; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0008785 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0008785
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationchr06:3275602..3276327
RNA-Seq ExpressionPI0008785
SyntenyPI0008785
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-11187.55Show/hide
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        PCSG S RPP    +FHGQASASREPQMTLNDYLTMPPSLRS+SGA IDMAHFLPLHPLLA+PPPLPRTST NSMN QQNQ VA QRRQGNQ+RWNNG V
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        REVGG+PASEQQPPQDVIDL+SEENDCSSDGSEGLDLTLSL
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-1636.33Show/hide
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        MAFLL+ P              SFPW SS F KSS NPS  ++  TS ++S RP  RKN IFGAPCGLCGQ I  SE LNHH     L +      + S 
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               +   Q  P  S  F      S+ P  TL  +       +      +DMAH+LPLHPLLAQPPP   T                     N++R 
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Query:  NNGGVREVGGRPASEQQPPQDVIDLNSEENDCSSDGSEGLDLTLS
          G                       + EN+CSS GSE LDLTLS
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-7968.33Show/hide
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        L  LFFLT+FSPSL+FPW+SS + KS  NPS++++   SGE+S RP RRK+ IFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQN+LAS+G    P S SSQR
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Query:  PPLWSNYFHGQASASREPQMTLNDYLTMPP-----SLRSYSGAVIDMAHFLPLHPLLAQPPPLPRTSTANSMNRQQNQCVAGQRRQGNQVRWNNGGVREV
        PP+W++YFHGQASASREPQ+TLN+ LTMPP     SLRSY    +DMAH LPLHPLLAQPPP  R +TAN +N       AGQR QGNQ + NNGG R  
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          R A+EQ QP Q+VIDLNS EENDCSSDGS+GLDLTLSL
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]2.7e-11890.87Show/hide
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        M FLLQPPLFALFFLTSFSPSLSFP NSSSFG+SSSNPS+++M  TS ESSGRPSRRKN IFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQNELASF GHSN
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        P SG SQRPPLWSNYFHGQASASREPQMTLNDYLTMPPSLRSYSGA IDMAHFLPLHPLLAQPPPLPRTSTAN MN QQNQ VAG RRQGNQV+WNNGGV
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        REVGG+PASE+QPPQDVIDLNSEENDCSSD SEGLDLTLSL
Subjt:  REVGGRPASEQQPPQDVIDLNSEENDCSSDGSEGLDLTLSL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein1.3e-11890.87Show/hide
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        M FLLQPPLFALFFLTSFSPSLSFP NSSSFG+SSSNPS+++M  TS ESSGRPSRRKN IFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQNELASF GHSN
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        P SG SQRPPLWSNYFHGQASASREPQMTLNDYLTMPPSLRSYSGA IDMAHFLPLHPLLAQPPPLPRTSTAN MN QQNQ VAG RRQGNQV+WNNGGV
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        REVGG+PASE+QPPQDVIDLNSEENDCSSD SEGLDLTLSL
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein1.5e-11187.55Show/hide
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        PCSG S RPP    +FHGQASASREPQMTLNDYLTMPPSLRS+SGA IDMAHFLPLHPLLA+PPPLPRTST NSMN QQNQ VA QRRQGNQ+RWNNG V
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        REVGG+PASEQQPPQDVIDL+SEENDCSSDGSEGLDLTLSL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTTCCTCCTTCAACCTCCCCTGTTTGCTCTGTTTTTCCTCACATCCTTCTCTCCTTCTTTGTCTTTTCCATGGAATTCTTCCTCCTTTGGTAAATCAAGCTCCAA
CCCATCAATCGACGACATGTTTCTCACCTCCGGCGAGTCTTCCGGCAGGCCGTCTCGCCGGAAAAACATAATTTTTGGTGCCCCTTGTGGGCTCTGTGGTCAAGTGATTT
TTGGCTCTGAAGCTCTTAATCATCATTACAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCACTCTAATCCTTGCTCCGGTAGCTCTCAACGGCCACCG
TTATGGTCCAATTATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCACAAATGACGCTTAACGATTATTTGACGATGCCGCCGTCTTTGAGAAGCTATTCAGGCGCCGT
CATCGATATGGCTCACTTTCTTCCGCTTCATCCGTTGTTGGCTCAACCGCCGCCGCTGCCGCGAACCAGCACCGCCAATAGTATGAACCGTCAACAGAATCAGTGTGTGG
CAGGGCAGAGGAGGCAGGGAAACCAAGTCCGATGGAATAACGGCGGAGTGAGGGAAGTTGGTGGCCGGCCGGCATCAGAACAGCAGCCACCCCAAGATGTGATTGATCTG
AATAGTGAGGAGAATGATTGTAGCTCTGATGGTTCAGAAGGCTTGGATTTGACACTCAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCTTCCTCCTTCAACCTCCCCTGTTTGCTCTGTTTTTCCTCACATCCTTCTCTCCTTCTTTGTCTTTTCCATGGAATTCTTCCTCCTTTGGTAAATCAAGCTCCAA
CCCATCAATCGACGACATGTTTCTCACCTCCGGCGAGTCTTCCGGCAGGCCGTCTCGCCGGAAAAACATAATTTTTGGTGCCCCTTGTGGGCTCTGTGGTCAAGTGATTT
TTGGCTCTGAAGCTCTTAATCATCATTACAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCACTCTAATCCTTGCTCCGGTAGCTCTCAACGGCCACCG
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AATAGTGAGGAGAATGATTGTAGCTCTGATGGTTCAGAAGGCTTGGATTTGACACTCAGTCTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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