; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007426 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007426
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationchr03:24369094..24369791
RNA-Seq ExpressionPI0007426
SyntenyPI0007426
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]1.4e-9484.21Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]2.5e-9684.05Show/hide
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        M+TQ+YDQISQKSF ITKHED+FF +ALSKELNSTTNSSFRVYYGGAT AIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSKPTLLSSI
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]8.0e-9584.12Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]4.1e-6770.04Show/hide
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        MQ+ NYDQISQK  QI    DRFF   A  LSKE NS  NSSFRVYYGGA+ AIPFRWESRPGTPKH++S+TSIPPLTPPPSY++SSHS SKASSKPTLL
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]3.5e-9080.95Show/hide
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        MQTQNYDQISQKSFQ TKHEDRFF +ALSK+LNSTTNSSFRVYYGGAT AIPFRWESRPGTPKH FSDTSIPPLTPPPSY+SSSHSTSKASSKPTLLSSI
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        FPR                           SSS SSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFS+  SLPFEYSFDD D DEVV GS PNSPTS LCFGG SSSRAS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein1.2e-9684.05Show/hide
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        FPR                            SSSFSSSSSSPS FVRPKFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRA
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein3.9e-9584.12Show/hide
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        FPR                            SSSFSSSSSSPS FVRPKFFKRRR FSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGS APNSPTSILCFGGGSSSR
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein3.9e-9584.12Show/hide
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        FPR                            SSSFSSSSSSPS FVRPKFFKRRR FSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGS APNSPTSILCFGGGSSSR
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein2.0e-6770.04Show/hide
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        MQ+ NYDQISQK  QI    DRFF   A  LSKE NS  NSSFRVYYGGA+ AIPFRWESRPGTPKH++S+TSIPPLTPPPSY++SSHS SKASSKPTLL
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Query:  SSIFPRF----------------MSSSFSS-SSSSPSAFVRPK--FFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFG
        SSIFPR                 +SSSFSS SSS  S+   PK  FFKRRR  SD PSLPFEYSFDD DGDE   GS+ NSPTS LCFGG SSSRAS F 
Subjt:  SSIFPRF----------------MSSSFSS-SSSSPSAFVRPK--FFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFG

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        GCYQLVSVKNA LS+VGHGSA RGT+N
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A0A6J1HHB7 uncharacterized protein LOC1114629251.4e-6570.67Show/hide
Query:  MQTQNYDQISQKSFQITKHEDRFFAKALSKELNSTTNSSFRVYYGGATSAIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYFSS-SHSTSKASSKPTLLSS
        MQT+NYDQ+SQKS +I   ++RF ++ +SK+ NS  NSSFRVYYGGA  AIPFRWESRPGTPKHTFS+TSIPPLTPPPSY+SS SHST KASSKPTLLSS
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Query:  IFPRFMSSSFSSSS----SSPSAFVRPKFFKRRRRFS-DIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIV
        IFPR   SSFS+SS    SSPS FVRPKFFKRRRR S D  SLP EY+ +D DG+E +  S  NSPTS L + GG S R S  GGCYQLVSVKNALL+IV
Subjt:  IFPRFMSSSFSSSS----SSPSAFVRPKFFKRRRRFS-DIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIV

Query:  GHGSASRG
        GHGS +RG
Subjt:  GHGSASRG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein8.4e-1042.86Show/hide
Query:  YYGGATSAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSDTSIP---PLTPPPSYFSSSHSTSKASSKP---TLLSSIFPRF-------MSSSFSSSSSSPSA
        YYGG+++A+PF+WES+PGTP+           ++ SD + P   PLTPPPSYF +S S++K  S     TL SS+  +         SSS SSSSS PS+
Subjt:  YYGGATSAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSDTSIP---PLTPPPSYFSSSHSTSKASSKP---TLLSSIFPRF-------MSSSFSSSSSSPSA

Query:  FVRPKFFKRRRR
         +R      RRR
Subjt:  FVRPKFFKRRRR

AT2G40475.1 unknown protein4.2e-1741.67Show/hide
Query:  AKALSKELNSTTNSSFRVYYGGATSAIPFRWESRPGTPKHT-FSDT-SIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK----------PTLLSSIFPR---FMSSSF
        +K + KE +S  NSS R+YY G  S +PF WE+RPGTPKH  FS++  +PPLTPPPSY+SSS S+    SK           TLLS    R     SS+ 
Subjt:  AKALSKELNSTTNSSFRVYYGGATSAIPFRWESRPGTPKHT-FSDT-SIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK----------PTLLSSIFPR---FMSSSF

Query:  SSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSASR
        SSSSSS S+   P   + R R     S    Y  +D D +E+V+    +SPTS LC+  G SS          + S+K AL S++ HGS+ +
Subjt:  SSSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSASR

AT3G56260.2 unknown protein1.7e-1040Show/hide
Query:  YYGGATSAIPFRWESRPGTPK-HTFSDTSIP-PLTPPPSYFSSS-HSTSKASSKPTLLSSIFPRF----------------MSSSFS-SSSSSPSAFVRP
        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  SD+S+P PLTPPPSY+SS   ST +  SK     S F  F                 SSSFS SS+SS S+F   
Subjt:  YYGGATSAIPFRWESRPGTPK-HTFSDTSIP-PLTPPPSYFSSS-HSTSKASSKPTLLSSIFPRF----------------MSSSFS-SSSSSPSAFVRP

Query:  KFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS
             ++R S     P  Y+  ++D          +SPTS LC   G        G    + SV  AL S
Subjt:  KFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS

AT5G01790.1 unknown protein3.8e-1057.89Show/hide
Query:  SFRV-YYGGATSAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK
        SFR+ YY GA  A+PF WES PGTPKH  S+  ++PPLTPPPS+FS S    +  SK
Subjt:  SFRV-YYGGATSAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACTCAAAACTATGACCAAATCTCTCAAAAATCTTTCCAAATTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCGCTAAAGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCACCAA
CTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGCGCCACCAGTGCAATTCCGTTCCGATGGGAGTCCCGACCGGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGACACTTCAATCCCTCCTC
TTACTCCTCCTCCTTCTTACTTTTCCTCTTCACATTCTACTTCCAAAGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGCTTCATGTCATCCTCTTTCTCA
TCGTCCTCCTCATCTCCCTCGGCTTTTGTTAGACCTAAATTCTTCAAACGTCGCCGTCGCTTCTCGGATATTCCAAGCTTACCGTTCGAGTATAGCTTTGACGATAAAGA
CGGAGACGAGGTAGTGGCCGGGAGTGCTCCGAATTCTCCTACTTCAATTTTGTGCTTTGGTGGTGGTTCTTCAAGTAGAGCTTCATTGTTTGGAGGTTGTTATCAGTTAG
TGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCTATTGTTGGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGTACTCTTAATAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAACTCAAAACTATGACCAAATCTCTCAAAAATCTTTCCAAATTACCAAACATGAAGATAGATTCTTCGCTAAAGCTCTATCCAAAGAGCTCAATTCCACCACCAA
CTCCTCTTTTCGAGTCTATTACGGCGGCGCCACCAGTGCAATTCCGTTCCGATGGGAGTCCCGACCGGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGACACTTCAATCCCTCCTC
TTACTCCTCCTCCTTCTTACTTTTCCTCTTCACATTCTACTTCCAAAGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCTCGCTTCATGTCATCCTCTTTCTCA
TCGTCCTCCTCATCTCCCTCGGCTTTTGTTAGACCTAAATTCTTCAAACGTCGCCGTCGCTTCTCGGATATTCCAAGCTTACCGTTCGAGTATAGCTTTGACGATAAAGA
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TGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCTATTGTTGGCCATGGATCTGCAAGTAGAGGTACTCTTAATAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQTQNYDQISQKSFQITKHEDRFFAKALSKELNSTTNSSFRVYYGGATSAIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYFSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPRFMSSSFS
SSSSSPSAFVRPKFFKRRRRFSDIPSLPFEYSFDDKDGDEVVAGSAPNSPTSILCFGGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSASRGTLNN