; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007293 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007293
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionGATA transcription factor
Genome locationchr03:2895263..2902743
RNA-Seq ExpressionPI0007293
SyntenyPI0007293
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000679 - Zinc finger, GATA-type
IPR010399 - Tify domain
IPR010402 - CCT domain
IPR013088 - Zinc finger, NHR/GATA-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023538546.1 GATA transcription factor 19-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.0e-18393.28Show/hide
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XP_038884827.1 GATA transcription factor 19-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.2e-18895.01Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLS6 Uncharacterized protein8.1e-19498.01Show/hide
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A0A1S3BAZ6 GATA transcription factor 24-like isoform X16.0e-19799.43Show/hide
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A0A6J1BUL9 GATA transcription factor 24-like1.1e-18594.32Show/hide
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A0A6J1HDR0 GATA transcription factor 19-like isoform X13.2e-18292.61Show/hide
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          EED+NETT +LTNSLP +I NHS+N DEQEPL+ELANPSDTDIDIPTNFD
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A0A6J1KMC5 GATA transcription factor 19-like isoform X26.4e-18393.04Show/hide
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        TRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSKGGRNVS+DH EPETPMDVKP IMEGEFSGI DEHGTPEDP KTMTEGS
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Query:  SNPSIDLD-EEDMNETTGDLTNSLPMRIVNHSSNDDEQEPLVELANPSDTDIDIPTNFD
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XKR7 GATA transcription factor 182.6e-4848.03Show/hide
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        AAA      A          +  G  D   +DG  G    +  DD EE     +  A           ++    ++LTL F+GEVYVF +VTPEKVQAVL
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        LLLG  ++P G+  M +P    NRG  D  +R+++ ++R+ASL+RFREKRKER FDKKIRY VRKEVA RM R+ GQFA      G S         Q G
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Query:  TRSETVLR--KCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
        +  + + R  KCQ+CG SE  TPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLR+  K
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B8AR30 GATA transcription factor 195.5e-4655.31Show/hide
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        ++++ + +LTL ++GEVYVF  V P+KVQAVLL+LGG D+P G+ +M VP         D    +  +RRIASL+RFREKRKERCFDKKIRY+VRKEVAQ
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Query:  RMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLR
        +M R+ GQFA   +    S   +      +G         CQ+CG+S   TPAMRRGPAGPR+LCNACGLMWANKGTLR
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Q10F25 GATA transcription factor 181.5e-4848.03Show/hide
Query:  AAANPQPLQARPFQEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHG------GLVMASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVL
        AAA      A          +  G  D + +DG  G    +  DD EE     +  A           ++    ++LTL F+GEVYVF +VTPEKVQAVL
Subjt:  AAANPQPLQARPFQEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHG------GLVMASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVL

Query:  LLLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNL-SRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDG
        LLLG  ++P G+  M +P    NRG  D  +R+++ ++R+ASL+RFREKRKER FDKKIRY VRKEVA RM R+ GQFA      G S         Q G
Subjt:  LLLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNL-SRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDG

Query:  TRSETVLR--KCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
        +  + + R  KCQ+CG SE  TPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLR+  K
Subjt:  TRSETVLR--KCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

Q8GXL7 GATA transcription factor 241.0e-5252.14Show/hide
Query:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL
        A NP  +Q       H+   + M DD   + DGG        MD+  E  + S    S  N G +V        +LTLSF+G+VYVF  V+PEKVQAVLL
Subjt:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL

Query:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNR--GMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHS
        LLGGR+VP  +PT       NNR  G+  TP+R ++ +R+ASL+RFREKRK R FDK IRYTVRKEVA RM RK GQF S K S     S  S W S  S
Subjt:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNR--GMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHS

Query:  CLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
           +GT ++     C+HCG SE +TP MRRGP GPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
Subjt:  CLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

Q8H1G0 GATA transcription factor 285.6e-5151.88Show/hide
Query:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP
        H+   S M DD  + +DG  GG    V  D+  +H  +V+  N G +V   + +  +LTLSF+G+VYVF +V PEKVQAVLLLLGGR++P A  P +  P
Subjt:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP

Query:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC
        + +N    +  TP+R ++ +R+ASLVRFREKRK R FDKKIRYTVRKEVA RM R  GQF S K      +S  SSW S  +   + + ++     C+HC
Subjt:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC

Query:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
        G+ E +TP MRRGPAGPRTLCNACGLMWANKG  RDLSK
Subjt:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G51600.1 ZIM-LIKE 24.0e-5251.88Show/hide
Query:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP
        H+   S M DD  + +DG  GG    V  D+  +H  +V+  N G +V   + +  +LTLSF+G+VYVF +V PEKVQAVLLLLGGR++P A  P +  P
Subjt:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP

Query:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC
        + +N    +  TP+R ++ +R+ASLVRFREKRK R FDKKIRYTVRKEVA RM R  GQF S K      +S  SSW S  +   + + ++     C+HC
Subjt:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC

Query:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
        G+ E +TP MRRGPAGPRTLCNACGLMWANKG  RDLSK
Subjt:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

AT1G51600.2 ZIM-LIKE 24.0e-5251.88Show/hide
Query:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP
        H+   S M DD  + +DG  GG    V  D+  +H  +V+  N G +V   + +  +LTLSF+G+VYVF +V PEKVQAVLLLLGGR++P A  P +  P
Subjt:  HVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVP-AGVPTMEVP

Query:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC
        + +N    +  TP+R ++ +R+ASLVRFREKRK R FDKKIRYTVRKEVA RM R  GQF S K      +S  SSW S  +   + + ++     C+HC
Subjt:  YDHNN-RGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKE-----SSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHC

Query:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
        G+ E +TP MRRGPAGPRTLCNACGLMWANKG  RDLSK
Subjt:  GVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

AT3G21175.1 ZIM-like 17.3e-5452.14Show/hide
Query:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL
        A NP  +Q       H+   + M DD   + DGG        MD+  E  + S    S  N G +V        +LTLSF+G+VYVF  V+PEKVQAVLL
Subjt:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL

Query:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNR--GMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHS
        LLGGR+VP  +PT       NNR  G+  TP+R ++ +R+ASL+RFREKRK R FDK IRYTVRKEVA RM RK GQF S K S     S  S W S  S
Subjt:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNR--GMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHS

Query:  CLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
           +GT ++     C+HCG SE +TP MRRGP GPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
Subjt:  CLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

AT3G21175.2 ZIM-like 12.3e-5552.55Show/hide
Query:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL
        A NP  +Q       H+   + M DD   + DGG        MD+  E  + S    S  N G +V        +LTLSF+G+VYVF  V+PEKVQAVLL
Subjt:  AANPQPLQARPF-QEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTS---VSVANHGGLV--MASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLL

Query:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHSCL
        LLGGR+VP  +PT       NNRG+  TP+R ++ +R+ASL+RFREKRK R FDK IRYTVRKEVA RM RK GQF S K S     S  S W S  S  
Subjt:  LLGGRDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKES-----SGASSWESAHSCL

Query:  QDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
         +GT ++     C+HCG SE +TP MRRGP GPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK
Subjt:  QDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSK

AT4G24470.1 GATA-type zinc finger protein with TIFY domain4.4e-4345.81Show/hide
Query:  GGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLVMASR----TSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGG-RDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNLSR
        G   D++ D  +     V+  + G  ++ SR     ++LT+SF G+VYVF AV  +KV AVL LLGG  ++  G   ME+    N+  +V+   R +L +
Subjt:  GGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLVMASR----TSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGG-RDVPAGVPTMEVPYDHNNRGMVDTPKRSNLSR

Query:  RIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACG
        R  SL RFR+KR  RCF+KK+RY VR+EVA RM R  GQF S K + GA +  +     QD    E     C HCG+S   TP MRRGP+GPRTLCNACG
Subjt:  RIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRGPAGPRTLCNACG

Query:  LMWANKGTLRDLSKGGRNVSLDHMEPE
        L WAN+GTLRDLSK      L  M+P+
Subjt:  LMWANKGTLRDLSKGGRNVSLDHMEPE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCTGCAAATCCTCAGCCTTTGCAAGCGCGTCCCTTCCAGGAACATGTCCAAGTCCCCTCAATGATGGGGGATGACGACGGTGAATATGAAGATGGTGGCGGCGG
CGGCGGCGGCGGCGATGTTATGGATGATGTCGAAGAAGCTCATATGACTTCAGTGAGCGTAGCGAATCATGGGGGGTTGGTCATGGCGTCTAGAACTAGTGAACTTACGC
TTTCTTTCGAGGGCGAGGTTTATGTGTTCCCCGCAGTTACTCCCGAAAAGGTACAAGCTGTGCTCTTACTTCTTGGAGGGCGTGATGTGCCAGCAGGTGTACCTACAATG
GAAGTACCATACGATCATAATAACAGGGGTATGGTTGACACCCCAAAGCGCTCCAACTTATCACGGAGAATAGCCTCCCTGGTTAGGTTTCGTGAAAAACGGAAAGAGAG
ATGTTTTGACAAGAAAATTAGGTACACTGTACGGAAAGAGGTTGCACAGAGGATGCACCGTAAGAATGGCCAATTTGCATCCTTAAAAGAAAGTTCAGGTGCTTCAAGTT
GGGAGTCAGCACATAGTTGCCTCCAAGATGGTACTCGTTCAGAAACTGTTTTGCGGAAATGTCAACATTGTGGTGTTAGTGAGAACAATACACCTGCAATGCGTCGTGGG
CCTGCTGGACCAAGGACCTTATGCAATGCATGTGGTTTGATGTGGGCAAACAAGGGCACATTGAGAGATCTCAGCAAGGGAGGGAGAAATGTGTCTCTGGATCATATGGA
ACCTGAAACTCCAATGGATGTCAAGCCCATAATCATGGAGGGAGAATTTTCGGGCATCCAGGATGAACATGGAACTCCTGAGGATCCTAGTAAAACCATGACTGAAGGCT
CCAGTAATCCTTCCATTGACCTGGATGAAGAAGACATGAATGAAACCACGGGAGACCTTACAAATTCGTTGCCCATGCGAATTGTCAATCATTCATCAAATGATGATGAG
CAGGAACCTCTTGTTGAACTTGCTAATCCTTCGGATACCGATATAGACATCCCCACTAACTTTGATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTTCTCTCTTTAAAAAGGAAAAACAAAAAAGACTGAAAATTTGAAAATTACCCGTTTGAGTCTCTCCAAGGAAACACAAGGGCACATCTTGCAAATCCTTTAACCATT
TCTGTTAGGGCTTCCGACAAATTCATGGCGGCTGCAAATCCTCAGCCTTTGCAAGCGCGTCCCTTCCAGGAACATGTCCAAGTCCCCTCAATGATGGGGGATGACGACGG
TGAATATGAAGATGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGATGTTATGGATGATGTCGAAGAAGCTCATATGACTTCAGTGAGCGTAGCGAATCATGGGGGGTTGGTCATGG
CGTCTAGAACTAGTGAACTTACGCTTTCTTTCGAGGGCGAGGTTTATGTGTTCCCCGCAGTTACTCCCGAAAAGGTACAAGCTGTGCTCTTACTTCTTGGAGGGCGTGAT
GTGCCAGCAGGTGTACCTACAATGGAAGTACCATACGATCATAATAACAGGGGTATGGTTGACACCCCAAAGCGCTCCAACTTATCACGGAGAATAGCCTCCCTGGTTAG
GTTTCGTGAAAAACGGAAAGAGAGATGTTTTGACAAGAAAATTAGGTACACTGTACGGAAAGAGGTTGCACAGAGGATGCACCGTAAGAATGGCCAATTTGCATCCTTAA
AAGAAAGTTCAGGTGCTTCAAGTTGGGAGTCAGCACATAGTTGCCTCCAAGATGGTACTCGTTCAGAAACTGTTTTGCGGAAATGTCAACATTGTGGTGTTAGTGAGAAC
AATACACCTGCAATGCGTCGTGGGCCTGCTGGACCAAGGACCTTATGCAATGCATGTGGTTTGATGTGGGCAAACAAGGGCACATTGAGAGATCTCAGCAAGGGAGGGAG
AAATGTGTCTCTGGATCATATGGAACCTGAAACTCCAATGGATGTCAAGCCCATAATCATGGAGGGAGAATTTTCGGGCATCCAGGATGAACATGGAACTCCTGAGGATC
CTAGTAAAACCATGACTGAAGGCTCCAGTAATCCTTCCATTGACCTGGATGAAGAAGACATGAATGAAACCACGGGAGACCTTACAAATTCGTTGCCCATGCGAATTGTC
AATCATTCATCAAATGATGATGAGCAGGAACCTCTTGTTGAACTTGCTAATCCTTCGGATACCGATATAGACATCCCCACTAACTTTGATTAGAAAGGTAATCGTTTGCT
TAGGCAATTGGTCTAGGAGGTTTCAAATAATACTTTGGCTGTTAATAATTTCTTGTGCCCGCATAAATCCTAGATGTCAAAACAGTTACTATCAACAACGGAGTGGCAGT
TAGGACTTGTATAATTACAAAAAATGTCCATGACATAAGATTCAAGTGTGCACAGTGGTCATCTTTTGGCCGGGATGTCGCACGCTGGTCTCAGCTGACGTTAGATCTTC
TAACGATGTTGATATTGCTGCCAGAAACTGTTTGTATTCACTGTCGAGTCGAGTTGTTAGGGGATACAGGTTGAGTTCTTCCATCAGTGTATGATCTGAGTGATTCATTT
GGTAGGGTTACTCTTGATTCAATTTTATTGGAAGGTCTGCTTCCATAATTTATCGTCATAATGATGAAGGGATCAAATGCTTGTGGTGTTTGTATCTTAAGATAGACCTT
TTATTTTGCTTCTAATTGACAGTATTATATACAATGACTTGAGCAGTTGCTAATAGAATAAATTTGCACATTACGAATTGTAATTTAGTGATGGCCACTTCCCTTCAGGG
ACCTTTTTAGTATAGACTATGAAGTATTGCCAATAGCAAAATTGGAAAGTTTGTACTGTTATGTTTGGTCATGTATATAAATAAATTGAAAGGAAGTTTTACGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAANPQPLQARPFQEHVQVPSMMGDDDGEYEDGGGGGGGGDVMDDVEEAHMTSVSVANHGGLVMASRTSELTLSFEGEVYVFPAVTPEKVQAVLLLLGGRDVPAGVPTM
EVPYDHNNRGMVDTPKRSNLSRRIASLVRFREKRKERCFDKKIRYTVRKEVAQRMHRKNGQFASLKESSGASSWESAHSCLQDGTRSETVLRKCQHCGVSENNTPAMRRG
PAGPRTLCNACGLMWANKGTLRDLSKGGRNVSLDHMEPETPMDVKPIIMEGEFSGIQDEHGTPEDPSKTMTEGSSNPSIDLDEEDMNETTGDLTNSLPMRIVNHSSNDDE
QEPLVELANPSDTDIDIPTNFD