; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

PI0008880 (gene) of Melon (PI 482460) v1 genome

Gene IDPI0008880
OrganismCucumis metuliferus PI 482460 (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionTryptophan synthase
Genome locationchr05:19439406..19444925
RNA-Seq ExpressionPI0008880
SyntenyPI0008880
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0004834 - tryptophan synthase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002028 - Tryptophan synthase, alpha chain
IPR011060 - Ribulose-phosphate binding barrel
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel
IPR018204 - Tryptophan synthase, alpha chain, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057418.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]2.6e-16197.12Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MD VLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_004145375.1 tryptophan synthase alpha chain isoform X1 [Cucumis sativus]5.1e-16297.43Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MDIVLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSAL
        ENFTKSL SAL
Subjt:  ENFTKSLKSAL

XP_008449352.1 PREDICTED: tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Cucumis melo]1.0e-16297.44Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MD VLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

XP_022145935.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Momordica charantia]1.3e-15291.05Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNT-LIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGV
        MDI  NSSRL RFNKIP T LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS  GSDIIELGV
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNT-LIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

XP_038888258.1 tryptophan synthase alpha chain-like isoform X1 [Benincasa hispida]3.8e-15793.91Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MDI  NSSRL RFNKIP TLIFP HPCKISVFQ+KR VPMA+LTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS  GSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLA GTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFM+ IKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGAR SV++KVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV++WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTK+LKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LKV4 Tryptophan synthase2.5e-16297.43Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MDIVLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSAL
        ENFTKSL SAL
Subjt:  ENFTKSLKSAL

A0A1S3BMG6 Tryptophan synthase5.0e-16397.44Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MD VLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A5A7UQL8 Tryptophan synthase1.2e-16197.12Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MD VLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKE-VIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
        TTPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

A0A5D3E1Z9 Tryptophan synthase5.0e-16397.44Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP
        MD VLNSSRLF+FNKIP TLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTAS AVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS SGSDIIELGVP
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVP

Query:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
        YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGV+GLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT
Subjt:  YSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLT

Query:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
        TPTTP+DRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVS+WGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL
Subjt:  TPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKAL

Query:  ENFTKSLKSALS
        ENFTKSLKSALS
Subjt:  ENFTKSLKSALS

A0A6J1CVV7 Tryptophan synthase6.2e-15391.05Show/hide
Query:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNT-LIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGV
        MDI  NSSRL RFNKIP T LIFPPH CKISVFQ+KR  PMA++TAS AVGLSETF+KLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLS  GSDIIELGV
Subjt:  MDIVLNSSRLFRFNKIPNT-LIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGV

Query:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL
        PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGI NFM+TIKDAGV+GLV+PDVPLEETEILRKEAVKH+IELVLL
Subjt:  PYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLL

Query:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA
        TTPTTPKDRMKAIVEASEGF+YLVSSVGVTGARASVSN+VQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSA+VKLLGEA+SPEEGLK 
Subjt:  TTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKA

Query:  LENFTKSLKSALS
        LENFTKSLKSALS
Subjt:  LENFTKSLKSALS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B7JUK2 Tryptophan synthase alpha chain6.1e-8157.85Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+ F  L+++ + A IP+ITAGDPDL TTA+AL++L  SG+D+IELGVPYSDPLADGPVIQAAATR+L RG     ++ ++KEV PE+  PI LF+YYN
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVT
        PI  RG+  F+  +K AGV+GLVVPD+PLEE E L K A +  I + LL  PT+P +R++AI   S+GF+YLVS  GVTG R+ V+++V+ LL  ++  T
Subjt:  PILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        +KP+ VGFGISKPEH  QV NWGAD +IVGSAMVK L E  +PEEGLKA+  F + LK AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

O22765 Tryptophan synthase alpha chain4.7e-11880.22Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ KVQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

P42390 Indole-3-glycerol phosphate lyase, chloroplastic2.5e-8760.15Show/hide
Query:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN
        +S+T + L  +GK AFIPYITAGDPDL+TTAEAL++L   G+D+IELGVP SDP  DGP+IQA+  R+LA GT   A++ ML+EV PELSCP+ L SYY 
Subjt:  LSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYN

Query:  PILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVT
        PI+ R +      +K+AGV GL+VPD+P      L  EA  +N+ELVLLTTP  P+DRMK I +ASEGFVYLVS  GVTG RA+V+ +V++L++E+K+VT
Subjt:  PILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVT

Query:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
         KPVAVGFGISKPEHVKQ++ WGADG+I+GSAMV+ LGEA SP++GL+ LE + + +K+AL
Subjt:  EKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Q10W95 Tryptophan synthase alpha chain7.9e-8157.36Show/hide
Query:  VGLSETFSKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS
        + +S+ F  L+    + A IP+ITAGDPDL TTA+AL+VL  SG+++IELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGT   +++ +++ V P+L  PI LF+
Subjt:  VGLSETFSKLK-EQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFS

Query:  YYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIK
        YYNPIL RG+ NF+  I D G RGLVVPD+PLEE +IL + A    IEL LL  PT+PK+R+KAI   S+GF+YLVS  GVTG RA +  +V+ LL +++
Subjt:  YYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIK

Query:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS
        EVT+KP+ VGFGIS+PE   QV  WG+D +IVGSA+VK L E  SP+EGLKA+  F ++LK+A++
Subjt:  EVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS

Q42529 Tryptophan synthase alpha chain, chloroplastic5.6e-11977.34Show/hide
Query:  KRVVPMASL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KR  PMASL T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRVVPMASL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA

Query:  SVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        SVS KVQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ++ WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  SVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G54640.1 tryptophan synthase alpha chain4.0e-12077.34Show/hide
Query:  KRVVPMASL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK
        KR  PMASL T+SP +GL++TF++LK+QGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVL   GSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSL RGTN  +I+ ML 
Subjt:  KRVVPMASL-TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLK

Query:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA
        +V+P++SCPI+LF+YYNPILKRG+G FM +I+  GV+GLVVPDVPLEETE+LRKEA+ ++IELVLLTTPTTP +RMK IV+ASEGF+YLVSS+GVTGAR+
Subjt:  EVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARA

Query:  SVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        SVS KVQ+LL++IKE T+KPVAVGFGISKPEHVKQ++ WGADG+IVGSAMVKLLG+A+SP EGLK LE  TKSLKSAL
Subjt:  SVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL

AT4G02610.1 Aldolase-type TIM barrel family protein3.4e-11980.22Show/hide
Query:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI
        T S  VGLSETF++LK QGKVA IPYITAGDPDLSTTA+ALKVL + GSDIIELGVPYSDPLADGP IQAAA RSL +GTNF++IISMLKEVIP+LSCPI
Subjt:  TASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPVIQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPI

Query:  ALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLL
        ALF+YYNPIL+RG+ N+M  IK+AGV GL+VPDVPLEETE LR EA KH IELVLLTTPTTPK+RM AIVEASEGF+YLVSSVGVTG R SV+ KVQ+LL
Subjt:  ALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFVYLVSSVGVTGARASVSNKVQTLL

Query:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL
        ++IKE T KPVAVGFGISKPEHVKQV+ WGADG+IVGSAMVK+LGE++SPE+GLK LE FTKSLKSAL
Subjt:  EEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSAL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACATTGTTTTGAATTCTTCGAGGTTATTTCGATTCAACAAGATACCCAATACCCTTATCTTTCCCCCTCATCCTTGTAAGATTTCAGTCTTTCAATCCAAGCGGGT
TGTTCCAATGGCTTCCCTTACAGCTTCCCCTGCTGTAGGACTGTCTGAAACATTCAGCAAATTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGTG
ATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCACTGAAGGTTCTTTCCAATTCTGGATCAGATATAATCGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCCGTT
ATACAGGCTGCAGCAACTCGGTCCTTGGCTAGGGGTACAAACTTTAGTGCAATCATTTCTATGCTGAAGGAGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTC
ATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGAAACTTCATGTTGACAATAAAAGATGCTGGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAA
TTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGCTCTTAACTACACCAACCACGCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTA
TATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACCGGCGCCCGTGCATCAGTTAGCAATAAAGTTCAAACTCTCCTTGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGTAGG
ATTTGGTATATCAAAACCCGAGCACGTGAAACAGGTGTCTAACTGGGGGGCTGATGGTATCATAGTTGGTAGTGCTATGGTTAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTG
AAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCCCTCTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTAAACTAAACTAACAAAATTCACCATACCAAAAGAGTATTCAGCCGCCAAATTTTCTCCTCATGTTCTCTTCTTGTAAACCCTCGACCCGTCCAATCACTATAAGTTCA
TTTCCGGACAAAACTAAGAACGGCCCATTTGAGCTTTCCTTCACGTTTTGATAACTGCAGTCGTTGAAATTCGAAACTGAACTGCTCAGGTTCAATATAAGGTAAGATTT
CAATTTCTTTCCGTATTGAATTTGAAATCTTTTTTTTTTAACTATATTCATCTTTAATCGGACACAAAACCCATTTATCAATCCAAAATTCCATCAAACCTCACCTGTTT
TGCTTCAAATTTGAAACTCAGCGAATTCCCGACCGTATTTACCTCCCAAATGGACATTGTTTTGAATTCTTCGAGGTTATTTCGATTCAACAAGATACCCAATACCCTTA
TCTTTCCCCCTCATCCTTGTAAGATTTCAGTCTTTCAATCCAAGCGGGTTGTTCCAATGGCTTCCCTTACAGCTTCCCCTGCTGTAGGACTGTCTGAAACATTCAGCAAA
TTGAAGGAACAAGGCAAGGTTGCATTTATCCCCTACATCACTGCTGGTGATCCTGATCTTTCCACCACGGCTGAAGCACTGAAGGTTCTTTCCAATTCTGGATCAGATAT
AATCGAACTTGGTGTTCCGTATTCGGATCCCTTGGCAGATGGTCCCGTTATACAGGCTGCAGCAACTCGGTCCTTGGCTAGGGGTACAAACTTTAGTGCAATCATTTCTA
TGCTGAAGGAGGTTATTCCTGAACTGTCTTGCCCAATTGCCCTTTTTTCATACTATAACCCAATTCTTAAGCGTGGCATTGGAAACTTCATGTTGACAATAAAAGATGCT
GGTGTACGAGGGCTTGTTGTTCCGGATGTTCCTCTTGAGGAGACTGAAATTTTGAGAAAGGAAGCTGTAAAGCACAATATTGAGCTGGTGCTCTTAACTACACCAACCAC
GCCTAAAGATAGGATGAAAGCCATCGTTGAAGCTTCAGAGGGATTTGTATATCTTGTGAGCTCTGTTGGAGTTACCGGCGCCCGTGCATCAGTTAGCAATAAAGTTCAAA
CTCTCCTTGAGGAAATTAAAGAGGTAACAGAAAAACCAGTAGCAGTAGGATTTGGTATATCAAAACCCGAGCACGTGAAACAGGTGTCTAACTGGGGGGCTGATGGTATC
ATAGTTGGTAGTGCTATGGTTAAGCTGTTGGGTGAAGCCCAGTCTCCTGAAGAAGGATTGAAGGCACTTGAAAACTTCACCAAATCCTTAAAATCTGCCCTCTCCTGATA
AATTTTGAAGGTATAACTTAGGCTGTTCCTTTCATTTGTAAACAAGAGATCAACTAGGCTCTGTTACTGAAGCCTGCTAGTAGCTAACAACCATCTTTAAGTTTTACTTA
AAAGATTTCTTTTAGTTCTTTTAAAAGATTAAGACCGTCAGTTTATATTATCACAAGCATATTTTGTAGTGTTTTATTGGTAATGACTGGATGATGATTGAGAGAATAAT
ATTTCAAAGCCTTATTGCATAATCATTGTTAATGAAGCCTAACTTCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDIVLNSSRLFRFNKIPNTLIFPPHPCKISVFQSKRVVPMASLTASPAVGLSETFSKLKEQGKVAFIPYITAGDPDLSTTAEALKVLSNSGSDIIELGVPYSDPLADGPV
IQAAATRSLARGTNFSAIISMLKEVIPELSCPIALFSYYNPILKRGIGNFMLTIKDAGVRGLVVPDVPLEETEILRKEAVKHNIELVLLTTPTTPKDRMKAIVEASEGFV
YLVSSVGVTGARASVSNKVQTLLEEIKEVTEKPVAVGFGISKPEHVKQVSNWGADGIIVGSAMVKLLGEAQSPEEGLKALENFTKSLKSALS