; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0008184 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0008184
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
Description30S ribosomal protein S9
Genome locationchr04:28336176..28338414
RNA-Seq ExpressionPI0008184
SyntenyPI0008184
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0000312 - plastid small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000754 - Ribosomal protein S9
IPR014721 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold, subgroup
IPR020568 - Ribosomal protein S5 domain 2-type fold
IPR020574 - Ribosomal protein S9, conserved site
IPR023035 - Ribosomal protein S9, bacterial/plastid


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004147796.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucumis sativus]6.7e-9495.1Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKP+ALSFPRSKSLLISP+SSTS LVV+ASAA+ VETADLKTFVKSSLPGGFAAQTL GTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYR+AKEYLQGNPLWLQYV++PLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_008466625.1 PREDICTED: 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucumis melo]2.1e-9596.57Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKP ALSFPRSKSLLISP+SSTSPL+VSASAA+AVETADLK+FVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_022143016.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Momordica charantia]1.9e-8889.22Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MA+SISSLAFSLSSLSFSSQ+S KPN LSFPRSKSL+IS   ++SPLVVSASAA+ VETA+L++FVKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV++EGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHR+PLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_022940950.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Cucurbita moschata]2.5e-8890.69Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATS+SSLAFSLSSLSFSSQVS  PN+LSFPRSKSL+IS   S SPLVVSASA SAVETA+LK +VKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVL+EGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

XP_038903352.1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic [Benincasa hispida]2.5e-9394.61Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATS+SSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSL IS  SST+PLVVSASAA+ VETADL++FVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LDS0 Uncharacterized protein3.2e-9495.1Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKP+ALSFPRSKSLLISP+SSTS LVV+ASAA+ VETADLKTFVKSSLPGGFAAQTL GTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYR+AKEYLQGNPLWLQYV++PLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A1S3CRR0 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.0e-9596.57Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKP ALSFPRSKSLLISP+SSTSPL+VSASAA+AVETADLK+FVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A5A7UBW5 30S ribosomal protein S91.0e-9596.57Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKP ALSFPRSKSLLISP+SSTSPL+VSASAA+AVETADLK+FVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A6J1CNY0 30S ribosomal protein S9, chloroplastic9.1e-8989.22Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MA+SISSLAFSLSSLSFSSQ+S KPN LSFPRSKSL+IS   ++SPLVVSASAA+ VETA+L++FVKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSA+ARVV++EGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHR+PLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

A0A6J1FS60 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.2e-8890.69Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK
        MATS+SSLAFSLSSLSFSSQVS  PN+LSFPRSKSL+IS   S SPLVVSASA SAVETA+LK +VKS LPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVL+EGTGK
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGK

Query:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ
        VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPL+TLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVS DHRSPLKKEGLLTRD+RVVERKKAGLKKARKAPQ
Subjt:  VIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQ

Query:  FSKR
        FSKR
Subjt:  FSKR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B2ITM7 30S ribosomal protein S94.7e-3460.48Show/hide
Query:  GTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTR
        GTGRRK+AVARV L  GTG++ +N +D   Y Q NP +L  ++ PL TLG E+ YD+ VKAEGGGL+GQA ++ LG+ARAL ++  D+R PLK EG LTR
Subjt:  GTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTR

Query:  DARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        D R  ERKK GL KARKAPQ+SKR
Subjt:  DARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

P82278 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.5e-7272.12Show/hide
Query:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASA----VETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLRE
        MA SISSL  S +SLSF+S ++ KP  L   R+K   +S  +   PLV++A++A+A     ETADL+ FVKS LPGGFAAQT+IGTGRRK A+ARVVL+E
Subjt:  MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASA----VETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLRE

Query:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKAR
        GTGK IINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+ PL TLGYE++YDVFVKA GGGLSGQAQAISLG+ARALLKVS  HR+PLK+EGLLTRD+R+VERKK GLKKAR
Subjt:  GTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKAR

Query:  KAPQFSKR
        KAPQFSKR
Subjt:  KAPQFSKR

Q8DMK7 30S ribosomal protein S91.5e-3562.4Show/hide
Query:  IGTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLT
        +GTGRRKSAVARV L  G+G++ IN R+  +YLQ NP++L  V+ PL TLG E+SYD++V A GGGL+GQA AI LGIARAL ++  ++R PLK EG LT
Subjt:  IGTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLT

Query:  RDARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        RD R  ER+K GL+KARKAPQ+SKR
Subjt:  RDARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

Q9MUV1 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.1e-3566.4Show/hide
Query:  IGTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLT
        +GTGRRKSAVARV L  G G+VIIN      YLQ N  +L  VR PL TLG E +YD+ VKA GGGL+GQA+AI LG+ARAL  +   +R PLKKEG LT
Subjt:  IGTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLT

Query:  RDARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        RD+RV ERKK GLKKARKAPQFSKR
Subjt:  RDARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR

Q9XJ27 30S ribosomal protein S9, chloroplastic1.5e-7575.73Show/hide
Query:  SISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAV-----ETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGT
        SI++LA SLSSLSFSSQVS +PN +SFPR+ S+   P  S     +S +A  +      E  +LK +VKS LPGGFAAQ +IGTGRRK A+ARVVL+EGT
Subjt:  SISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAV-----ETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGT

Query:  GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA
        GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYE+SYD+FVKA GGGLSGQAQAI+LG+ARALLKVS DHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA
Subjt:  GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA

Query:  PQFSKR
        PQFSKR
Subjt:  PQFSKR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74970.1 ribosomal protein S91.0e-7675.73Show/hide
Query:  SISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAV-----ETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGT
        SI++LA SLSSLSFSSQVS +PN +SFPR+ S+   P  S     +S +A  +      E  +LK +VKS LPGGFAAQ +IGTGRRK A+ARVVL+EGT
Subjt:  SISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAV-----ETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGT

Query:  GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA
        GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYV+VPLVTLGYE+SYD+FVKA GGGLSGQAQAI+LG+ARALLKVS DHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA
Subjt:  GKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKA

Query:  PQFSKR
        PQFSKR
Subjt:  PQFSKR

AT3G49080.1 Ribosomal protein S5 domain 2-like superfamily protein1.2e-1643.55Show/hide
Query:  GTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTR
        GTGRRK ++ARV ++ G GK  +N ++   Y          +R PL        +D+    +GGG +GQ  AI LGI+RAL     D R+ L+  G LTR
Subjt:  GTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKEYLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTR

Query:  DARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR
        D+RVVERKK G  KARK+ Q+ KR
Subjt:  DARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTTCTATATCCTCACTTGCATTTTCTCTATCTTCTCTCTCCTTTTCTTCCCAAGTATCACACAAGCCAAATGCCCTCTCCTTTCCCCGCTCAAAATCTCTTCT
AATTTCCCCTACCTCCTCTACTTCCCCACTTGTCGTATCTGCCTCCGCCGCTTCCGCTGTCGAGACGGCCGACCTTAAGACCTTCGTCAAATCGAGCCTCCCTGGTGGTT
TCGCCGCTCAAACGCTTATTGGTACTGGTCGCCGGAAATCTGCCGTAGCTCGTGTTGTCCTTCGAGAAGGCACTGGCAAAGTTATTATCAATTACCGCGACGCTAAGGAA
TACCTTCAAGGAAATCCATTATGGCTTCAATATGTAAGAGTTCCATTAGTAACATTAGGATATGAAAGTAGCTACGATGTATTCGTGAAAGCCGAAGGAGGTGGGCTGTC
TGGCCAGGCTCAGGCAATTTCCCTTGGCATTGCTCGTGCTCTGCTAAAGGTGAGTGATGATCACAGATCACCTCTAAAGAAAGAGGGGCTTTTGACAAGAGACGCTAGAG
TTGTGGAGAGAAAGAAGGCTGGTCTCAAGAAAGCTCGTAAAGCCCCACAATTCTCCAAGCGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGATATAGTAAATTCACACACATTATCCCCTTCCAGTTTCATCATCTCATCTCAGCTGTTCTTGGATACACTGCAGTTTCAATTTCTTGAAGGGACTACCTTCATTCTG
GATAGACAATGGCTACTTCTATATCCTCACTTGCATTTTCTCTATCTTCTCTCTCCTTTTCTTCCCAAGTATCACACAAGCCAAATGCCCTCTCCTTTCCCCGCTCAAAA
TCTCTTCTAATTTCCCCTACCTCCTCTACTTCCCCACTTGTCGTATCTGCCTCCGCCGCTTCCGCTGTCGAGACGGCCGACCTTAAGACCTTCGTCAAATCGAGCCTCCC
TGGTGGTTTCGCCGCTCAAACGCTTATTGGTACTGGTCGCCGGAAATCTGCCGTAGCTCGTGTTGTCCTTCGAGAAGGCACTGGCAAAGTTATTATCAATTACCGCGACG
CTAAGGAATACCTTCAAGGAAATCCATTATGGCTTCAATATGTAAGAGTTCCATTAGTAACATTAGGATATGAAAGTAGCTACGATGTATTCGTGAAAGCCGAAGGAGGT
GGGCTGTCTGGCCAGGCTCAGGCAATTTCCCTTGGCATTGCTCGTGCTCTGCTAAAGGTGAGTGATGATCACAGATCACCTCTAAAGAAAGAGGGGCTTTTGACAAGAGA
CGCTAGAGTTGTGGAGAGAAAGAAGGCTGGTCTCAAGAAAGCTCGTAAAGCCCCACAATTCTCCAAGCGTTGAGGTTCAATTTTCCTCTTCAATTGTTTTACGTTCCCCC
GTTTCCTACTTTATTTGTACAACCCAGATGTTTTCTTCTACTTTTCCTTTACTCTCTAATGTAGTGTTATTCCAACATTTCTCCATATGAAAAAAAAAAAGTCAACCCAA
AATTGATCATTGTAATTCTTTTAAAATAAACATTTTCTCGTTGGAAAAACCCTCGTGAATAAGCAGAAAAGTAATAGAGAAATTGGAATACATGAATTAAAGTGAGTTTT
TTAATCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATSISSLAFSLSSLSFSSQVSHKPNALSFPRSKSLLISPTSSTSPLVVSASAASAVETADLKTFVKSSLPGGFAAQTLIGTGRRKSAVARVVLREGTGKVIINYRDAKE
YLQGNPLWLQYVRVPLVTLGYESSYDVFVKAEGGGLSGQAQAISLGIARALLKVSDDHRSPLKKEGLLTRDARVVERKKAGLKKARKAPQFSKR