; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0008460 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0008460
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionBHLH domain-containing protein
Genome locationchr03:823217..825589
RNA-Seq ExpressionPI0008460
SyntenyPI0008460
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR024097 - Basic helix-loop-helix leucine zipper transcription factor
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060972.1 transcription factor bHLH49 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-16894.08Show/hide
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XP_016899947.1 PREDICTED: transcription factor bHLH74 isoform X2 [Cucumis melo]7.1e-12892.45Show/hide
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XP_038885625.1 transcription factor bHLH74-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.2e-14078.75Show/hide
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         T+ E ++     DPR  T HT+PHVMF LHGT PT+PKTTS QLSSLFKM+R
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNP9 BHLH domain-containing protein9.9e-16892.6Show/hide
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A0A1S3BA09 transcription factor bHLH49 isoform X14.4e-16893.79Show/hide
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A0A1S4DVD5 transcription factor bHLH74 isoform X23.4e-12892.45Show/hide
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A0A5A7UYJ9 Transcription factor bHLH49 isoform X15.2e-16994.08Show/hide
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        C RGENVND RSRTFHTSPHVMFQL+GT PTMPKTTSP
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A0A6P6GAR5 transcription factor bHLH74 isoform X34.6e-4844.69Show/hide
Query:  FGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELST----ASLENEGVKTISNLLHDPSTLSF-------DMFGSGNFSDMVGSFGFLTEPDHSQIANTKCPF
        F  S+  P++ +  S S   G SS     ELS       LEN+G+ + S+L+  PS  SF         FGSG+FS+MVGSFG     + S IANT CP 
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Query:  SYVQILDD-EEMVSP----KNDAKSRPD-----CVNENQRKFVLGSNSS-SPNKNAE----DNLNVEPTEIL-NKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAK
         Y    +   E  SP     +D +   D       +  +RK  L S+S  SPNKNAE     +L+ E ++++ +  +K  K E   S N   K  GKQ+K
Subjt:  SYVQILDD-EEMVSP----KNDAKSRPD-----CVNENQRKFVLGSNSS-SPNKNAE----DNLNVEPTEIL-NKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAK

Query:  GGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLT
          S + +APKENYI V+ RRG+A N+HSLAERVRREKISERM++LQ+LVPGCN+ITGK V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ E+I   
Subjt:  GGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLT

Query:  NNSYLSSSNVLCTRGENVN----DPRSRTFHTSPHVMFQLHGTTPTMPKTTSPQLSSL
              S ++L +RG N       P   +     H +FQ  GT PT+P +TSPQ +SL
Subjt:  NNSYLSSSNVLCTRGENVN----DPRSRTFHTSPHVMFQLHGTTPTMPKTTSPQLSSL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NKN9 Transcription factor bHLH742.2e-3146.7Show/hide
Query:  NKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITG
        NK A +    +P    +++ K  K         N +S     K  SQ+ +APKENYI ++ RRG+A N+HSLAERVRREKISERM++LQ+LVPGCN+ITG
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Query:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLTNNSYLSSSNVLCTRGENVNDPRSRTFHTSPHVMFQLHGTTPTMPKTTSPQLSSL
        K V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ ++I         + ++L +R  N     + T   +P   FQ  G  P +  TT+PQ + L
Subjt:  KTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLTNNSYLSSSNVLCTRGENVNDPRSRTFHTSPHVMFQLHGTTPTMPKTTSPQLSSL

Q93W88 Transcription factor bHLH1371.5e-2447.68Show/hide
Query:  NENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDG------KQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRR
        N    K    + +++   ++ D L+  P+ I N    T K   R + N N   +G      K+ K GS+  + P  +YI V+ RRG+A ++HSLAERVRR
Subjt:  NENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDG------KQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRR

Query:  EKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASV
        EKISERM+ LQ LVPGC+++TGK ++LDEIINYVQ+LQ QVEFLSMKL S+
Subjt:  EKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASV

Q9C670 Transcription factor bHLH766.9e-2557.5Show/hide
Query:  DKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQV
        DK QK E   ++N N  +  KQ         + K+ YI ++ RRG+A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGC+++TGK V+LDEIINYVQSLQ Q+
Subjt:  DKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQV

Query:  EFLSMKLASVG--LESSLET
        EFLSMKL++V   L+ +LE+
Subjt:  EFLSMKLASVG--LESSLET

Q9CAA9 Transcription factor bHLH492.3e-2847.13Show/hide
Query:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVNENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRG
        + ++   S  N  K R    N  +RK     NS +   +       EP    N  D+ +  E   ++     + GKQ   G Q+   PK+ YI V+ RRG
Subjt:  LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVNENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRG

Query:  RAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETE
        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGCN++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E
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Q9SRT2 Transcription factor bHLH622.4e-2549.01Show/hide
Query:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDGKQAKGGSQNVQA-----PKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTV
        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ RRG+A ++HSLAERVRREKISERMK+LQ LVPGCN++TGK +
Subjt:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDGKQAKGGSQNVQA-----PKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL+SV        + + L+ + + SS+N++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10120.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.6e-3246.7Show/hide
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        NK A +    +P    +++ K  K         N +S     K  SQ+ +APKENYI ++ RRG+A N+HSLAERVRREKISERM++LQ+LVPGCN+ITG
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        K V+LDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLA+V  E +++ ++I         + ++L +R  N     + T   +P   FQ  G  P +  TT+PQ + L
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AT1G68920.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.6e-2947.13Show/hide
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        + ++   S  N  K R    N  +RK     NS +   +       EP    N  D+ +  E   ++     + GKQ   G Q+   PK+ YI V+ RRG
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        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGCN++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E
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AT1G68920.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.6e-2947.13Show/hide
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        + ++   S  N  K R    N  +RK     NS +   +       EP    N  D+ +  E   ++     + GKQ   G Q+   PK+ YI V+ RRG
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        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGCN++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E
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AT1G68920.3 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.1e-2947.7Show/hide
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        + ++   S  N  K R    N  +RK   G NS +   +       EP    N  D+ +  E   ++     + GKQ   G Q+   PK+ YI V+ RRG
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        +A N+HSLAERVRREKISERMK LQ LVPGCN++TGK V+LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKLA+V  +     E
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AT3G07340.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.7e-2649.01Show/hide
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        L++  KT+  ++  SA  ++K       SD K+ K   +N        P ++YI V+ RRG+A ++HSLAERVRREKISERMK+LQ LVPGCN++TGK +
Subjt:  LNKADKTQKVEHRMSANFNTK-------SDGKQAKGGSQNVQA-----PKENYIRVQERRGRAANNHSLAERVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTV

Query:  VLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLTNNSYLSSSNVL
        +LDEIINYVQSLQ+QVEFLSMKL+SV        + + L+ + + SS+N++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAACCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATA
TGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAACCTGATCACAGTCAGATCGCCAATACTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATT
CTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAATGAAAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAA
TAAGAATGCTGAAGATAATTTGAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACACAGAAAGTTGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAG
ATGGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTTCAAGAGCGGCGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAA
AGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGGTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCAATCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATTAACTA
TGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTCTATCGATGAAACTCGCAAGTGTCGGACTAGAATCAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCGACTCACAAATAATTCATACC
TTTCGTCATCGAATGTTCTTTGTACGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCCTAGATCAAGGACATTTCACACAAGTCCTCATGTCATGTTTCAACTTCATGGAACAACGCCA
ACCATGCCAAAAACTACATCCCCGCAACTTTCTAGCCTTTTCAAGATGAAACGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAAAAGTAGGGAATCTGTATTTTTTTTCCAAGTCTCTTGAGCTGTTACTTAGCTAAGGCCATTGTTTTTTCATATTTGTCTCAACTTTATGCTCTGAAAGGTTCTTTCA
CTTTATAATGTTTGTTAGATTTTATGCTTCACATATTAGATTTCCTTTTGGTTTCATAAAGCTGTACATTTTACTTTTTCCTGTTTACTCCTTTCTATGAAATCACCACC
TTCCCAACTTTGGTCAAACTCCTCTTCTTCATCTTCTCTTTTACACTTCTAAATTTCAGTCCTTTATTCTGTTTTTTCTGACACACAAGTTTTAGTTTAGTATCCTTTAG
TTTTTCTTTCTCTTTCGAATTTGGTTTGGGTGCCCAAATTGGGAAATGGCTGGTTCTACTTCTAGCTTTCAATGTGAAATAATGAAGTGTTCTTTTGGAGTTAGCAGTTC
TCAGCCATTGATTGGAGTTGATACTTCTTTTTCATCTACTCTCGGATCTTCTTCAACAACTCCTCTATGTGAATTATCCACAGCTTCTTTGGAGAATGAGGGAGTGAAAA
CCATTTCTAACCTTCTTCATGATCCTTCAACTTTGAGTTTTGATATGTTTGGAAGTGGGAACTTCTCAGATATGGTGGGTTCTTTTGGCTTTCTAACTGAACCTGATCAC
AGTCAGATCGCCAATACTAAGTGTCCATTTAGTTATGTGCAAATTCTGGATGACGAAGAAATGGTCTCACCAAAGAACGATGCAAAGTCTCGACCCGATTGCGTTAATGA
AAATCAAAGAAAATTTGTTCTTGGTTCCAATTCTTCTAGCCCAAATAAGAATGCTGAAGATAATTTGAATGTGGAACCAACTGAGATCCTTAATAAAGCTGACAAAACAC
AGAAAGTTGAGCATAGAATGAGTGCAAATTTTAACACCAAATCAGATGGTAAACAAGCCAAAGGAGGCTCTCAAAATGTACAAGCCCCCAAGGAGAATTATATTCGTGTT
CAAGAGCGGCGGGGCCGAGCTGCTAATAACCATAGCCTCGCAGAAAGGGTTAGAAGGGAAAAAATCAGCGAACGAATGAAGGTGCTGCAACAGCTTGTTCCTGGATGCAA
TCAGATTACCGGGAAAACCGTGGTGCTCGACGAAATTATTAACTATGTACAATCACTGCAACAACAGGTCGAGTTTCTATCGATGAAACTCGCAAGTGTCGGACTAGAAT
CAAGCTTGGAGACAGAGCAGATTCGACTCACAAATAATTCATACCTTTCGTCATCGAATGTTCTTTGTACGAGAGGCGAAAACGTCAACGATCCTAGATCAAGGACATTT
CACACAAGTCCTCATGTCATGTTTCAACTTCATGGAACAACGCCAACCATGCCAAAAACTACATCCCCGCAACTTTCTAGCCTTTTCAAGATGAAACGATAACCAGTTCT
TCGAAGTTCAAGTAGATGATTAAAATTATGCAGCTTCAAAAACCAGAGATGGATGTCAGTATTTATCCTTTGATAGTCACTACAAGTGCAGCAAATTAATTAAGACAGCA
ATGTAAAAACAGTACTCATTTGATTGAATTCAAATGCTGTTCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGSTSSFQCEIMKCSFGVSSSQPLIGVDTSFSSTLGSSSTTPLCELSTASLENEGVKTISNLLHDPSTLSFDMFGSGNFSDMVGSFGFLTEPDHSQIANTKCPFSYVQI
LDDEEMVSPKNDAKSRPDCVNENQRKFVLGSNSSSPNKNAEDNLNVEPTEILNKADKTQKVEHRMSANFNTKSDGKQAKGGSQNVQAPKENYIRVQERRGRAANNHSLAE
RVRREKISERMKVLQQLVPGCNQITGKTVVLDEIINYVQSLQQQVEFLSMKLASVGLESSLETEQIRLTNNSYLSSSNVLCTRGENVNDPRSRTFHTSPHVMFQLHGTTP
TMPKTTSPQLSSLFKMKR