGAGGGAGAGGAAAAAGGCG
TATTTGAATGATTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTCTGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACTTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACAAATTTT
GAAGAACACAACGGCAAGTAGGAGAAGCGGTGAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTTCCAGCAGTGAAAGATCTTCCAGCTCTGCTCTTCAACTCGAAGTTAAAGAAGGAATAGAGAGCGA
TGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGAACATCGGCTTCCGGGAGGGATACTGGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGG
AGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAAGAGACTCAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCGAGGGAGAGGAAAAAGGCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQEQATSSAAASSLPSSSERSSSSALQLEVKEGIESDEEIRRVPEIGGESAGTSASGRDTGSVAGPDRVQVSREGQRKRGRSPADKESKRLKRLLRNRVSAQQARERKKA
YLNDLEIRVKDLEKKNSELEERLSTLQNENQMLRQILKNTTASRRSGE