; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007593 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007593
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Descriptionprotein RALF-like 19
Genome locationchr08:18570182..18570519
RNA-Seq ExpressionPI0007593
SyntenyPI0007593
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8647467.1 hypothetical protein Csa_004319 [Cucumis sativus]4.1e-3074.74Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGFNNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARFTD
        MRS KLCLFLLL+AVVAAPL LA SDDWTR+Y    ++DFT +NEDSRR       NN PCR+RG SYYDC KRKKANPYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGFNNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARFTD

XP_004148669.1 protein RALF-like 19 [Cucumis sativus]2.3e-3369.64Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG
        MRS KLCLFLLL+AVVAAPL LA SDDWTR+Y    ++DFT +NEDSRRLLFQYGF                 NN PCR+RG SYYDC KRKKANPYRRG
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_008441015.1 PREDICTED: protein RALF-like 19 [Cucumis melo]4.7e-3472.32Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG
        MRSMKL LFLL++AVVAAPL LAFSDDWT AY  A N+DFT NNEDSRRLLFQYGF                 NNSPCR+RG SYYDC KR+KANPYRRG
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

XP_016902249.1 PREDICTED: protein RALF-like 4 [Cucumis melo]1.3e-2057.63Show/hide
Query:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA
        MKLCL  LLLVA  AA L +A   DWTRA+     + F  N+        +DSRRLLFQYGF                 NNSPCR RG SYYDCTKR+KA
Subjt:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA

Query:  NPYRRGCIAITGCARFTD
        NPYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  NPYRRGCIAITGCARFTD

XP_038876152.1 uncharacterized protein LOC120068449 [Benincasa hispida]2.7e-2157.63Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDF------TANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA
        M +MKLCLFLLLVA V +PLS A+S DWT AY  A  + F      TA  ED+RRLLFQYGF                 NN PC +RG SYYDC + +KA
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDF------TANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA

Query:  NPYRRGCIAITGCARFTD
        NPYRRGC AITGCARFTD
Subjt:  NPYRRGCIAITGCARFTD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHU4 Uncharacterized protein1.1e-3369.64Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG
        MRS KLCLFLLL+AVVAAPL LA SDDWTR+Y    ++DFT +NEDSRRLLFQYGF                 NN PCR+RG SYYDC KRKKANPYRRG
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A1S3B2H7 protein RALF-like 192.3e-3472.32Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG
        MRSMKL LFLL++AVVAAPL LAFSDDWT AY  A N+DFT NNEDSRRLLFQYGF                 NNSPCR+RG SYYDC KR+KANPYRRG
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

A0A1S4E1Z3 protein RALF-like 46.5e-2157.63Show/hide
Query:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA
        MKLCL  LLLVA  AA L +A   DWTRA+     + F  N+        +DSRRLLFQYGF                 NNSPCR RG SYYDCTKR+KA
Subjt:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA

Query:  NPYRRGCIAITGCARFTD
        NPYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  NPYRRGCIAITGCARFTD

A0A5A7SVY5 Protein RALF-like 46.5e-2157.63Show/hide
Query:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA
        MKLCL  LLLVA  AA L +A   DWTRA+     + F  N+        +DSRRLLFQYGF                 NNSPCR RG SYYDCTKR+KA
Subjt:  MKLCL-FLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANN--------EDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKA

Query:  NPYRRGCIAITGCARFTD
        NPYRRGCIAITGCARFTD
Subjt:  NPYRRGCIAITGCARFTD

A0A5D3DPV5 Protein RALF-like 192.3e-3472.32Show/hide
Query:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG
        MRSMKL LFLL++AVVAAPL LAFSDDWT AY  A N+DFT NNEDSRRLLFQYGF                 NNSPCR+RG SYYDC KR+KANPYRRG
Subjt:  MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGF-----------------NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRG

Query:  CIAITGCARFTD
        CIAITGCARFTD
Subjt:  CIAITGCARFTD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 192.1e-0841.12Show/hide
Query:  LCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTAS---------NFDFTANNEDSRRLL------FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAI
        L L LL +AVVA   +      WT      +           D+  ++E +RR L        YG    NN PC  RG SYYDC KRK+ANPYRRGC  I
Subjt:  LCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTAS---------NFDFTANNEDSRRLL------FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAI

Query:  TGCARFT
        T C R T
Subjt:  TGCARFT

Q8L9P8 Protein RALF-like 333.3e-0645.16Show/hide
Query:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F  ++E +RR+L       YG    N  PC  RG+SYY+C +  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Q945T0 Rapid alkalinization factor5.7e-0643.75Show/hide
Query:  ASNFDFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGC
        A   +F  ++E +RR+L       YG    N+ PC  RG+SYY+C    +ANPY RGC AIT C
Subjt:  ASNFDFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGC

Q9FZA0 Protein RALF-like 41.6e-0867.57Show/hide
Query:  NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        NN PC  RG SYYDC KR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARF

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 233.3e-0645.16Show/hide
Query:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F  ++E +RR+L       YG    N  PC  RG+SYY+C +  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28270.1 ralf-like 41.1e-0967.57Show/hide
Query:  NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARF
        NN PC  RG SYYDC KR++ NPYRRGC AIT C R+
Subjt:  NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARF

AT2G33775.1 ralf-like 191.5e-0941.12Show/hide
Query:  LCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTAS---------NFDFTANNEDSRRLL------FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAI
        L L LL +AVVA   +      WT      +           D+  ++E +RR L        YG    NN PC  RG SYYDC KRK+ANPYRRGC  I
Subjt:  LCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTAS---------NFDFTANNEDSRRLL------FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAI

Query:  TGCARFT
        T C R T
Subjt:  TGCARFT

AT3G05490.1 ralf-like 221.2e-0646.55Show/hide
Query:  NNEDSRRLLFQ-----YGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +++ SRR+L Q     YG    N+ PC  RG+SYY+C +  +ANPY RGC  IT C R
Subjt:  NNEDSRRLLFQ-----YGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 232.4e-0745.16Show/hide
Query:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F  ++E +RR+L       YG    N  PC  RG+SYY+C +  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR

AT4G15800.1 ralf-like 332.4e-0745.16Show/hide
Query:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR
        +F  ++E +RR+L       YG    N  PC  RG+SYY+C +  +ANPY RGC AIT C R
Subjt:  DFTANNEDSRRLL-----FQYGF---NNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGATCGATGAAGCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCGTGGCAGTCGTTGCCGCTCCACTTTCCCTTGCCTTCTCCGACGACTGGACTCGCGCCTACGACACTGCCTCCAA
CTTCGACTTTACGGCGAATAATGAAGACAGCCGACGGCTACTTTTCCAATATGGATTTAACAATTCCCCCTGCCGCTATCGTGGTAGCTCTTACTATGACTGCACCAAGC
GTAAGAAGGCCAACCCTTACCGTCGTGGCTGCATTGCCATCACCGGCTGCGCTCGTTTCACCGACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGATCGATGAAGCTCTGCCTATTTCTCCTCCTCGTGGCAGTCGTTGCCGCTCCACTTTCCCTTGCCTTCTCCGACGACTGGACTCGCGCCTACGACACTGCCTCCAA
CTTCGACTTTACGGCGAATAATGAAGACAGCCGACGGCTACTTTTCCAATATGGATTTAACAATTCCCCCTGCCGCTATCGTGGTAGCTCTTACTATGACTGCACCAAGC
GTAAGAAGGCCAACCCTTACCGTCGTGGCTGCATTGCCATCACCGGCTGCGCTCGTTTCACCGACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSMKLCLFLLLVAVVAAPLSLAFSDDWTRAYDTASNFDFTANNEDSRRLLFQYGFNNSPCRYRGSSYYDCTKRKKANPYRRGCIAITGCARFTD