; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007041 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007041
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionPLATZ transcription factor family protein
Genome locationchr11:26425747..26429870
RNA-Seq ExpressionPI0007041
SyntenyPI0007041
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR006734 - PLATZ transcription factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605136.1 hypothetical protein SDJN03_02453, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-10583.97Show/hide
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XP_004148078.1 uncharacterized protein LOC101216747 [Cucumis sativus]3.2e-12197.36Show/hide
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XP_008459164.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498364 [Cucumis melo]4.9e-12296.92Show/hide
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XP_023532500.1 uncharacterized protein LOC111794643 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-10583.54Show/hide
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XP_038902894.1 uncharacterized protein LOC120089480 [Benincasa hispida]2.6e-11591.3Show/hide
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        ITGVQTYIINSARIVFLN+RPQPRP+KALTNICLVCHRSLLDS+HFCSLGCKLIGTSKN+GK++IK VENESSDTEKSKT+TSN RRKLRSKIQSFSP T
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LR17 Uncharacterized protein1.6e-12197.36Show/hide
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A0A1S3C9J0 uncharacterized protein LOC1034983642.4e-12296.92Show/hide
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A0A6J1FU72 uncharacterized protein LOC1114481753.0e-10185.22Show/hide
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        PPT AATH+  KRRKGTPHRSPMGGLLLEF
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A0A6J1G977 uncharacterized protein LOC1114518545.9e-10584.68Show/hide
Query:  MEKIGEIDKN--------EEEEGEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEI
        ME+IGE  +N        EEEEGEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQC +HADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRV EI
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        FSPPTPPPTAA HRTAKRRKG PHRSPMGGLLLEF
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A0A6J1L7W8 uncharacterized protein LOC1114999926.6e-10485.34Show/hide
Query:  MEKIGEIDKN-----EEEEGEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKF
        ME+IGE  +N     EEEE EG GEIEWPPWLEPLLSTSFFVQC +HADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRV EIQ+F
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Query:  VDITGVQTYIINSARIVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKIQSFSP
        VDITGVQTYIINSARIVFLNERPQPRP+KALTN C VC R+LLDSFHFCSLGCKLIGTSK+  K+ ++ VENESSDTEKSKT+ SNRRR L SKIQSFSP
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         TPPPTAA HRTAKRRKGTPHRSPMGGLLLEF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1G3Q4 Protein RGF1 INDUCIBLE TRANSCRIPTION FACTOR 12.1e-3045.99Show/hide
Query:  IEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLNERPQP
        I+ P WL+ L +  FFV C  H  + K+E N+ CLDC   +LC  C+ SH+ HR +Q+RR  YHDV+R+ ++QK +D + VQ Y INSA++VF+ +RPQ 
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Query:  RPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSKNY
        R  K   N C  C RSL + +  CSLGCK+    K Y
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21000.1 PLATZ transcription factor family protein2.8e-5448.02Show/hide
Query:  IGEIDKNEEEEGEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQT
        +G + + EEEE     +   PPWL P+L  S+FV C  H DS+K+ECN++CLDC   A CS CL  HKDHR +QIRRSSYH+V+RV EIQKF+DI  VQT
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Query:  YIINSARIVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSK-----------NYGKKIIKDVENE--SSDTEKSKTSTSNR--------
        YIINSA+IVFLNERPQPR  K +TN C +C RSLLDSF FCSLGCKL G  +            +G++ +   E++  ++ T+  KT+  NR        
Subjt:  YIINSARIVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSK-----------NYGKKIIKDVENE--SSDTEKSKTSTSNR--------

Query:  ------------RRKLRSKIQ---SFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSP
                    +R   S  +   SFSP TPP     HR + RRKG PHR+P
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AT1G21000.2 PLATZ transcription factor family protein2.8e-5449.17Show/hide
Query:  EGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLN
        E E +   PPWL P+L  S+FV C  H DS+K+ECN++CLDC   A CS CL  HKDHR +QIRRSSYH+V+RV EIQKF+DI  VQTYIINSA+IVFLN
Subjt:  EGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLN

Query:  ERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSK-----------NYGKKIIKDVENE--SSDTEKSKTSTSNR--------------------
        ERPQPR  K +TN C +C RSLLDSF FCSLGCKL G  +            +G++ +   E++  ++ T+  KT+  NR                    
Subjt:  ERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSK-----------NYGKKIIKDVENE--SSDTEKSKTSTSNR--------------------

Query:  RRKLRSKIQ---SFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSP
        +R   S  +   SFSP TPP     HR + RRKG PHR+P
Subjt:  RRKLRSKIQ---SFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSP

AT1G32700.1 PLATZ transcription factor family protein7.0e-7465.42Show/hide
Query:  EGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLN
        E E    +P WL+PLL   FFVQCK HADSHKSECNMYCLDC NG LCSLCL+ HKDH AIQIRRSSYHDVIRV EIQKF+DITGVQTY+INSA++VFLN
Subjt:  EGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLN

Query:  ERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKI--QSFSPPTPPPTAATHRTAKRRKG
        ERPQPRP K + N C VC+RSL+DSF FCSLGCK+ G S    KK  K+  N  SD++ S +STS  R K    I   SF+P TPP +A   R AKRRKG
Subjt:  ERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKI--QSFSPPTPPPTAATHRTAKRRKG

Query:  TPHRSPMGGLLLEF
         PHR+P GGL++E+
Subjt:  TPHRSPMGGLLLEF

AT1G32700.2 PLATZ transcription factor family protein8.3e-5965.17Show/hide
Query:  MYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLI
        MYCLDC NG LCSLCL+ HKDH AIQIRRSSYHDVIRV EIQKF+DITGVQTY+INSA++VFLNERPQPRP K + N C VC+RSL+DSF FCSLGCK+ 
Subjt:  MYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLI

Query:  GTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKI--QSFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSPMGGLLLEF
        G S    KK  K+  N  SD++ S +STS  R K    I   SF+P TPP +A   R AKRRKG PHR+P GGL++E+
Subjt:  GTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKI--QSFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSPMGGLLLEF

AT4G17900.1 PLATZ transcription factor family protein1.6e-7062.74Show/hide
Query:  GEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFL
        G  E E  WPPWL+PLL   FFV CK H DSHKSECNMYCLDC NG LCSLCL  HKDHR IQIRRSSYHDVIRV EIQK++DI G+QTY+INSA++VFL
Subjt:  GEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSARIVFL

Query:  NERPQPRPSKALTNICLVCHRSLL-DSFHFCSLGCKLIGTSKNYGK---KIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKIQSFSPPTPPPTAATH-RTAK
        NERPQPRP K +TN C VC+RSL+ DSF FCSLGCK+ GTS+ + K    ++ + E+ SS     K  T+         +QSFSP TPP T +++ R  K
Subjt:  NERPQPRPSKALTNICLVCHRSLL-DSFHFCSLGCKLIGTSKNYGK---KIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKIQSFSPPTPPPTAATH-RTAK

Query:  RRKGTPHRSPMG
        RRKG PHRSPMG
Subjt:  RRKGTPHRSPMG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAAATCGGTGAAATCGATAAGAATGAAGAGGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGTGAAATTGAATGGCCGCCATGGCTGGAACCTCTTTTAAGTACGAGCTTCTTCGT
TCAATGTAAGAACCATGCCGATTCGCACAAATCTGAATGCAATATGTATTGTTTGGATTGTATGAACGGAGCTCTCTGTTCTCTCTGTCTTAATTCTCATAAAGATCATA
GAGCTATTCAGATAAGGAGATCGTCATACCATGATGTGATAAGGGTGTGTGAGATACAGAAATTTGTGGACATAACAGGAGTTCAAACTTACATCATTAACAGTGCAAGG
ATTGTGTTCTTGAACGAACGCCCTCAGCCTCGTCCTTCTAAAGCTCTCACTAATATCTGCCTCGTCTGTCATCGTTCTCTTCTTGATTCCTTCCATTTCTGCTCTCTTGG
TTGCAAGCTAATTGGGACATCAAAGAATTATGGAAAAAAAATAATAAAAGATGTGGAAAATGAAAGCTCCGACACCGAGAAATCGAAGACCTCAACCAGCAACAGAAGAA
GAAAACTTAGAAGCAAAATCCAAAGCTTCTCGCCACCGACCCCACCGCCCACAGCGGCGACTCACCGAACCGCCAAAAGAAGGAAGGGAACGCCGCACCGGTCTCCGATG
GGAGGACTTCTCTTAGAATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATATAATAGAAGCAGATACCGCAGCACCAACCAAAGCAGAAACCGCATTTTTCTCCATAGCCCTACCTTTTTTTCCCCTTCTCTATATTCTCTCCGTCACTTTCCCGAGA
AAATTCCACTCATCGGCGACGGAAAAATTCATCCTCTTATAATTATCCCGCTCGTAGCTATGATCGATTAGAGAAATCCAAGCCGTAATCGTCAAAATCATGGAGAAAAT
CGGTGAAATCGATAAGAATGAAGAGGAAGAAGGGGAAGGAGAAGGTGAAATTGAATGGCCGCCATGGCTGGAACCTCTTTTAAGTACGAGCTTCTTCGTTCAATGTAAGA
ACCATGCCGATTCGCACAAATCTGAATGCAATATGTATTGTTTGGATTGTATGAACGGAGCTCTCTGTTCTCTCTGTCTTAATTCTCATAAAGATCATAGAGCTATTCAG
ATAAGGAGATCGTCATACCATGATGTGATAAGGGTGTGTGAGATACAGAAATTTGTGGACATAACAGGAGTTCAAACTTACATCATTAACAGTGCAAGGATTGTGTTCTT
GAACGAACGCCCTCAGCCTCGTCCTTCTAAAGCTCTCACTAATATCTGCCTCGTCTGTCATCGTTCTCTTCTTGATTCCTTCCATTTCTGCTCTCTTGGTTGCAAGCTAA
TTGGGACATCAAAGAATTATGGAAAAAAAATAATAAAAGATGTGGAAAATGAAAGCTCCGACACCGAGAAATCGAAGACCTCAACCAGCAACAGAAGAAGAAAACTTAGA
AGCAAAATCCAAAGCTTCTCGCCACCGACCCCACCGCCCACAGCGGCGACTCACCGAACCGCCAAAAGAAGGAAGGGAACGCCGCACCGGTCTCCGATGGGAGGACTTCT
CTTAGAATTTTAAATATTTTATTATAATTATTTATAAAAAGACGAAAATGCCCCTTCCTTACAACCACCGACACATAAAACACATAATTTGAGATCATTACTATTTTTTG
CAGCATCTGAGCCTTTGACCAACGGTCAACGGAGGCCGTTGCTGTAATAAAACTAGAAAGCTACCGTACACCTTTAATATGTATAGTTGTATTTTATGAAATGTATCTCT
TTATGTAATTTAATAATATAATAATAAATATTAAATTAAGTGAGAGAAAAAAAAAGAATAATAATGTGTAGTTGTTGTGATTGTAGGTTTGTTGAAAGCTGTTTTTATCC
AAAAAAAAAAAAGCACATGAGTTCTAATTAAATTGTGAAAATAATTTCATTTTTCTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKIGEIDKNEEEEGEGEGEIEWPPWLEPLLSTSFFVQCKNHADSHKSECNMYCLDCMNGALCSLCLNSHKDHRAIQIRRSSYHDVIRVCEIQKFVDITGVQTYIINSAR
IVFLNERPQPRPSKALTNICLVCHRSLLDSFHFCSLGCKLIGTSKNYGKKIIKDVENESSDTEKSKTSTSNRRRKLRSKIQSFSPPTPPPTAATHRTAKRRKGTPHRSPM
GGLLLEF