; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007316 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007316
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionextensin-3-like
Genome locationchr01:16575433..16576714
RNA-Seq ExpressionPI0007316
SyntenyPI0007316
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
BBN11654.1 hypothetical protein Mp_5g13720 [Marchantia polymorpha subsp. ruderalis]6.9e-1156.05Show/hide
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        K KSPPPPP++KSPPPPPP K KSPPPPPPK+   KSPPPPPP    P      +KSPPPPPPK           +        KSPPPPPPK     +K
Subjt:  KHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPP----PKKDEDNNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNK

Query:  SPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDD------NKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
        SPPPPPPK     +KSPPPPPPK+         KSPPPPPP++     KSPPPPPPK
Subjt:  SPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDD------NKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK

CAA2628566.1 unnamed protein product [Spirodela intermedia]6.2e-1252.49Show/hide
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        +S+S L    H  +KSPPPPP K     KSPPPPPP   Y  KSPPPPPPKK      PPPPPP K+    KSPPPPPPK+       P     K+    
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Query:  KSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKK-------------DDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPKR
        KSPPPPPPKK+    KSPPPPPP K+    KSPPPPPPKK              ++ SPPPPPP K+    KSPPPPPPK+
Subjt:  KSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKK-------------DDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPKR

KAA0068050.1 hypothetical protein E6C27_scaffold4741G00020 [Cucumis melo var. makuwa]9.5e-3765.98Show/hide
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        MQGK+GPPIMVSLVI+VLVVAL+LSY TT QAY+DS SSTLTFKDHDKHKSPPPP RKKSPPPPPP KRKSPPPPPPK+++  SPPPPP     + +NKS
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Query:  PPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
        PPPPPPK                    K+PP P         KSPPPPPP+K   DNKSPPPPPP+K DNKSPPPPPP+K E D+  PPPPP K
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XP_011659754.2 extensin-3-like [Cucumis sativus]5.6e-2956.95Show/hide
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        MQGKMGPP+M+SLVIAVLVVAL+LSY+TTAQA+ DS SSTLTF DHD                  H         KS PPPPPYKRKSPPPPPPK+D+  
Subjt:  MQGKMGPPIMVSLVIAVLVVALTLSYSTTAQAYEDSSSSTLTFKDHD-----------------KHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNK

Query:  SPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDEN
        SPPPPPPPK      KSPPPPP K       +P    KK        PPPPPKK   DNKSPPPPPPKKDE +  SPPPPP K +     PPPPP+KDE+
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Query:  DNKSPPPPPPKRMRMITSRLLHH
        +  SPPPPPPK+ +      LHH
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XP_022039692.1 extensin-3-like [Helianthus annuus]2.1e-1258.24Show/hide
Query:  YEDSSSSTLTFKDHDKHKSPPPPPRK-----KSPPPPPP---YKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDE
        YE  S      K H K+KSPPPPP K     KSPPPPPP   YK KSPPPPP K  + KSPPPPPP K  E   KSPPPPPPK        P    KK  
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Query:  DDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
         + KSPPPPPPKK+  + KSPPPPPPKK   + KSPPPPPPKK      PPPPP+K   + KSPPPPPPK
Subjt:  DDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2R6X6Z2 Uncharacterized protein5.7e-1158.17Show/hide
Query:  KHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPP
        K KSPPPPP+ KSPPPPPP K KSPPPPPPK   +KSPPPPPP       +KSPPPPPPK       +P     K+    KSPPPPPPK     +KSPPP
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Query:  PPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDD------NKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
        PPPK     +KSPPPPPPK+         KSPPPPPP++     KSPPPPPPK
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A0A5A7VLF0 Uncharacterized protein4.6e-3765.98Show/hide
Query:  MQGKMGPPIMVSLVIAVLVVALTLSYSTTAQAYEDSSSSTLTFKDHDKHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDEDNNKS
        MQGK+GPPIMVSLVI+VLVVAL+LSY TT QAY+DS SSTLTFKDHDKHKSPPPP RKKSPPPPPP KRKSPPPPPPK+++  SPPPPP     + +NKS
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Query:  PPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
        PPPPPPK                    K+PP P         KSPPPPPP+K   DNKSPPPPPP+K DNKSPPPPPP+K E D+  PPPPP K
Subjt:  PPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK

A0A6J1IP49 extensin-3-like8.2e-1054.32Show/hide
Query:  KDHDKHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDED---NNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNED
        K  D++KSPPPP  KKSPPPPPP  RK PPPPP  K   KSPPPPPP KK        KSPPPPPP++      AP  +        KSPPPP PK    
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Query:  DNKSPPPPPPKKDED----DNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKD---ENDNKSPPPPPPKR
          KSPPPPPP+K         KSPPPPPP+K   KSPPPPPP+K     +  KSPPPPPP++
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A0A7I8JE52 Hypothetical protein3.0e-1252.49Show/hide
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        +S+S L    H  +KSPPPPP K     KSPPPPPP   Y  KSPPPPPPKK      PPPPPP K+    KSPPPPPPK+       P     K+    
Subjt:  SSSSTLTFKDHDKHKSPPPPPRK-----KSPPPPPP---YKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKRMRMITIAPSTTTKKDEDDN

Query:  KSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKK-------------DDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPKR
        KSPPPPPPKK+    KSPPPPPP K+    KSPPPPPPKK              ++ SPPPPPP K+    KSPPPPPPK+
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A0A7I8L3Z0 Hypothetical protein2.8e-1051.87Show/hide
Query:  KDHDKHKSPPPPPRK-----KSPPPPPPYKR-----------------KSPPPPPPKKDD-------------NKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKR
        K+H  +KSPPPPP K     KSPPPPPP K+                 KSPPPPPP K+               KSPPPPPPPKK     KSPPPPPPK+
Subjt:  KDHDKHKSPPPPPRK-----KSPPPPPPYKR-----------------KSPPPPPPKKDD-------------NKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKR

Query:  MRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKD-DNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK
               P     K+    KSPPPPPPKK+    KSPPPPPP K+    KSPPPPPPKK    KSPPPPPP K+    KSPPPPPPK
Subjt:  MRMITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKD-DNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTATAATGGTCTCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTAGCTCTAACCCTATCGTATAGTACAACTGCTCAAGCCTACGAGGATTCCTC
CTCTTCAACACTTACTTTCAAGGATCATGACAAGCACAAGTCTCCACCGCCACCGCCTCGAAAGAAGTCTCCTCCACCGCCACCTCCATACAAAAGGAAGTCGCCTCCTC
CACCACCACCAAAAAAGGATGATAACAAGTCACCCCCTCCACCACCACCACCCAAAAAGGATGAGGATAATAACAAGTCACCCCCTCCACCACCACCAAAAAGGATGAGG
ATGATAACAATCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCCAAAAAGAATGAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCC
ACCACCACCAAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAGAAAGGATGAGAATG
ATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCTCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGATAACAAGTCACCTCCTCCACCACCAA
AGAAACACAAACATGACTCCCCTCCACCACCACCAAGGAAGCACAAGGACAAGTCACCCTCTCCACACCACGATCCTCTCACGACTAATTAGGTCAATAAGGAATTCTCA
TCAACTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACAATTAAGAAAATCTAAGAGTGGATGCAAGGAAAAATGGGTCCTCCTATAATGGTCTCTCTTGTTATTGCAGTTTTGGTGGTAGCTCTAACCCTATCGTATAGTACAAC
TGCTCAAGCCTACGAGGATTCCTCCTCTTCAACACTTACTTTCAAGGATCATGACAAGCACAAGTCTCCACCGCCACCGCCTCGAAAGAAGTCTCCTCCACCGCCACCTC
CATACAAAAGGAAGTCGCCTCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGATAACAAGTCACCCCCTCCACCACCACCACCCAAAAAGGATGAGGATAATAACAAGTCACCCCCT
CCACCACCACCAAAAAGGATGAGGATGATAACAATCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCCAAAAAGAATGA
GGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGATAACAAGTCGCCCCCTCCAC
CACCACCAAGAAAGGATGAGAATGATAACAAGTCGCCCCCTCCACCACCACCAAAAAGGATGAGGATGATAACAAGTCGCCTCCTCCACCACCACCAAAAAAGGATGATA
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AATTAGGTCAATAAGGAATTCTCATCAACTATAAACCTAGAGAAGGATAAAGAATAAAGAAATGAAGAATTATGTATTTAGATCAATTAATTAAAGAAAACAAACTAAAG
TGTTAAAAGAAGGTTGTTTTCATCTATTTGCTACCTATGATTCTATGTGTTTTCTACGTGTGTGTTTGGTATTCCGTTGATTAAATAAAAGTCAATCTTACTCTCGTGTG
TTTCTTAGGGGAAAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQGKMGPPIMVSLVIAVLVVALTLSYSTTAQAYEDSSSSTLTFKDHDKHKSPPPPPRKKSPPPPPPYKRKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPPKKDEDNNKSPPPPPPKRMR
MITIAPSTTTKKDEDDNKSPPPPPPKKNEDDNKSPPPPPPKKDEDDNKSPPPPPPKKDDNKSPPPPPPRKDENDNKSPPPPPPKRMRMITSRLLHHHQKRMITSHLLHHQ
RNTNMTPLHHHQGSTRTSHPLHTTILSRLIRSIRNSHQL