; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007088 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007088
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionmucin-1
Genome locationchr06:20363312..20364839
RNA-Seq ExpressionPI0007088
SyntenyPI0007088
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066977.1 mucin-1 [Cucumis melo var. makuwa]8.0e-6589.12Show/hide
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        TDSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAAD P+AADGP AADGPTADSPADSPA  D+SSGT+LK+TSA+VGGV+A  G +AF
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XP_008450043.1 PREDICTED: mucin-1 [Cucumis melo]2.8e-6589.64Show/hide
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        TDSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAAD P+AADGP AADGPTADSPADSPA  D+SSGT+LK+TSA+VGGV+A  G +AF
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XP_022934589.1 mucin-1-like [Cucurbita moschata]2.7e-2853.66Show/hide
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        MASQS VLVFALIF+AAVAG FAEAPT +PS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                       +PA +P ASS
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        E +SPSP AS+P+S ++AP SNSP SSP+SSPSVSPSPATDSPA SPA + SP         AASPDSD SSPPS             P  ADGPS ADG
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        PS ADG  +DSPADSP    +S  + LK+TSA V G VAV G+FAF
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XP_031737954.1 classical arabinogalactan protein 11 [Cucumis sativus]4.1e-6183.73Show/hide
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        MASQ+VLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPA SPKAS ETTSPSP ASSPSSS+DAPTSNSPTSSP SSPSVSPSPAT
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Query:  DSPADSPA-----ADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDA-----ADGPSAADGPSAADGPT-------ADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGGV
        DSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDA     ADGP+AADGP+AADGPT       ADSPADSPAS DESSGT+LK+TSAMV GV
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        VA VG FAF
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XP_038887418.1 classical arabinogalactan protein 6-like [Benincasa hispida]8.1e-3362.5Show/hide
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        MASQSV +FALIFLAAVA V AEAPT+SPS SPSPKASPSDS+SPSPSSSSPAA+PKASSE +SPSP AS+PSSS+ APTS SPT SP SSPSVSPSPA 
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Query:  DSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADGPSAADGPSAADGPTADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGGVVAVVGIFAF
        DSPADS +AD+PAD+ ADTPTAASPDS                                    ++D+SS + LK+T A+ GG VAVVG+ AF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDP4 Uncharacterized protein2.1e-5084.36Show/hide
Query:  MASQSVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAASPKASSETTSPSPVASSPSSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPAT
        MASQ+VLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPA SPKAS ETTSPSP ASSPSSS+DAPTSNSPTSSP SSPSVSPSPAT
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Query:  DSPADSPA-----ADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDA-----ADGPSAADGPSAADGPT-ADSP--ADSPASAD
        DSP+DSPA     ADSPAD+ ADTPTAASPDSDVSSPPSPDA     ADGP+AADGP+AADGPT AD P  AD P +AD
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A0A1S3BND1 mucin-11.3e-6589.64Show/hide
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        MASQSVLVFALIF+AAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAASPKASSETTSPSP ASSP SSS+DAPTS+SPTSSP+SSPSVSPSPA
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Query:  TDSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADGPSAADGPSAADGPTADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGGVVAVVGIFAF
        TDSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAAD P+AADGP AADGPTADSPADSPA  D+SSGT+LK+TSA+VGGV+A  G +AF
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A0A5A7VIK3 Mucin-13.9e-6589.12Show/hide
Query:  MASQSVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAASPKASSETTSPSPVASSP-SSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPA
        MASQSVLVFALIF+AAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAASPKASSE TSPSP ASSP SSS+DAPTS+SPTSSP+SSPSVSPSPA
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        TDSPADSPAADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAAD P+AADGP AADGPTADSPADSPA  D+SSGT+LK+TSA+VGGV+A  G +AF
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A0A6J1F318 mucin-1-like1.3e-2853.66Show/hide
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Query:  ETTSPSPVASSPSSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPATDSPADSPA-ADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPS-------------PDAADGPSAADG
        E +SPSP AS+P+S ++AP SNSP SSP+SSPSVSPSPATDSPA SPA + SP         AASPDSD SSPPS             P  ADGPS ADG
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Query:  PSAADGPTADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGGVVAVVGIFAF
        PS ADG  +DSPADSP    +S  + LK+TSA V G VAV G+FAF
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A0A6J1J779 mucin-1-like1.9e-2751.56Show/hide
Query:  MASQSVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSS--------------------------------------------------
        MASQSVLVFALIF+AAVAG FAEAPT SPS SP+PK++PSDSE+ SPSSS                                                  
Subjt:  MASQSVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSS--------------------------------------------------

Query:  ---------SPAASPKASSETTSPSPVASSPSSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPATDSPADSPA-ADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPS--PDAA
                 +PA +P ASSE +SPSP AS+P+S ++AP SNSP SSP+SSPSVSPSP TDSPA SPA + SP         AASPDSD SSPPS  PDAA
Subjt:  ---------SPAASPKASSETTSPSPVASSPSSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPATDSPADSPA-ADSPADNVADTPTAASPDSDVSSPPS--PDAA

Query:  DGPSAADGPSAADGPTADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGG--VVAVVGIFAF
        D P  ADGPS  DGPT+DSPAD+P    +S  ++LK+TSA V G   VAV G+FAF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTCAATCTGTTCTTGTTTTTGCTTTGATATTCCTTGCCGCTGTTGCCGGAGTTTTTGCGGAGGCACCGACCGAATCACCTTCAACATCTCCCTCACCTAAAGC
TTCCCCATCGGACTCTGAATCACCTTCACCGTCTTCTTCTTCTCCTGCAGCCTCTCCAAAGGCCTCATCTGAGACAACATCCCCATCCCCGGTAGCTTCTTCTCCATCTT
CGTCCACCGATGCTCCAACCAGCAATTCACCCACCAGCTCCCCAGAATCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCTGCCACTGACTCCCCCGCTGACTCTCCTGCTGCTGAC
TCTCCTGCTGACAATGTTGCCGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCCCCTGATGCCGCAGATGGCCCTTCTGCCGCCGATGGCCC
TTCTGCTGCGGATGGCCCCACCGCCGATTCTCCTGCCGATTCACCAGCCAGTGCTGATGAAAGCAGCGGTACAAATCTGAAAGTCACCTCCGCCATGGTCGGTGGTGTCG
TTGCCGTTGTCGGAATCTTTGCATTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAATTAAAACCACATAATTATGTTATAACATAACTAATACATAAAGTTTTTTACTAAACCACAATTGTAAGGATGAAAATTAAGAGAAAAAAAAACAAATCTTTCTTAT
CTTTTAATAGAATTAGATTTAGATAGAATATAGACCTAATTTAGTTTTCTCTTTTTCTTTTTAAGTCTCAAAATAACAAAACACCAATTAAATCCGACCATCAAATTCAC
CTGTCTTCTTCACCACCAAAAACTTCGTCAAACCCTAAATTTTATATCTTTTCAAACCCTCCATTCATTTTCCCTCTCCACTTTCTCTCTCCTATTTTTTACCTTGTATA
TAATCTCTCAATCTCCCTCTTCATCTTCATCCCTCCATTTCTCTAACATTGCAGTGTTTTCTCTCTCCTTCTAAGAGAAAATTACTGCCCTCTCATCTCATATTTCACCT
TTTTACCATTTTTTTACATTCTAATTTTACTATGGCTTCTCAATCTGTTCTTGTTTTTGCTTTGATATTCCTTGCCGCTGTTGCCGGAGTTTTTGCGGAGGCACCGACCG
AATCACCTTCAACATCTCCCTCACCTAAAGCTTCCCCATCGGACTCTGAATCACCTTCACCGTCTTCTTCTTCTCCTGCAGCCTCTCCAAAGGCCTCATCTGAGACAACA
TCCCCATCCCCGGTAGCTTCTTCTCCATCTTCGTCCACCGATGCTCCAACCAGCAATTCACCCACCAGCTCCCCAGAATCCTCCCCTTCCGTTTCTCCTTCTCCTGCCAC
TGACTCCCCCGCTGACTCTCCTGCTGCTGACTCTCCTGCTGACAATGTTGCCGACACCCCGACTGCTGCTTCACCAGATTCCGATGTCTCTTCTCCTCCATCCCCTGATG
CCGCAGATGGCCCTTCTGCCGCCGATGGCCCTTCTGCTGCGGATGGCCCCACCGCCGATTCTCCTGCCGATTCACCAGCCAGTGCTGATGAAAGCAGCGGTACAAATCTG
AAAGTCACCTCCGCCATGGTCGGTGGTGTCGTTGCCGTTGTCGGAATCTTTGCATTCTAAGGATAGCTTATTGATATAAGCATGTTCAGAGAGTATGGGTGATAAATTCT
CACATAAAATGAGATTGTATTCTTTTAATTTATATAATTAAAACAAAACAAAAAATGAAGAATGTGTAAACCAAATCATCGGAAAGTTGAATTATAATTTTGGACGTTGT
AATATACTCATTTTGCATTTATATAAAAAATCTACTTTTTGAAAGGAAAAAAAATTAAATGTTAAGTATTATTGGTCGATCGAGATAAGATATTACATTATTATTAATAT
TTATATGATTATTATTCTTATTATTACTATTAGACGAAGATATTACATTAGCGTTTACTTTGTATATGCAACAAATTTACAATTATTTAACTACATCAGATCTTTTAAAG
TTACGATGAATTATGCCAACTATCTCCGTACACTTTAGTGCTAAATCATCTATTACCATATTTCAGAGGTGGATAGTTGATTTTCTACCTCAGTGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASQSVLVFALIFLAAVAGVFAEAPTESPSTSPSPKASPSDSESPSPSSSSPAASPKASSETTSPSPVASSPSSSTDAPTSNSPTSSPESSPSVSPSPATDSPADSPAAD
SPADNVADTPTAASPDSDVSSPPSPDAADGPSAADGPSAADGPTADSPADSPASADESSGTNLKVTSAMVGGVVAVVGIFAF