; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007264 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007264
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationchr12:14448467..14453725
RNA-Seq ExpressionPI0007264
SyntenyPI0007264
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6573446.1 TLC domain-containing protein 4-B, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-14395.26Show/hide
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XP_038894770.1 TLC domain-containing protein 4-like [Benincasa hispida]3.5e-14697.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein1.9e-14597.08Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like5.8e-14797.81Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like5.8e-14797.81Show/hide
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A0A6J1GTT4 transmembrane protein 561.1e-14294.53Show/hide
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A0A6J1K6A0 transmembrane protein 56-like8.6e-14395.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550S9 TLC domain-containing protein 4 B2.6e-1125.56Show/hide
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        L +++   + K+ +G  + +R+EW NR +ST++AI  S +S+Y +++++   +   +      +S +S FI      YF+ D  +  +    L     ++
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        HH+++ L+  +    G           +EITTP IN+R++L     K    Y+ING++IF  +++ R+     T + V     HY  +    +I + + F
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          P +  ++NL W   I K + K
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B2.0e-1123.75Show/hide
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        V G  +  +L +  ++ ++S+ + + Y  L   +  +WN+R +ST+HA+ + +  LY +++ D  ++    G        L    + I+ GY   DL L+
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           + ++G + +V HH  +  A  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ +     R+   ++ NGI +   + + RI +    +  V+ + Y  
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          +   +   + + +  V L ++N++W  KI +G  K I+
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A2.0e-1123.81Show/hide
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        + D  + +  V G  L  +L++  ++  +   Y  +Y  L+  ++ EW++R +ST HA+ +    LY + + D  +     G   +    ++     I+ 
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        GY + DL L+   +  +     V HH     +  Y +  G    +    LISE++TP +N RW+ D  GK RS    L+NG+ +   + I RI +    +
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Query:  YHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
          V+  +  +  I++ +   +       VL ++N+ W  KI +G  K +  +
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B1.9e-1428.84Show/hide
Query:  LTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFS
        L+  Q++EWN+R +S+ HA+ +    LY + + D  +     G        +    + ++ GY ++DL LII+ +  +G   +V HH L+ L   Y V  
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        GEG L  +    LI+E +TP +N RW+ +  G  K S   ++NG+++  ++ I RI +    +  V+  +  +      +G    + + +V L +MN+MW
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Query:  FGKIVKGLMKTISKR
          KI KG  K +  R
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 46.6e-1527.91Show/hide
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        Y  L+  +++EWN+R +ST H++ + I  LY  F+ +        G  T+ +  ++T     + GY ++DL +I++ +  +G   +++HH  +GL   Y 
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Query:  VFSGEGQLY-TYMVLISEITTPEINMRWYLDTAG-KKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHY--DQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNL
        V +     Y     L++E+++P +N RW+ +     K S A +INGI++   + I RI+     ++ +Y  Y  +  I+   +   +      +L +MN+
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Query:  MWFGKIVKGLMKTIS
        MW  KI KG +K IS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.1e-11371.96Show/hide
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        SL T+ AIKSY  QA  LVKNYLL D F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAG K+S AY++
Subjt:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLI

Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.1e-11371.96Show/hide
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        SL T+ AIKSY  QA  LVKNYLL D F+P+TSVL G+  CK+VYDL   +SN + K+Y+ LTKIQR+EWNNRG+ST+HAI+IS MSLYFVFWSDLFSD+
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Query:  RHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLI
         H  LV F+SS LS+  LGIS+GYFLADLG+I W YPSLGG+EY+VHHSLSG+AVAYS+FSGEGQLYTYMVLISEITTPEIN+RWYLDTAG K+S AY++
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Query:  NGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        NG+ IF AWL+ARILLF Y FYHVYLHY+QV++MH+ GY+LVFGVP  LG+MNL+WFGKIV+G+ KT++KR
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-6550Show/hide
Query:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI
        S+  G L CK+VYDLT+ +S   F  Y  L    R+EWNNRG ST HA++ S+ S+YF+  SD F +  H   V   ++ LS  ++GIS+GYFLADL +I
Subjt:  SVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVTFQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLI

Query:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI
         W +P+LGG+EYV HH LS  A+  SV SG+ Q Y ++VL+SE TTP +N+RWYLD +G+K S AY +NGI +F  WL+AR+LLF + F H+YLH+ QV 
Subjt:  IWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVI

Query:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISK
        ++  +G+  +  +P  L +MNL+WF KI KGL+KT+SK
Subjt:  KMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISK

AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.3e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLGDHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLL D F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
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Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG KRS AYL+NG+ 
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Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR
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AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.3e-10671.54Show/hide
Query:  MAIKSYQSQADALVKNYLLGDHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL
        M IKSYQ+QA+  V++YLL D F+P+TSVL G+  CKLVYDLT+L S+ + KSY  LTKI+R+EWNNRG+ST+HAI+IS M+LYF F+SDLFSDQR    
Subjt:  MAIKSYQSQADALVKNYLLGDHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGL

Query:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIV
        +T F++S LSTF LG+SVGYFLADLG+I WLYPSLGG EY++HH LSG AVAYS+FSGE QLYTYMVLISE+TTPEIN+RWYLD AG KRS AYL+NG+ 
Subjt:  VT-FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIV

Query:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR
Subjt:  IFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGTCTTTGATGACAGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCGTTAGTAAAGAACTATTTATTAGGAGACCATTTTGTCCCATTCACTTCTGT
ACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATTCAACGAGTCGAGTGGA
ATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCACTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGGCCTTGTTACC
TTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTGGAATGGAGTA
TGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACAACTCCTGAGA
TTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTAAGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCATACTGCTGTTT
GGATACACATTTTATCACGTTTACCTGCATTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTATGATGAACTT
GATGTGGTTTGGAAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTTGTCACGATGCATACCATATTGAAGTAATAAATAAATAAAGGACAATTAAAAGAAAAAGAAAAGGAAAAAAAATCATCGGCTAAGGCGCGAAGCTATCATATTCCTT
CGGTTAGCAGTAGTCCAAGGATTGGATAGATAGAATGCAATTGATTGAATGAATCCACATGAACACGAGGATTCCATCTCTGGACACTCAAATCCATTGCTGATTAGCAA
AAAACACTTGCATTTCCCATTACCCAATTCCCCATACGCTATTATAATTTCTAATTTCTCTTCATCTTCCCTTGATTTTTCCCTTTTGGATTGTTGCGTTGCGGTTGAAG
ATTCCTAACGCTTCACGTTGATTCAACCTCACGGTTCTTTTGTACCGGTCGGTTGTTGCATTCCCTTTACACATTATCTTATTTTGTTTTCTTCCCATTTTCTTATCTTT
CAAAAAGCGAAAAAACCCACCTTCTACATCTTCTCGTGATCTGGGGCTTTCATCTATGAGGTATTGATTCTATCTCTTATTTCTTTTGGCTGTGATTTCCATCTTTTCTT
CCGTTTAATGGGTTACCCATTTGGATTTTGATCCTTTATTTTGATGGGATCTTTTAGTTTGTTCTTTTATACTTGTGAATTTTGTGTGCTTGCTGTTAGTCCCATCATTC
GATCTTTAAGCTTACCTGGTTATAAGCTCTTTTTTAGCGTTTTGGGGCTTTGTTCCAGAAATCGCATCCTCTTGCAGTTTGTTTAAATTCAATGAGTGAGCATCATTTCT
AGTTTAGACAGTCCTTTTGTTCTGTTCCAGCAAATTAGTCTTACTGAAACATTTGATCATATATGTGTTGTTGAATTGTCTTTCTTTTTTTTTTCCTAGTTTTCTGTTCA
AGTCTTTATGTTTGAGTTCGGAGTGTTCAAAAGGTAATTAGTGTAGATCTTCGGGATGATCATGAAAGTTGAAGATTACTTGAATACAGTCACAGCTACCGCTTTAGAAA
ACCTATACGAAAATAATGAATGGGATGTGCTATTTGTCAAAATGGTCTATATGATCATGATATGACTCTGTAGATTTTAGGATGACATTTTTTGACATTGCAGTTTAATG
TCTCTAATTAGAGTTTTCTACACAAAGTTGTGTAATTAAATATTTTTATGATAGATCTAGACTGGGGAAATTTAATTTTTGATCCCATAAGAAAAATAAAAACTATGGAA
CCACTTTAGCTAAATGATTCCTGCGCTTTTTTGTGTGTAGTTCCGAATGAATGCATAGCAGAGTTTATGAGATGGAATGAGGAGTAGACTAGATTTTGGATGTTGTTATG
TTATAGTCCTTTTCTTGGTGCCTTGAGACCAAATTATTTTGTGAGATTAATTGTCGCTTGTGGACACTGGTTTCTTATGCACAAATGTTTTTATCACCATTCTTTATATC
TCCACTTACTAACTTCTTCATATTTGATCAAGAAAGGATGACAACATGGAGGGAAGGAGCAACTAATTAATTCAGTCTGATGTACTGTGACCTGTTGAATGTTATGTAGC
AAACAACACAATGGCAATGTCTTTGATGACAGTAATGGCTATCAAATCTTACCAAAGTCAAGCTGATGCGTTAGTAAAGAACTATTTATTAGGAGACCATTTTGTCCCAT
TCACTTCTGTACTTGGAGGGATGCTTGCTTGTAAATTGGTTTATGATCTCACTCAATTAGTTAGCAATTTTTATTTTAAAAGTTATCTTGGTCTTACAAAAATTCAACGA
GTCGAGTGGAATAACCGCGGCATGTCCACTATTCATGCAATCTATATCTCAATTATGTCACTGTACTTCGTTTTCTGGTCAGATCTCTTCTCTGACCAGCGTCATGCTGG
CCTTGTTACCTTTCAAAGTTCAACATTGTCTACTTTCATATTGGGGATTTCAGTTGGGTACTTCTTGGCAGATCTTGGATTGATTATTTGGCTGTATCCTTCCTTAGGTG
GAATGGAGTATGTTGTCCACCACTCTCTTTCCGGACTAGCAGTGGCATACTCTGTTTTTTCTGGAGAAGGGCAACTCTATACTTATATGGTCCTCATTTCGGAGATTACA
ACTCCTGAGATTAATATGAGATGGTATCTTGATACTGCTGGTAAGAAGAGGTCCTGTGCATATTTGATTAATGGCATTGTAATATTTTTTGCATGGCTGATTGCTCGCAT
ACTGCTGTTTGGATACACATTTTATCACGTTTACCTGCATTATGATCAGGTAATTAAGATGCATGTAATTGGATATCTTTTGGTATTTGGAGTGCCAACAGTGCTAGGTA
TGATGAACTTGATGTGGTTTGGAAAGATCGTCAAGGGATTAATGAAAACTATATCAAAGAGGTGACGAGACACGTTTTCTTCCTGTCGATATCTCTTCTTCACCCGCTTG
GTCTATTTCTTAACATCTACACATGGGTGGAGGAAAGAGGAATTTGGTGATGGTATGTAGTGTGTTGTAAATGGTTCAAAATAACTTAAACTTGTTGACATTTAGTGTCT
TTTTCGTCTTGTCAGATTTGTGTACCAATCCATTTTTTTCTGTATAGTTCCTTTTTTTTTTTCTCATCTTTCTTCCTTTTTTTATTTATCATTTATTATTATTTTTTTTT
TTTGAAGAATGCATACATACAAATGTATGGAAGAAAGTTGATGATACTACAGCAATAATTTTTTTGTATTCCGTTATGTTTTGGATCTCTTCTTTATTGTCCCTTAATAA
TAGCAGGCATTGTTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMSLMTVMAIKSYQSQADALVKNYLLGDHFVPFTSVLGGMLACKLVYDLTQLVSNFYFKSYLGLTKIQRVEWNNRGMSTIHAIYISIMSLYFVFWSDLFSDQRHAGLVT
FQSSTLSTFILGISVGYFLADLGLIIWLYPSLGGMEYVVHHSLSGLAVAYSVFSGEGQLYTYMVLISEITTPEINMRWYLDTAGKKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLF
GYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR