; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0007652 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0007652
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationchr05:8086382..8088091
RNA-Seq ExpressionPI0007652
SyntenyPI0007652
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
NP_001267647.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucumis sativus]2.8e-11499.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LHJ8 PSI subunit V1.3e-11499.08Show/hide
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A0A1S3B555 PSI subunit V3.5e-115100Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V1.6e-11297.7Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V6.3e-11296.77Show/hide
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P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic3.0e-7970.18Show/hide
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P51222 Photosystem I reaction center subunit XI5.0e-3450Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.4e-11698.62Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.0e-9077.17Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic3.1e-9278.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l2.2e-9378.08Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATTAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGA
CTCCAGTAACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTACCTATCAAACCTCCCAGCCTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTCGCTCACGGT
TTCTTTCTGGTTGGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCTATGCCGGAGGAGCAGGCTCACTGGCTGCCGGTGGTCTCATTGTCATTTTGAGCATCTG
CTTGACAATGTATGGTGTTGCATCATTTAATGAAGGAGAGCCATCTACCGCACCATCATTGACTTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCCTCTGCAAACAGCTGATG
GATGGGCAAAATTCTCCGGCGGGTTCTTCTTCGGCGGTATCTCTGGTGTGATCTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTACGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAGAGAGAGAGAAGGAAAGCCAAATCCAAACCTCTGATTTTCTCATGAGAGAGAAAGGAATGGATAAGGGATAAGGTTATGTGGCAAGTTCCATCCAATGAGAAGA
GAAAGGTTTGATCAACCACAGCCTCCCACAAATTTCCATGGCCAGTGACAACCAACAACAAGAACTTAAACTAACCCCCAAAACCAAATCTAAAAATATCACCTCATTCT
TCTTCTCTGCCACTGATCCTTCCACCAGCCAAAGGCAGCAGAAGCAAAAGCAGCAGCCATGGCCACTGCAACCTCCCCCATTGCCAGCCAGCTCAGTTCCAGCTTCGCTT
CATCCAACACCAGAGCTTTGATCTCTCCTAAAGGCCTCTCCGCTTCGCCCCTGCGACGCATCCCTACAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATCCAAGCTGATAAG
CCAACTTACCAAGTGATCCAGCCAATTAATGGAGACCCATTCATTGGAAGCCTTGAGACTCCAGTAACCTCAAGCCCACTGATAGCATGGTACCTATCAAACCTCCCAGC
CTACAGAACAGCAGTCAGCCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTGGGCCTCGCTCACGGTTTCTTTCTGGTTGGTCCATTTGTCAAAGCTGGCCCTCTAAGGAACACAGCCT
ATGCCGGAGGAGCAGGCTCACTGGCTGCCGGTGGTCTCATTGTCATTTTGAGCATCTGCTTGACAATGTATGGTGTTGCATCATTTAATGAAGGAGAGCCATCTACCGCA
CCATCATTGACTTTGACTGGCCGGAAGAAGACCCCTGATCCTCTGCAAACAGCTGATGGATGGGCAAAATTCTCCGGCGGGTTCTTCTTCGGCGGTATCTCTGGTGTGAT
CTGGGCATACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTCCCTTACTACGTCAAGTAGATTTTGTATCATTTTCTGTTTCTACAATGCAACTTCCATGTCTGTGTTATGGAAACAT
AAAATTGTATATTTTCTGCCAAACCTCTTTGTTAGATCCTTTGTGATTGCATATCGATTTCCCTTTTGAAACTGTTATGTATGTACCCTACTTCCATTTGCTTCTTCACA
AACAATAGCTTCTGTGACCCTGCATTAAAAATTGGTAGGAGAAGAATATCAACAATACAATGGTTTTCTTTTCTGTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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