; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007052 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007052
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr02:3438043..3438895
RNA-Seq ExpressionPI0007052
SyntenyPI0007052
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055681.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold181G00620 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-5893.33Show/hide
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XP_038878738.1 uncharacterized protein LOC120070912 [Benincasa hispida]1.4e-5782.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX97 Uncharacterized protein3.1e-6887.88Show/hide
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A0A1S3BRF0 uncharacterized protein LOC1034924586.1e-7292.55Show/hide
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A0A5A7UQ57 Uncharacterized protein7.8e-5993.33Show/hide
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A0A5D3DU40 Uncharacterized protein6.1e-7292.55Show/hide
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A0A6J1F625 uncharacterized protein LOC111441161 isoform X22.2e-3766.89Show/hide
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        +  LEWS+ARK MIE+QA AEL+SLQLL+PNRFEYLKLELKSFI LLQSQ    SE+ F QPNT+  S R  SPS+  PD+QESSSCRKRRK+EEG    
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           NGL+RE+AE E+  K GRR+DRVD VLERA VCL KI+RFK AL S+A
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G36960.1 unknown protein4.7e-0834.48Show/hide
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        S + +  + E A  EL+ LQ  YPNRF YLK +L+SFI  L+     P              SPSS    TQESS+C  ++K ++ +       ++  + 
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Query:  LQREVAEPESKIGRR-----KDRVDAVLERAAVCLCKIRRFKMAL
           ++ +  +K+G+R     K+RV+ VLERA +CL KIR  K +L
Subjt:  LQREVAEPESKIGRR-----KDRVDAVLERAAVCLCKIRRFKMAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGATTTCCAAAGAGAGAAGAACGATAACGAGACATACACAGAGAGAATCTCAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGC
CGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTCGAATACCTAAAGCTCGAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCGCAATCCGAAGATCCTTTTCCTC
AGCCAAACACTATCTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCCGTCCTCTTTCGGTCCTGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGAGGAAGGAAGA
AATAAAGGAAGGAATGGATTACAGAGAGAGGTTGCTGAACCTGAATCGAAGATCGGACGGCGGAAGGATAGAGTAGATGCAGTTCTGGAAAGAGCCGCAGTTTGTCTTTG
CAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTGTTTTCCTCCGCCGGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GACCCCACAAACTTTCCTGTCTTCTTCTTTCCCTTTCTCTTCCACTTTCATTTCCATGGCAGATTTCCAAAGAGAGAAGAACGATAACGAGACATACACAGAGAGAATCT
CAAGCTTAGAATGGAGCAAAGCAAGGAAGACGATGATCGAAGAACAAGCAAATGCCGAATTACAATCTCTCCAACTTCTCTACCCCAATCGTTTCGAATACCTAAAGCTC
GAACTCAAATCCTTCATCCATCTCCTTCAATCGCAATCCGAAGATCCTTTTCCTCAGCCAAACACTATCTTAACCTCCAACCGCTCGCCGTCGCCGTCCTCTTTCGGTCC
TGATACACAAGAGTCGAGTAGTTGTAGGAAGAGGAGGAAGGTGGAGGAAGGAAGAAATAAAGGAAGGAATGGATTACAGAGAGAGGTTGCTGAACCTGAATCGAAGATCG
GACGGCGGAAGGATAGAGTAGATGCAGTTCTGGAAAGAGCCGCAGTTTGTCTTTGCAAGATTCGACGGTTCAAAATGGCGCTGTTTTCCTCCGCCGGTTGACGACGGTCC
TCCGACTTCTTGACGCCTCGAAGGTGCTGCTCCGATCTTTCTCTTTCCTTCACTCTCTTTCTCATGCAATGACATTGCCGCACGTGTGAGAATGTCGAAATTCAGTGGGG
ATGAACTTTAAATTTTGTGGGGCGTGTGAATGTTCTATTTTGGTCCGATTTTGCGGTAGATGGAAAAAGAAAAGGAAAAAAAATCACTTTTGTATTCGAGTTGGAGATAA
TTTTGTGTAGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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